1 / 10

Populace využívané k mapování F 2 znak dominantní 3:1 znak kodominantní 1:2:1 B 1 1:1

Populace využívané k mapování F 2 znak dominantní 3:1 znak kodominantní 1:2:1 B 1 1:1 Dihaploidní linie – homozygotní materiál Rekombinantní inbrední linie (RIL) Blízké izogenní linie (NIL) Znaky kvalitativní x znaky kvantitativní Velikost populace

blythe-blackburn
Download Presentation

Populace využívané k mapování F 2 znak dominantní 3:1 znak kodominantní 1:2:1 B 1 1:1

An Image/Link below is provided (as is) to download presentation Download Policy: Content on the Website is provided to you AS IS for your information and personal use and may not be sold / licensed / shared on other websites without getting consent from its author. Content is provided to you AS IS for your information and personal use only. Download presentation by click this link. While downloading, if for some reason you are not able to download a presentation, the publisher may have deleted the file from their server. During download, if you can't get a presentation, the file might be deleted by the publisher.

E N D

Presentation Transcript

  1. Populace využívané k mapování F2 znak dominantní 3:1 znak kodominantní 1:2:1 B1 1:1 Dihaploidní linie – homozygotní materiál Rekombinantní inbrední linie (RIL) Blízké izogenní linie (NIL) Znaky kvalitativní x znaky kvantitativní Velikost populace Počet DNA markerů pro zachycení vazby

  2. RIL (recombinant isogenic lines) rekombinantní linie  časová náročnost  vysoká homozygotnost Křížení polymorfních (fenotypově kontrast- ních) linií X F1 F250,0% F375,0% F487,5% F593,8% F696,9% F798,7% F899,5%

  3. NIL (near isogenic lines) izogenní linie • časová náročnost – vytvoření F1 + 6 x BC, selekce na daný gen (znak) v každé generaci  vysoká homozygotnost, rozdíl jen v lokusu konkrétního genu a jeho okolí  polymorfismus (DNA) mezi NIL s vysokou pravděpodobností souvisí s vazbou marker-gen P1 Donor B1 B2 B7 X 12,5% P1 25% P1 0,42% P1 P2 Recipientní rodič

  4. BSA (bulk segregant analysis) • rychlá příprava kontrastních skupin genotypů z F2 generace • dominance, recesivita RezistentníSegregujícíNáchylné F2 BSA Rodič R Rodič S F1R-Bulk S-Bulk RIL RezistentníNáchylné

  5. Řešený problém a výchozí stav • Hordeum vulgare • Padlí ječmene • Šlechtění odolných odrůd • Významné zdroje genů odolnosti jsou plané ječmeny – H. vulgare ssp. spontaneum, H. bulbosum • zdroje odolnosti ječmene (H.vulgare ssp. spontaneum) k padlí ječmene původce Blumeria graminis f. sp. hordei v ČR i celosvětově jedna ze závažných chorob ječmene

  6. Genetické aspekty choroby Rostlina (hostitel)Patogen genom 1genom 2 geny odolnosti R genyavirulence Avr většinou dominant alela dominantní protein 1protein 2=elicitor Aktivace mechanismů odolnosti interaction rozpoznání

  7. geny R konceptgen – proti – genu • Mají schopnost detekovat (rozpoznat) patogena • Mají schopnost aktivovat obranné mechanismy

  8. Cíle řešení • Zjistit charakter dědičnosti nových zdrojů • odolnosti ječmene k padlí ječmene • 2. Lokalizovat zjištěné geny odolnosti v genomu • ječmene pomocí DNA markerů • 3. Vyvinout molekulární markery alespoň pro • některé ze zjištěnýchgenů odolnosti

  9. Strategie řešení 1.Vytvoření vhodných populací pro analýzy odrůda ´Tiffany´x zdroj odolnostiF2 2. Fytopatologické testy – P, F1, F2 3. Genetická analýza Určení počtu genů determinujících odolnost 4. Získání DNA markerů pro ječmen H. vulgare Určení polymorfismu rodičů 5. Určení DNA markerů ve vazbě s jednotlivými geny odolnosti Analýza bulků – náchylného a odolného Lokalizace genů na chromozomech ječmene

  10. Mapa SSR markerů ječmene využívaných v laboratoři

More Related