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Universidade Federal de Pelotas Centro de Biotecnologia Programa de Pós-Graduação em Biotecnologia. REPLICAÇÃO DE DNA. Conteúdo. Replicação do DNA e ciclo celular; Origem de Replicação; Mecanismos básicos de replicação Fases da replicação *Início *Alongamento *Término.
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Universidade Federal de Pelotas Centro de Biotecnologia Programa de Pós-Graduação em Biotecnologia REPLICAÇÃO DE DNA
Conteúdo... • Replicação do DNA e ciclo celular; • Origem de Replicação; • Mecanismos básicos de replicação • Fases da replicação • *Início • *Alongamento • *Término
GENÉTICA BACTERIANA • O DNA bacteriano é circular; • O cromossomo de E. coli, por exemplo, contém cerca de 4 milhões de pares de bases e é aproximadamente 1000 vezes mais longo que a célula.
Estrutura espacial da dupla hélice Estruturadaduplahélice 1953: Watson and Crick
Replicação DNA DNA Trasncrição Reversa Transcrição RNA Tradução Proteína
Replicação do DNA x Ciclo Celular 1 Escherichiacoli 2 TEMPO DE GERAÇÃO: 20 MINUTOS 3 4
Replicação do DNA x Ciclo Celular “O ciclo de replicação e início da formação do septo ocorrem bem antes do processo de divisão”
Origem de Replicação em bactérias: Somente origens completamente metiladas podem iniciar a replicação • Metilação – DNA hemi-metilado- Ligação física com a membrana- Garante que a origem será ativada uma vez por ciclo
Replicação do DNA x Ciclo Celular Eucariotos
INÍCIO DA REPLICAÇÃO - ORIGEM • Região do DNA onde a replicação começa • Origens de procariotos e eucariotos – ricas em AT • Procariotos, plasmídeos e vírus - uma origem • Eucariotos – várias origens • E. coli – região de 245 pb essencial à replicação • 4 seqüências de 9 pb - TTAT(C/A)CA(C/A)A • 3 seqüências de 13 pb ricas em AT
Processo de início da replicação 52 kDa 1- Complexo inicial autocooperação
2- Complexo aberto 3- Complexo pré-priming HU e IHF DnaB - helicase
Regras básicas do processo de replicação • Processo semiconservativo • Início da replicação - Origem • Movimento da forquilha de replicação • Unidirecional ou bidirecional • Direção da replicação • 5’ 3’ • Semi-descontinuidade da replicação • O processo pode ser dividida em: - Inicio da replicação - Forquilha de replicação - Terminação
A replicação do DNA é semi-conservativa Cultivo em meio 15NH4Cl Experimento realizado por Meselson & Stahl em 1958 Cultivo em meio 14NH4Cl Purificação do DNA seguida de centrifugação em gradiente de CsCl
Replicação do DNA Semi-conservativa
INÍCIO DA REPLICAÇÃO Replicon: Unidade do DNA onde está ocorrendo um evento de replicação • Origem + Término • Durante um ciclo celular, a origem de replicação pode ser ativada mais de uma vez em procariotos e uma vez em eucariotos • O cromossomo de uma célula procariótica constituem um único replicon • Cada cromossomo eucariótico constitue vários replicons
A replicação é vista como um “olho” flanqueado por DNA não replicado
O genoma bacteriano circular constitue um único replicon • A velocidade da forquillha de replicação bacteriana é 50000pb/min • Um única origem de replicação em E.coli (OriC, 245 pb)
O genoma eucariótico constitue vários replicons A velocidade da forquillha de replicação eucariótica é 2000 pb/min Os replicons eucarióticos tem 40-100 kb e são iniciados em tempos diferentes Fase S demora ~ 6 h em uma célula somática
MOVIMENTO DA FORQUILHA DE REPLICAÇÃO Unidirecional ou bidirecional A replicação é bidirecional em procariotos A replicação é unidirecional em eucariotos
DIREÇÃO DA REPLICAÇÃO A adição dos nucleotídeos para o alongamento da cadeia é SEMPRE no sentido 5’-3’
SEMI-DESCONTINUIDADE DA REPLICAÇÃO A replicação ocorre de maneira contínua em uma das fitas e descontínua na outra fita
Replicação do DNA • Procariotos • Genes menores • Cromossomo circular • Bidirecional • UMA ORIGEM • Eucariotos - Genes e cromossomos maiores • Unidirecional • VÁRIAS ORIGENS
ENZIMAS QUE PARTICIPAM DA REPLICAÇÃO DO DNA • Helicases (DnaB) • DNA Polimerase • Primase • SSB (Single Strand Binding Protein) • Topoisomerases • DNA ligase
DNA POLIMERASES E PRIMASES
As DNA-polimerases sempre requerem um iniciador previamente pareado ao molde que será copiado
Atividade revisora 3’ 5’ garante a fidelidade da replicação
DNA POLIMERASES E. coli - DNA Polimerase I # polipeptídeo de 928 aa, replicação e reparo de DNA
Propriedades das DNA-polimerases Bacterianas Pol I PolII PolIII Polimerização 5’ 3’ + + + Exonuclease 3’ 5’ + + + Exonuclease 5’ 3’ + - - Número de subunidades 1 4 10 Tamanho em kDa 103 90 ~900 Velocidade de Polimerização(nt/seg) 16-20 40 250-1000
DNA POLIMERASES • Eucariotos - DNA polimerases - primase e - reparo do DNA - replicação do genoma nuclear - replicação do DNA mitocondrial • Bacteriófagos - T4 DNA Polimerase • Outras - Taq DNA polimerase (Thermus aquaticus) Pfu DNA polimerase(Pyrococcus furiosus)
TAQ DNA POLIMERASE Thermusaquaticus -Estável a temperaturas de 177 graus; Temperatura Ótima: 72 graus
Síntese da Fita descontínua Fita descontínua Fita contínua Síntese da Fita Contínua REPLICAÇÃO DO DNA A síntese do DNA é semi-descontínua e requer um iniciador (primer) de RNA
REPLICAÇÃO DO DNA Fita contínua (líder) Fita descontínua Fragmentos de Okazaki: 1000 a 2000 nt (PROCARIOTOS) 100 a 200 nt (EUCARIOTOS)
Fragmentos de Okasaki ocorrem na fita descontínua • A DNA polimerase III é responsável pela síntese da maior parte do DNA • A DNA polimerase I remove o primer de RNA e preenche as lacunas • A DNA ligase sela as quebras
REPLICAÇÃO DO DNA A DNA ligase sela as quebras
REPLICAÇÃO DO DNA O complexo de replicação • A proteína DNA B (helicase) é responsável pelo movimento para frente da forquilha • Cada core catalítico da DNA PolIII sintetiza uma das fitas-filhas • O primossomo afasta uma das fitas molde • Proteínas SSB mantem as fitas parentais separadas
Término da replicação- genomas lineares Problema!!! REPLICAÇÃO DE DNA LINEAR: o modelo demonstra o surgimento de extremidades não pareadas após a remoção dos primers no final da replicação
Término da Replicação • Formação de Concatâmeros
Término da replicação • Telômeros