290 likes | 482 Views
ODBORNÁ PRAXE. Zuzana KAUEROVÁ 4. r. biochemie 2004/2005. A) ÚVOD. 1. POPIS LABORATOŘÍ Soukromé imunoanalytické a mikrobiologické laboratoře RNDr. Čecháček s. r. o. , Bratislavská 2, 604 70 Brno Oddělení: mikrobiologické, sérologické a imunoanalytické laboratoře.
E N D
ODBORNÁPRAXE Zuzana KAUEROVÁ 4. r. biochemie 2004/2005
A) ÚVOD 1. POPIS LABORATOŘÍ • Soukromé imunoanalytické a mikrobiologické laboratoře RNDr. Čecháček s. r. o. , Bratislavská 2, 604 70 Brno • Oddělení: mikrobiologické, sérologické a imunoanalytické laboratoře
Sérologie a imunoanalýza Imunokomplexní reakce – ELISA, EIA, RIA, KFR, aglutinace, hemaglutinace, precipitace, Western Blott PCR s elektroforetickou detekcí Detektory fotometrické, fluorimetrické, luminometrické, radioaktivní Mikrobiologie Gynekologické materiály, hemokultury, moč, stolice, punktát, rány, sputum, výtěry, vyšetření sterility, mykologie. 2. ČINNOST LABORATOŘÍ
B) SÉROLOGIE • STANOVENÍ ANTI – HAV (IgM) V LIDSKÉM SÉRU METODOU ELISA • kvalitativní detekce protilátek (Ab) IgM in vitro proti viru hepatitidy A, indikace akutní infekce od staré • ELISA – enzymová imunoanalýza, princip dvojitého sendviče (firma Murex), detekce fotometricky
1.1 POSTUP PŘI PRÁCI • 100x naředění vzorku (1 ml konjugátu + 10 μl vzorku) • Pipetáž do stripu po 100 μl
Inkubace 60 minut při teplotě 37 °C • Promytí jamek 5x na automatické promývačce • Přidat po 100 μl konjugátu, 60 minut inkubace • Přidat stejné množství substrátového roztoku, inkubace 30 minut => barevná změna na modrozelenou • Zastavení reakce 1M kyselinou sírovou, proměření ve spektrofotometru
1.2 VÝSLEDKY • řazeno dle pořadí ve stripu, poslední tři hodnoty bez vzorku • naměřené absorbance:
1.3 VYHODNOCENÍ • Výpočet hodnot absorbance negativních kontrol: A = (0,092 + 0,104) : 2 = 0,098 •CUT OFF rovno součtu průměru absorbance neg. Kontrol a hodnoty 0,2: X = 0,2 + 0,098 = 0,298
•hodnoty naměřené u pacienta:0,087 ; 0,102; • Naměřené hodnoty pacienta jsou srovnatelné s negativními kontrolami –VZOREK Č. 79910 BYL NEGATIVNÍ •diagnostická senzitivita Murex anti – HAV (IgM) testu se odhaduje na 98,8 % s intervalem spolehlivosti 96,4 – 99,68 %.
2. STANOVENÍ DNA CYTOMEGALOVIRU (CMV) in vitro V MOČI NEBO SÉRU • Indikace onemocnění způsobeného napadením organizmu CMV (herpetické viry) • Stanovení především u těhotných (poškození plodu) • Metoda PCR – Polymere Chain Reaction – enzymatická syntéza sekvencí DNA za využití syntetických oligonukleotidových primerů, které jsou komplementární s hledanou cílovou sekvencí na obou vláknech DNA • Identifikace DNA gelovou elektroforézou
2.1 POSTUP PŘI PRÁCI a) Separace soupravou Chemagen Biopolymer – Technologie CMV (Elisabeth Farmacon s. r. o.) extrakcí na magnetických partikulích • Lýza buněk, denaturace nepotřebných bílkovin enzymem proteázou • Navázání DNA na magnetické partikule, odstranění denaturovaných bílkovin a vazba DNA na eluční pufr (principem změna pH a tím i afinity) => uvolnění DNA
b) Vlastní PCR • Aplikace specifického primeru v tzv. amplifikaci – dvoufázový cyklus teplot 94 °- 60 °- 72 °C v thermocykleru: • 94 °C – denaturace (rozdvojení) vlákna DNA • 60 °C – zmnožení sekvencí DNA aktivací primeru • 72 °C – aktivace termostabilní DNA – polymerázy, která doplní komplementární dvojice dvoušroubovice
c) Imunoelektroforéza • Nalití agarózového gelu s malým množstvím barevného indikátoru (ethidiumbromid, viditelný pod UV – zářením, koncentrace 2,5 μl/50 ml), po zchladnutí vytvořit zářezy. • Umístění markerů do zářezů, dále vzorky a pozitivní a negativní kontroly. Spustí se zdroj napětí => elektroendoosmóza, difúze vzorků. • Po 45 minutách vyhodnocení.
