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Assessment of Long-Term Forest Dynamics in the Caribbean Database and Metadata Concepts

Assessment of Long-Term Forest Dynamics in the Caribbean Database and Metadata Concepts. Morning Introduction to the Workshop, Vision and Objectives Implementation of the Forest Inventory Program Database Concepts Mid-morning Examples of Caribbean Permanent Plots Afternoon

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Presentation Transcript


  1. Assessment of Long-Term Forest Dynamics in the Caribbean Database and Metadata Concepts Morning • Introduction to the Workshop, Vision and Objectives • Implementation of the Forest Inventory Program • Database Concepts Mid-morning • Examples of Caribbean Permanent Plots Afternoon • Examples of Data Analyses • Data Sharing and Regional Synthesis, Working Group Themes • Identifying Forest Research Sites and Plots in the Caribbean; using Caribbean Foresters website • Exhibition and Discussion of Country Report Posters

  2. Assessment of Long-Term Forest Dynamics in the Caribbean Database and Metadata Concepts • Conceptos básicos sobre bases de datos • Conceptos básicos sobre metadata Créditos y Agradecimientos http://www.ecoinformatics.org

  3. Assessment of Long-Term Forest Dynamics in the Caribbean Database and Metadata Concepts • ¿Que es una base de datos? • Existen diferentes definiciones, dependiendo del contexto. Para efectos prácticos la podemos definir: • Base de datos:    - Es una colección de archivos interrelacionados, creados por un programa especial conocido como “data base management system” (DBMS) • Estos archivos pueden contener una o mas tablas que guardan datos en una manera estructurada en forma de tablas: • Es una serie o grupo de tablas • Estas tablas se relacionan entre si • Utiliza un lenguaje de comandos para búsquedas

  4. Assessment of Long-Term Forest Dynamics in the Caribbean Database and Metadata Concepts • Las tablas consisten en una serie de columnas (Campos) que representan una característica de un individuo u objeto. • Cada fila o Registro (colección de campos de iguales o de diferentes tipos) ofrece una descripcion del objeto o individuo. •  La tabla es una colección de registros almacenados siguiendo una estructura homogénea.

  5. Assessment of Long-Term Forest Dynamics in the Caribbean Database and Metadata Concepts - Las bases de datos ofrecen un control explicito sobre los tipos de datos (columnas) Ejemplo: • Provee • Exactitud • Control de calidad • Desempeño • Facilita el uso

  6. Assessment of Long-Term Forest Dynamics in the Caribbean Database and Metadata Concepts Se establecen relaciones explicitas o implícitas entre las tablas Existe o se crea una “clave única” o “clave primaria” (primary key) para relacionar las tablas. Esto permite hacer búsquedas y re-organizar datos de manera rápida y fácil

  7. Assessment of Long-Term Forest Dynamics in the Caribbean Database and Metadata Concepts Características de los Datos Ecológicos Imágenes de Satélite Alta SIG Estaciones Meteorológicas La mayoría de los datos ecológicos Volumen de datos (por set de datos) Datos Empresariales, Administrativos Censos de Biodiversidad Productividad Primaria La mayoría de los programas Datos Poblacionales Datos de Suelos Secuencias Genómicas Baja Alta Requerimientos de Metadata/Complejidad

  8. Assessment of Long-Term Forest Dynamics in the Caribbean Database and Metadata Concepts Programas de “Spreadsheets” (como Excel) • Lo bueno • Son usados comúnmente • Son fácil de aprender • Por lo general están instalados en la mayoría de las computadoras • Lo no tan bueno • Puede promover malos hábitos de uso, generando datos que no pueden ser usados fácilmente • No permiten análisis muy complejos • Es difícil “auditarlos”, es decir, ver como se ha cambiado o manipulado los datos • No facilitan la busqueda efectiva de un subconjunto de los datos

  9. Assessment of Long-Term Forest Dynamics in the Caribbean Database and Metadata Concepts • Métodos para diseño efectivo • Dividir los datos en tablas • Determinar el tipo de dato de cada columna • Identificar las relaciones entre las tablas

  10. Assessment of Long-Term Forest Dynamics in the Caribbean Database and Metadata Concepts Datos adicionales del sitio de muestreo Se pueden relacionar en otra tabla

  11. Assessment of Long-Term Forest Dynamics in the Caribbean Database and Metadata Concepts Los datos que se repiten Datos adicionales de taxonomía se pueden almacenar en otra tabla es mas eficiente que estén en otra tabla

  12. Assessment of Long-Term Forest Dynamics in the Caribbean Database and Metadata Concepts • Métodos para diseño efectivo • Dividir los datos en tablas • Determinar el tipo de dato de cada columna • Identificar las relaciones entre las tablas

