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Genomic minimalism in the early diverging intestinal parasite Giardia lamblia.

Genomic minimalism in the early diverging intestinal parasite Giardia lamblia. Deep questions in the tree of life. (Keeling, 2007). (Morrison et al., 2007). Boudouma Nedjma et Hoarau Ludovic. Giardia lamblia. Le protiste parasite le plus répandu aux Etats-Unis.

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Genomic minimalism in the early diverging intestinal parasite Giardia lamblia.

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Presentation Transcript

  1. Genomic minimalism in the early diverging intestinal parasite Giardia lamblia. Deep questions in the tree of life. (Keeling, 2007) (Morrison et al., 2007) Boudouma Nedjma et Hoarau Ludovic

  2. Giardia lamblia Le protiste parasite le plus répandu aux Etats-Unis Les trophozoïtes flagellés infestent l' intestin grêle. - Cycle parasitaire de Giardia lamblia - (D'après Meyer et Jaroll, 1980)

  3. Génome totalement décrypté. Ouverture du débat sur l'origine des eucaryotes TAXONS PEU ROBUSTES Giardia lamblia parmi les DIPLOMONADINES

  4. 10 µm 10 µm 2 noyaux diploïdes Flagelles (undulipodiums) Caractère dérivé propre : Caryomastigonte: unité de base • Caractères particuliers : • 2 noyaux diploïdes identiques • Absence de mitochondries et de peroxysomes

  5. Cette espèce amitochondriale comporte des génes qui sont clairement dérivés d'une mitochondrie • ex : cnp60 et DnaK • Découverte du mitosome : relique mitochondriale ? Tachezy, (2001) Remise en cause de leur position à la « racine eucaryote » avant l'endosymbiose mitochondriale. Endosymbiose mitochondriale (ά-proteobactérie ) chez les Diplomonadines plus ancienne que la divergence de toutes les lignées d' Eucaryotes A.J. Roger et al. (1998)

  6. De nombreux gènes eucaryotes sont absents (genomic minimalism). • Des enzymes clés du métabolisme sont absentes. • Machines protéiques plus simples que les autres Eucaryotes. Tendance à la simplification des mécanismes moléculaires, structure du cytosquelette et voies métaboliques par rapport aux autres lignées Eucaryotes Caractères dérivés résultant d'un mode de vie parasitaire ? ou Caractères ancestraux dans l'évolution des Eucaryotes ?

  7. Plantae Straménopiles Alvéolés Fungi Unichontes Discicristates Escavates Divergence de Giardia dans l'analyse phylogénétique des protéines ribosomiales. Divergence profonde de Giardia et de Trichomonas (Escavates) dans l'arbre des Eucaryotes = 2Ga

  8. De nombreux HGT (Horizontal Gene Transfert) • ≈ 10 gènes concernés • HGT d'origine bactérienne (cnp60, DnaK ) • HGT d'origine : Bactérie gram + (NADPH) • HGT d'origine Archées (ORFs) Rôle important dans la construction du génome et des processus métaboliques Giardia lamblia

  9. D'après Keeling (2005) Existence de ces 5 groupes actuellement contestée

  10. Références • Andersson J. et al., 2003. Phylogenetic analyses of diplomonad genes reveal frequent lateral gene transfers affecting eukaryotes. Curr Biol; 13(2):94-10. • Keeling P.J., 2005. The tree of eukaryotes. Trends in Ecology & Evolution. 20, 670. • Lecointre G. et Le Guyader H.,2003. Classification phylogénétique du vivant. Belin Ed. 560 p. • Roger A. J. et al., 1998. A mitochondrial-like chaperonin 60 gene in Giardia lamblia: evidence that diplomonads once harbored an endosymbiont related to the progenitor of mitochondria. Proc. Natl. Acad. Sci. USA 95:229–234. • Tachezy J., Sánchez L.C., Müller M., 2001. Mitochondrial type iron-sulfur cluster assembly in the amitochondriate eukaryotes Trichomonas vaginalis and Giardia intestinalisindicated by the phylogeny of IscS, a key protein of this process. Mol. Biol. Evol. 18: 1919-1928. • http://www.com.univ-mrs.fr/~boudouresque • http://www.wikipedia.com

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