80 likes | 213 Views
4. DNA tietokannat. EMBL www.ebi.ac.uk/embl/. EBI:n ylläpitämä, muoto samanlainen kuin SWISS-PROT Kannoissa EMBL, GenBank ja DDBJ samat tiedot Sekvenssien määrä kaksinkertaistuu 9-12 kuukauden aikana, mutta yli 50% niistä on peräisin muutamasta organismista kuten ihminen, hiiri ja hiiva.
E N D
4. DNA tietokannat T. Pasanen / Johdatus bioinformatiikkaan
EMBLwww.ebi.ac.uk/embl/ • EBI:n ylläpitämä, muoto samanlainen kuin SWISS-PROT • Kannoissa EMBL, GenBank ja DDBJ samat tiedot • Sekvenssien määrä kaksinkertaistuu 9-12 kuukauden aikana, mutta yli 50% niistä on peräisin muutamasta organismista kuten ihminen, hiiri ja hiiva T. Pasanen / Johdatus bioinformatiikkaan
DDBJwww.ddbj.nig.ac.jp • DNA Data Bank of Japan, aloitettu 1986 T. Pasanen / Johdatus bioinformatiikkaan
GenBankwww.ncbi.nlm.nih.gov/ M90100 T. Pasanen / Johdatus bioinformatiikkaan
dbESTwww.ncbi.nlm.nih.gov/dbEST/ • GenBankin osa joka sisältää EST datan ja siihen liittyvät kommentit T. Pasanen / Johdatus bioinformatiikkaan
Erikoistuneet genomikannat • SGB (Saccharomyces, hiiva, ens. aitotumallinen), UniGene (ihminen), TDB (TIGR database), ACeDB (www.acedb.org) T. Pasanen / Johdatus bioinformatiikkaan