100 likes | 317 Views
Liefde, Licht en Bioinformatica. Eiwitmoleculen zijn de “werkpaarden” van ons lichaam Bioinformatici bestuderen deze eiwitmoleculen Belangrijke klasse van molekulen: GPCRs. Eiwitten & aminozuren. Een eiwit is een keten van aminozuren.
E N D
Liefde, Licht en Bioinformatica • Eiwitmoleculen zijn de “werkpaarden” van ons lichaam • Bioinformatici bestuderen deze eiwitmoleculen • Belangrijke klasse van molekulen: GPCRs ©CMBI 2005
Eiwitten & aminozuren • Een eiwit is een keten van aminozuren. • Er zijn 20 verschillende aminozuren. De volgorde van de aminozuren in de keten heet sequentie. • Een eiwit heeft een 3D-vouwing. ©CMBI 2005
GPCRs:G-eiwit gekoppelde receptoren • Familie van meer dan 1000 verschillende eiwitten. • Ze zitten in de membranen van onze cellen. • Ze vangen signalen op en geven die door naar de binnenkant van de cel; ze verzorgen de communicatie met de buitenwereld. ©CMBI 2005
GPCRs zijn o.a. betrokken bij: Proces Stimulus ©CMBI 2005
GPCRs en ziektebeelden • Bij veel ziektebeelden is een GPCR eiwit betrokken: • Kleurenblindheid • Allergieën • Alzheimer • Parkinson • Retinitis Pigmentosa • Meer dan 50% van alle bestaande medicijnen werkt dan ook op een GPCR eiwit! ©CMBI 2005
GPCR Structuur ©CMBI 2005
Zien en kijken • Het eiwit rhodopsine, een GPCR eiwit, is betrokken bij het proces van zien en kijken. • De rhodopsine moleculen bevinden zich in onze netvliezen, in de staafjes. • Zij worden geactiveerd door licht (fotonen). • Als een foton het eiwit rhodopsine raakt, volgt er een verandering in conformatie van dit eiwit. • Hierna bindt rhodopsine aan het G-eiwit en activeerthet. ©CMBI 2005
Zien en kijken (2) ©CMBI 2005
Retinal • Rhodopsine bevat het chromofoor 11-cis-retinal, dat door het foton wordt omgezet naar 11-trans-retinal. ©CMBI 2005
Eigenschappen van rhodopsine • We gaan kijken naar: 1) De DNA- en aminozuur volgorde van rhodopsine. • 2) de3D structuur van rhodopsine. • 3) een aantal van de mutaties in rhodopsine die retinitis pigmentosa (RP) veroorzaken. • Webpagina:http://www.cmbi.ru.nl/~vgelder/vwo/RP • Vragenboekje ©CMBI 2005