1 / 18

Karolina Makieła dr hab. Piotr Jonczyk

Krajowa Sieć Informacji o Bioróżnorodności spotkanie sprawozdawcze Warszawa 13.XII.2008 CENTRALNA KOLEKCJA SZCZEPÓW „ColIBB” INSTYTUT BIOCHEMII I BIOFIZYKI PAN Pawińskiego 5A, 02-106 Warszawa. Karolina Makieła dr hab. Piotr Jonczyk. 2000 r utworzenie kolekcji IBB 2003 r włączenie do KSIB

chavi
Download Presentation

Karolina Makieła dr hab. Piotr Jonczyk

An Image/Link below is provided (as is) to download presentation Download Policy: Content on the Website is provided to you AS IS for your information and personal use and may not be sold / licensed / shared on other websites without getting consent from its author. Content is provided to you AS IS for your information and personal use only. Download presentation by click this link. While downloading, if for some reason you are not able to download a presentation, the publisher may have deleted the file from their server. During download, if you can't get a presentation, the file might be deleted by the publisher.

E N D

Presentation Transcript

  1. Krajowa Sieć Informacji o Bioróżnorodności spotkanie sprawozdawczeWarszawa 13.XII.2008CENTRALNA KOLEKCJA SZCZEPÓW „ColIBB” INSTYTUT BIOCHEMII I BIOFIZYKI PAN Pawińskiego 5A, 02-106 Warszawa Karolina Makieła dr hab. Piotr Jonczyk

  2. 2000 r utworzenie kolekcji IBB • 2003 r włączenie do KSIB • Zbiór unikalnych szczepów skonstruowanych przez pracowników i studentów IBB • Zbiór szczepów wyizolowanych ze środowiska • Zbiór szczepów referencyjnych do badań fagów http://kolekcja.ibb.waw.pl/

  3. KSIB - ColIBB • Zakup materiałów niezbędnych do deponowania i przechowywania szczepów bakteryjnych i drożdżowych: raków, pudełek i fiolek kriogenicznych, także sprzętu komputerowego, zasilacza UPS • Informatyk, opiekun kolekcji

  4. CENTRALNA KOLEKCJA SZCZEPÓWIBB PAN „ColIBB”

  5. CENTRALNA KOLEKCJA SZCZEPÓWIBB PAN „ColIBB” • KOLEKCJA SZCZEPÓW BAKTERYJNYCH2891 REKORDY • KOLEKCJA SZCZEPÓW DROŻDŻOWYCH • 3479 REKORDY • (117 w przygotowaniu) • KOLEKCJA PLAZMIDÓW1676 REKORDY • (300 w przygotowaniu) • KOLEKCJA BAKTERIOFAGÓW • IZOLATY ŚRODOWISKOWE29 REKORDÓW (271 rekordów w przygotowaniu) Euroscarf

  6. KOLEKCJA SZCZEPÓW BAKTERYJNYCH • ZBIÓR MUTANTÓW W GENACH ZAANGAŻOWANYCH W SZEREG PROCESÓW KOMÓRKOWYCH replikacja DNA metabolizm komórkowy np. metabolizm siarkowy segregacja chromosomów w bakteriach G+ G- segregacja plazmidów • ZBIÓR SZCZEPÓW WYKORZYSTYWANYCH DO KONSTRUKCJI SZEREGU MUTANTÓW I MAPOWANIA MUTACJI kolekcja szczepów niosących transpozony w różnych miejscach na chromosomie

  7. KOLEKCJA SZCZEPÓW BAKTERYJNYCH • SZCZEPY STOSOWANE W PRODUKCJI PREPARATÓW FARMACEUTYCZNYCH • Lactobacillus rhamnosus, Streptococcus equisimilis • ZBIÓR SZCZEPÓW BAKTERII MLEKOWYCH • LABORATORYJNE SZCZEPY BAKTERII PATOGENNYCH Staphylococcus aureus • ZBIÓR SZCZEPÓW – LIZOGENÓW BAKTERIOFAGÓW P1, P7, Lambda

  8. Lactococcus cremoris Lactococcus garvieae Lactococcus hordniae Lactococcus lactis ok.1000 Lactococcus raffinolactis Salmonella typhimurium Staphylococcus aureus Streptococcus agalactiae Streptococcus bovis Streptococcus equisimilis Streptococcus thermophilus Bacillus subtilis ok.100 Bifidobacterium longum Enterococcus faecalis Escherichia coli ok.1000 Lactobacillus sp. Lactobacillus casei Lactobacillus paracasei Lactobacillus plantarum Lactobacillus rhamnosus

  9. KOLEKCJA SZCZEPÓW DROŻDŻOWYCH • ZBIÓR MUTANTÓW W GENACH ZAANGAŻOWANYCH W SZEREG PROCESÓW KOMÓRKOWYCH • replikacja DNA • naprawa DNA • segregacja chromosomów w komórkach drożdżowych • transport wewnątrzkomórkowy • regulacja transkrypcji cytoplazmatycznej (POL III RNA) • translacja mitochondrialna • inne

  10. KOLEKCJAPLAZMIDÓW • PLAZMIDY NIOSĄCE SKLONOWANE GENY, SŁUŻĄCE DO BADANIA RÓŻNYCH PROCESÓW KOMÓRKOWYCH • replikacja DNA • naprawa DNA • segregacja plazmidów • transport wewnątrzkomórkowy • segregacja chromosomów (Pseudomonas aeruginosa) • PLAZMIDY NIOSĄCE FRAGMENTY GENOMÓW BAKTERIOFAGÓW P1 I P7 • PLAZMIDY NIOSĄCE FRAGMENTY PLAZMIDÓW KLINICZNYCHO SZEROKIM SPECTRUM OPORNOŚCI • WEKTORY LINIOWE • WEKTORY EKSPRESYJNE

  11. KOLEKCJA IZOLATÓW ŚRODOWISKOWYCH • Izolaty z terenów skażonych z okolic kopalni: Złoty Stok, Szklary, Olkusz • Grupa bakterii niewrażliwych na wysokie stężenie Arsenu – izolowane z terenów kopalni (woda, skały, osady) – tworzą maty i biofilmy • Grzyby – izolowane z nieczynnej kopalni Złoty Stok • Charakterystyka izolowanych szczepów, dane geograficzne, dokumentacja fotograficzna

  12. Paracoccus marcusii Pseudomonas sp. Rhodococcus sp. Sinorhizobium sp. Shewanella sp. Sphingomonas sp. Stenotrophomonas sp. Streptomyces sp. Serratia grimesii Aeromonas sp. Arthrobacter sp. Bacillus sp. Brevundimonas sp. Chryseobacterium sp. Microbacterium sp. Micrococcus sp.

  13. KOLEKCJA BAKTERIOFAGÓW • Unikalna kolekcja bakteriofagów bakterii mlekowych, enterobakterii i gronkowców • Badania nad genomiką i biologią fagów umożliwią wykorzystanie ich potencjału bakteriotoksycznego i przemysłowego • Wymagająca nowych rozwiązań deponowania i przechowywania

  14. W PLANACH • Przebudowa bazy danych usprawniająca wprowadzanie i wyszukiwanie danych • Współtworzenie sieci informacji o referencyjnych szczepach bakteriofagowych oraz bakteriofagach • Rozbudowa bazy danych dotyczących Bakteriofagów (współpraca z Siecią Biologii i Biotechnologii Bakteriofagów) oraz Izolatów Środowiskowych

  15. Dziękuję za uwagę

More Related