1 / 24

Travail de Génétique

L’utilisation des informations du pedigree pour gérer la variabilité génétique d’une population en danger : L’élevage du mouton Xalda en Asturies en est un exemple. Travail de Génétique. Introduction. L’élevage de Xalda: - en danger de disparition

cutter
Download Presentation

Travail de Génétique

An Image/Link below is provided (as is) to download presentation Download Policy: Content on the Website is provided to you AS IS for your information and personal use and may not be sold / licensed / shared on other websites without getting consent from its author. Content is provided to you AS IS for your information and personal use only. Download presentation by click this link. While downloading, if for some reason you are not able to download a presentation, the publisher may have deleted the file from their server. During download, if you can't get a presentation, the file might be deleted by the publisher.

E N D

Presentation Transcript

  1. L’utilisation des informations du pedigree pour gérer la variabilité génétique d’une population en danger : L’élevage du mouton Xalda en Asturies en est un exemple. Travail de Génétique

  2. Introduction • L’élevage de Xalda: - en danger de disparition - Coefficient de consanguinité élevé  Que faire pour la sauvegarde de l’espèce?

  3. Introduction • Le paramètre F: - mesure de l’identité entre allèles - probabilité d’obtenir des gènes identiques (%)  mesure le taux de pertes de variabilité génétique

  4. Introduction • Taille de la population:  Influence très fort la variabilité génétique (fixation des gènes)  Choix de reproducteur limités  gènes ne sont plus tirés au sort  dérive génétique dans un sens.

  5. Introduction • Pour maintenir la variabilité: il est nécessaire de monitorer en utilisant un ens. de paramètres caractérisant: - structures de la population - pratique de gestion • Les xaldas est un exemple représentatif au niveau des études pour la conservation de la génétique animale developpée en Europe

  6. Matériel - Analyse de l’information des pedigree de l’association des éleveurs de moutons Xalda ( ACOXA) de 1992 à 2001. - 9 lignées - 805 moutons enregistrés - 562 vivants dont 507 femelles - Population très jeune

  7. Méthodes • Différents paramètres utilisés: - Ne : Nombre efficace en fonction du nombre de mâles et de femelles utilisés. Ne= 4(NmNf)/(Nm+Nf)

  8. Méthodes • Différents paramètres utilisés: - Le paramètre F:  mesure de l’identité entre allèles  probabilité d’obtenir des gènes identiques (%)  mesure le taux de pertes de variabilité génétique

  9. Méthodes • Différents paramètres utilisés: - Le paramètre F: DF= 1/(2Ne)

  10. Méthodes • Différents paramètres utilisés: -AR:  Coefficient moyen de non-relation  Indique la contribution génétique à la population

  11. Méthodes • Différents paramètres utilisés: -AR: Utilisées comme:  index pour maintenir le stock génétique initial  comparer la consanguinité au sein d’une sous population

  12. Méthodes • Différents paramètres utilisés: -AR: Calcul du coefficient pour un fondateur: 1→ Pour le fondateur (car il appartient à la population) 1/2→ Par fils du fondateur (dans la population) 1/4→ Par petit fils du fondateur (dans la population)

  13. Résultats et discussion • Utilisation abusive de certains individus => ↓ de la variabilité génétique • Nombre très faibled’ancêtre → race rencontre un d° de selection de la part des éleveurs qui utilisent massivement un nombre réduit de reproducteur (choisit sur la conformation)

  14. Résultats et discussion • Intervalle de génération moyen réduit : 3 ans - voie père-fils : courte (relève) - voie mère-filles : longue (attente de voir ses résultats) • 13 ancêtres  50% de la variabilité génétique

  15. Résultats et discussion • La moyenne des F de la population: 1,762% (faible) Mauvaise estimation: il n’y a que 7 générations, pedigree top court • Ne sera donc mal estimé de part la formule • F n’est donc pas un bon indicateur de perte de gènes.

  16. Résultats et discussion • AR peut-être utilisé comme complément pour estimer la consanguinité dans une population: - évalue la contribution génétique des fondateurs - évalue la représentation génétique de chaque individu qui n’est pas fondateur

  17. Résultats et discussion • AR est utilisé indirectement pour caractériser les troupeaux comme représentation de la population

  18. Résultats et discussion

  19. Conclusions • Manque d’infos sur la taille de la pop  sous estimation nb d’individus consanguins mais hauts coef. d’inbreeding  pas possible d’utiliser les paramètres habituels  utilisation de nouveaux paramètres • Usage abusif de certains individus aux dépends d’autres

  20. Conclusions • Utilisation de l’AR • Infos sur la description de la pop. et du management • Plus facile à calculer et à comprendre par les éleveurs

  21. Conclusions • En pratique • Calcul de l’AR pour chaque individu après la saison des naissances • Favoriser certains accouplements • Égaliser la représentation génétique des différentes lignées et troupeaux

  22. Conclusions • Sélection des béliers ayant l’AR le plus bas possible • Sélection des mères à béliers sur leur conformation parmi les moins représentées génétiquement

  23. Bibliographie • GOYACHE F., GUTTIERREZ J.P., FERNANDEZ I., GOMEZ E., ALVAREZ I., DIEZ J., ROYO L.J., Using pedigree to monitor genetic variability of endangered populations : the Xalda sheep breed of Asturias as an example, J. Anim. Breed. Genet., 120 : 95-105 (2002)

  24. Merci de votre attention

More Related