Poloha vzorků na elektroforeogramu se ve všech případech blíží negativním kontrolám, všechny vzorky jsou NEGATIVNÍ
C) MIKROBIOLOGIE • ANALÝZA VÝTĚRU Z KRKU •Odběr při podezření na infekční onemocnění horních cest dýchacích – tonzilitidách a akutních zánětech hrtanu • akutní tonzilitidy – rhinoviry, koronaviry, adenoviry, EB – viry, coxsackviry • akutní záněty hltanu – Streptococcus pyogenes, Str. pneumoniae, Haemophillus influenzae, Staphylococcus aureus, Neisseria meningitis
1.1 MATERIÁL • Výtěr z krku pacienta (6 – ti leté dítě, podezření na akutní tonzilitidu) • Půdy: • Krevní agar (KA) • Endův agar (EA) • NaCl – agar (NaCl) • Miller – Hüntenova půda (MHA)
1.2 ZPRACOVÁNÍ • Vyočkování tamponu se vzorkem na KA, EA a NaCl (křížová metoda) • Inkubace 24 hodin při teplotě 37 ° • Analýza primokultury: => šedobílé drobné kolonie, satelitní růst – podezření na rod Haemophillus • bělavé mukózní kolonie, β – hemolýza (neúplná) – podezření na rod Staphylococcus • Nažloutlé kolonie s hemolýzou α – podezření na rod Streptococcus
•znovu pomnožit na KA s druhem Staphylococcus aureus, vložit disky se streptomycinem (S) a bacitracinem (BAC), inkubace 24 h při 37 °C •Analýza pomnožené kultury: • Stafylokok neurčeného druhu silná β – hemolýza , kolem BAC zóna inhibice • Kolem zlatého stafylokoku růst velkého množství rodu Haemophillus, malé, tužší bílé kolonie • Streptokok α hemolýza, zóna inhibice kolem disku s S
1.3 VYHODNOCENÍ • Identifikace druhu Streptococcus • testy na polysacharidovou substanci C pomocí latexové aglutinace • pozitivní reakce nastala u typu A => druh Streptococcus pyogenes
b) Identifikace druhu Staphylococcus • test na katalázu a latexová aglutinace k průkazu plazmakoagulázy • test na katalázu silně pozitivní, plazmakoaguláza pozitivní => druh Staphylococcus aureus
c) Identifikace druhu Haemophillus • Naočkování kolonie na MHA, vložit disky s faktory V, X a VX; inkubace 24 h při 37 °C • Po inkubaci na agaru růst kolonií kolem faktoru VX a X => druh Haemophillus influenzae Z testů plyne, že pacient je nakažen těmito mikroorganizmy: Staphylococcus aureus Streptococcus pyogenes Haemophillus influenazae Doporučuje se antibiotiková léčba.
2. ANALÝZA GYNEKOLOGICKÉHO POŠEVNÍHO VÝTĚRU •nejčastěji výtěry z pochvy, cervix, plodová voda, sperma, gynekologické rány, stěry z glans penis, mateřské mléko apod. • vyšetření při podezření na zánětlivá onemocnění pochvy, způsobená kvasinkami, gardnerelami, mykoplazmaty atd.
2.1 MATERIÁLY • Gynekologický materiál – v tomto případě výtěr z pochvy • Půdy: • Krevní agar (KA) • Krevní agar s amikacinem (KA – A) • Krevní agar s vysokým procentem soli (NaCl) • Endův agar (EA) • Selektivní půda pro rod Gardnerella (GAR) • Dvě půdy na mykoplazmata
2.2 ZPRACOVÁNÍ • Nátěr, tzv. „MOP“, barvený dle Gramma a Giemsy V obou preparátech pouze rod Lactobacillus – přirozená mikroflóra - geometrické tvary, tzv. „döderleiny“
•Analýza kolonií na půdách: • KA – A: drobné bílé kolonie s rozsáhlou hemolýzou – rod Lactobacillus • EA: žádné kolonie (nepřítomnost enterokoků) • NaCl: žádné kolonie (nepřítomnost Streptococcus agalactiae) • GAR: žádné kolonie • Test na mykoplazmata: ani po 48 hodinách žádná barevná změna - negativní
2.3 VYHODNOCENÍ • VÝTĚR FYZIOLOGICKÝ, BEZ ZNÁMEK PATOGENITY.