100 likes | 383 Views
Markery asistovaná selekce - MAS. umožňuje aplikaci molekulární genetiky ve šlechtění zvířat; využívá informací o tzv. lokusech kvantitativních vlastností (QTL – quantitative traits loci), které významně ovlivňují projevy užitkových vlastností; QTL lze identifikovat pomocí vazby k markeru.
E N D
Markery asistovaná selekce - MAS • umožňuje aplikaci molekulární genetiky ve šlechtění zvířat; • využívá informací o tzv. lokusech kvantitativních vlastností (QTL – quantitative traits loci), které významně ovlivňují projevy užitkových vlastností; • QTL lze identifikovat pomocí vazby k markeru
QTL = místo na chromozómu (lokus), kde jsou lokalizovány geny ovlivňující kvantitativní vlastnost marker = úsek DNA nebo gen, který sám nevykonává žádnou funkci a je snadno zjistitelný laboratorními metodami vazba QTL – marker je tím silnější, čím blíže jsou na chromozómu QTL a marker umístěny
úplná vazba: • gen (Q, q) a marker (M, m) se předávají jako komplex; u potomků sledujeme vždy shodné kombinace jako u rodičů
neúplná vazba: • dochází k rekombinacím; u potomků se vyskytují nové kombinace marker - gen
možnost využití markeru jako selekčního kritéria úzce souvisí se sílou vazby • čím je vazba silnější, tím je selekce podle markeru přesnější • čím je vazba slabší, tím větší počet rekombinací může vznikat což negativně ovlivní přesnost selekce
Vztah markeru a užitkové vlastnosti představuje toto schéma:
Kroky MAS • vyhledání markeru • stanovení vazbové mapy • určení podílu proměnlivosti vysvětlené markerem σv2 • identifikace jedinců, kteří nesou žádoucí alelu a jejich využití ve šlechtění
Stanovení vztahu marker - QTL • je zpravidla vyjadřován matematicky na základě pravděpodobnostních počtů; • vazbu lze stanovit za předpokladu, pokud je narušena rovnováha vazeb mezi lokusy; • narušení rovnováhy lze dosáhnout křížením - v praxi omezené využití • vycházíme proto z rozdílů mezi rodinami.
Grandsire design (Weller et al. 1990) • metodický postup pro stanovení vztahu markeru a vlastnosti vypracovaný pro dojený skot; • v plánu pokusu vycházíme od dědů – heterozygotů (Qq) v daném markeru; • u jejich synů zařazených v inseminaci zjistíme alelupřenesenou od děda (Qxq); • potomstvo děda rozdělíme do podskupin podle přenesené alely; • syny vyhodnotíme podle užitkovosti dcer (kontrola dědičnosti); • rozdíly mezi průměrnými plemennými hodnotami mezi skupinami uvnitř dědů jsou způsobeny markerem.
Význam MAS • může přinést dodatečné zvýšení efektu selekce o 2-30%; • především představuje další selekční kritérium; • prozatím nelze počítat, že nahradí klasickou selekci založenou na principech populační genetiky; • může negativně ovlivnit odezvu na selekci u polygenů.