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DNA-Mustererkennung

DNA-Mustererkennung. Am Beispiel verschiedener b -Globin-Gene Bestimmung der Ähnlichkeit von b -Globin-Genen verschiedener Arten. DNA-KARTIERUNG mit mehreren Restriktionsenzymen. DNA-Kartierung: Verschiedene b -Globin-DNAs im Vergleich. 1.

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  1. DNA-Mustererkennung Am Beispiel verschiedener b-Globin-Gene Bestimmung der Ähnlichkeit von b-Globin-Genen verschiedener Arten. DNA-KARTIERUNG mit mehreren Restriktionsenzymen Dr. Hauke  Holtorf / LS Stuttgart

  2. DNA-Kartierung: Verschiedene b-Globin-DNAs im Vergleich 1 1 444 Bp 1 376 Bp 1 354 Bp 1 444 Bp Kann ein Vergleich der DNA-Sequenzen der b-Globine Aufschluss über die Verwandtschaftverhältnisse der Arten geben ? Homo sapiens Mensch Pan troglodytes Schimpanse Gorilla gorilla Gorilla Xenopus tropicalis Krallenfrosch Dr. Hauke  Holtorf / LS Stuttgart

  3. DNA-Kartierung: Verschiedene b-Globin-DNAs im Vergleich 2 Erkennen und Kartieren verschiedener Restriktionsschnittstellen. Auswahl der Restriktionsenzyme: AccI , BamHI , BseRI , BstXI , DraIII , EcoRI - Bearbeitung mit ApE-Software - Dr. Hauke  Holtorf / LS Stuttgart

  4. DNA-Kartierung: Verschiedene b-Globin-DNAs im Vergleich 3 Erkennen und Kartieren verschiedener Restriktionsschnittstellen. Beispiel: menschliche Beta-Globin-DNA - Bearbeitung mit ApE-Software - Dr. Hauke  Holtorf / LS Stuttgart

  5. DNA-Kartierung: Verschiedene b-Globin-DNAs im Vergleich 4 Erkennen und Kartieren verschiedener Restriktionsschnittstellen. Beispiel: menschliche und tierische Beta-Globin-DNA - Bearbeitung mit ApE-Software - Dr. Hauke  Holtorf / LS Stuttgart

  6. DNA-Kartierung: Verschiedene b-Globin-DNAs im Vergleich 5 - ApE-Maps, farbige Hervorhebung der einzelnen RE-Erkennungsregionen- Mensch Schimpanse Gorilla Krallenfrosch Dr. Hauke  Holtorf / LS Stuttgart

  7. DNA-Kartierung: Verschiedene b-Globin-DNAs im Vergleich 6 - Auswertung - Eine aussagekräftige Auswertung sollte folgende Werte mit einschließen: a) Anzahl der verschiedenen Restriktionsorte b) Position der verschiedenen Restriktionsorte c) Abstand in Basenpaaren (Bp) zwischen den verschiedenen Restriktionsorten Dr. Hauke  Holtorf / LS Stuttgart

  8. DNA-Kartierung: Verschiedene b-Globin-DNAs im Vergleich 7 - Auswertung mit Dot-Plots - a) Die Anzahl der Restriktionsschnittstellen von Mensch und Schimpanse im Vergleich. Dr. Hauke  Holtorf / LS Stuttgart

  9. DNA-Kartierung: Verschiedene b-Globin-DNAs im Vergleich 8 a) Die b-Globin-DNA des Menschen im Vergleich mit Schimpanse, Gorilla und Krallenfrosch. Die b-Globin-DNA des Menschen weist mit der DNA von Schimpanse und Gorilla mehr Ähnlichkeiten im Sequenzmuster auf, als mit der DNA des Krallenfrosches. Derartige Analysen lassen Rückschlüsse auf Verwandtschaftsverhältnisse zu. Dr. Hauke  Holtorf / LS Stuttgart

  10. DNA-Kartierung: Verschiedene b-Globin-DNAs im Vergleich 9 b) Die verschiedenen Positionen der einzelnen Restriktionsorte im Vergleich Die b-Globin-DNA des Menschen weist mit der DNA vom Gorilla die meisten identischen Positionen auf. Dr. Hauke  Holtorf / LS Stuttgart

  11. DNA-Kartierung: Verschiedene b-Globin-DNAs im Vergleich 10 c) Der Abstand zwischen den verschiedenen Restriktionsorten im Vergleich Die b-Globin-DNA des Menschen weist mit der DNA von Gorilla und Schimpanse die meisten identischen Abstände zwischen Restriktionsorten auf. Dr. Hauke  Holtorf / LS Stuttgart

  12. DNA-Kartierung: Verschiedene b-Globin-DNAs im Vergleich 11 Die Summe der Übereinstimmungen mit dem b-Globin-DNA des Menschen aus den drei Dot-Plot-Analysen lässt Rückschlüsse auf die Ähnlichkeit der Sequenzen zu. Bewertung der Dot-Plots Homo sapiens Mensch Pan troglodytes Schimpanse Die b-Globin-DNA des Menschen weist die meisten Ähnlichkeiten mit der DNA vom Gorilla auf; dicht gefolgt von der DNA des Schimpansen. Die DNA des Krallenfrosches weist am wenigsten Ähnlichkeit mit der b-Globin-DNA des Menschen auf. Gorilla gorilla Gorilla Xenopus tropicalis Krallenfrosch Dr. Hauke  Holtorf / LS Stuttgart

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