  13. Assessment of Long-Term Forest Dynamics in the Caribbean Database and Metadata Concepts Ejemplos de tipos de datos (dependen del programa en uso)

  14. Assessment of Long-Term Forest Dynamics in the Caribbean Database and Metadata Concepts Ejemplos de tipos de datos (dependen del programa en uso) *Set- aquí puede colocarse mas de uno de los valores

  15. Assessment of Long-Term Forest Dynamics in the Caribbean Database and Metadata Concepts Ejemplos de tipos de datos (dependen del programa en uso) Hay otros tipos de columnas, y mas información sobre estos en http://dev.mysql.com/doc

  16. Assessment of Long-Term Forest Dynamics in the Caribbean Database and Metadata Concepts • Métodos para diseño efectivo • Dividir los datos en tablas • Determinar el tipo de dato de cada columna • Identificar las relaciones entre las tablas

  17. Assessment of Long-Term Forest Dynamics in the Caribbean Database and Metadata Concepts • Relaciones entre las tablas • Cada dato individual se entra una sola vez • Las columnas pueden corresponder a otras tablas, y las filas corresponden a registros de datos individuales Por lo tanto • Cada registro individual en una tabla puede estar ligado/relacionado a uno o muchos registros en otras tablas

  18. Assessment of Long-Term Forest Dynamics in the Caribbean Database and Metadata Concepts Tipos de relaciones -1 a 1(una fila a una fila) -1 a muchas -muchos a muchos Datos adicionales Datos adicionales de taxonomía

  19. Assessment of Long-Term Forest Dynamics in the Caribbean Database and Metadata Concepts Tipos de relaciones -1 a muchas

  20. Assessment of Long-Term Forest Dynamics in the Caribbean Database and Metadata Concepts Tipos de relaciones Varias filas en una tabla están relacionadas con varias filas en otra tabla Tener relaciones entre tablas de ‘muchos a muchos’ puede ser problemático. En ocasiones es aconsejable crear una tabla adicional para relacionar esas dos tablas

  21. Assessment of Long-Term Forest Dynamics in the Caribbean Database and Metadata Concepts Tipos de relaciones Varias filas en una tabla están relacionadas con varias filas en otra tabla Ahora tenemos una relación de 1 a muchas

  22. Assessment of Long-Term Forest Dynamics in the Caribbean Database and Metadata Concepts

  23. Assessment of Long-Term Forest Dynamics in the Caribbean Database and Metadata Concepts

  24. Assessment of Long-Term Forest Dynamics in the Caribbean Database and Metadata Concepts • Específicos • Genéricos • Gratis • “web based” EndNote BIOTA Access MySQL Google Tables Referencias • Cook et al. 2001. Bestpracticesforpreparingecological and ground-based data sets to share and archive. Ecol. Bulletin 82:138-141. • Michener and Brunt 2000. Ecological Data: Design, management and processing. BlackwellScience.

  25. Algunos conceptos sobre metadata

  26. Assessment of Long-Term Forest Dynamics in the Caribbean Database and Metadata Concepts • Nivel 1 • Título, autor, información de contacto • Quienpublica y fecha de publicación • Palabras claves y Resumen Diferentes niveles de metadata • Nivel 2 • CoberturaGeográfica • CoberturaTaxonómica • Cobertura Temporal • Nivel 3 • Derechos de propiedadintelectual • Proyecto y Métodos • Tabla de datos/atributos • Nivel 4 • Se da acceso, el dato “físico”

  27. Assessment of Long-Term Forest Dynamics in the Caribbean Database and Metadata Concepts El reto: La entropía de los datos Al tiempo de publicación Detalles específicos Detalles generales Cambio de projecto Cambio de trabajo Contenido de Información Accidente Retiro (Michener et al. 1997) Tiempo

  28. Assessment of Long-Term Forest Dynamics in the Caribbean Database and Metadata Concepts A new metadata repository-

  29. Assessment of Long-Term Forest Dynamics in the Caribbean Database and Metadata Concepts

  30. Assessment of Long-Term Forest Dynamics in the Caribbean Basic Database and Metadata Concepts Morning • Introduction to the Workshop, Vision and Objectives • Implementation of the Forest Inventory Program • Database Concepts Mid-morning • Examples of Caribbean Permanent Plots Afternoon • Examples of Data Analyses • Data Sharing and Regional Synthesis, Working Group Themes • Identifying Forest Research Sites and Plots in the Caribbean; using Caribbean Foresters website • Exhibition and Discussion of Country Report Posters

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