160 likes | 690 Views
PROTEINI. Široko zastopani v živih celicah Sestava proteinov: 20 L-ak, povezanih s peptidno vezjo Izrazi se zapis, pospravljen v genu Raznoliki glede M r Raznoliki po strukturi Raznoliki po funkciji
E N D
PROTEINI • Široko zastopani v živih celicah • Sestava proteinov: 20 L-ak, povezanih s peptidno vezjo • Izrazi se zapis, pospravljen v genu • Raznoliki glede Mr • Raznoliki po strukturi • Raznoliki po funkciji (encimi, protitelesa, hormoni, transportni proteini, strukturni proteini (lasje, vezivno tkivo, očesna leča, ptičje perje, v rogovi, nohti...), antibiotiki, skladiščni proteini (proteini v mleku – kazein, proteini jajjčnega beljaka – ovalbumin), svetilka kresnice...)
Amino kislina L-ak – gradniki proteinov D-ak – bakterijska celična stena, antibiotiki, pri človeku v tkivih, ki se počasi obnavljajo
Nastanek peptidne vezi Amino- / N-konec Karboksilni- /C-konec
Primer polipeptidnih verig: zaporedje ak ostankov človeškega inzulina Nelson DL, Cox MM, Lehninger Principles of Biochemistry, 2005
PROTEINI • Široko zastopani v živih celicah • Sestava proteinov: 20 L-ak, povezanih s peptidno vezjo • Izrazi se zapis, pospravljen v genu Geni vsebujejo kodone za ak Genomika mRNA nosi zapis za ak zaporedje Proteomika • Razvrsti in karakterizira vse proteine, ki so kodirani v DNA • Preuči regulacijo in raven izražanja proteinov • Določi konc. proteinov v celicah (spremenjena konc. lahko vodi do bolezenskih stanj) • Določi strukturo vsakega proteina v celici • Ugotovi interakcije proteina z drugimi molekulami Proteini s specifičnim ak zaporejem
Dedne bolezni • Nenormalni gen nastane z mutacijo ali s spremembo nukleotidnega zaporedja v DNA • Somatske mutacije se pojavijo v somatskih celicah in so (lahko) škodljive za določen osebek • Mutacije v spolnih celicah se prenesejo na potomce – dedne bolezni • Znaki/simptomi dednih bolezni se pokažejo na prizadetem proteinu Primeri: prizadet Hb → bolezni krvi prizadet protein vezivnega tkiva → bolezni vezivnega tkiva prizadet encim metabolizma → prizadet metabolizem
Molekulske lastnosti nekaterih proteinov • Proteini (več kot 100 ak ostankov) so zelo raznoliki glede Mr
Kako iz znane Mr (določimo eksperimentalno)ocenimo št. aminokislinskih ostankov v polipeptidu? • Povprečna Mr ak = 138 • Povprečna Mr ak, zastopanih v proteinih = 128 • Ob nastanku peptidne vezi izstopa H2O → 128 – 18 = 110 • Če poznamo Mr proteina, lahko izračunamo ~ št. ak ostankov: št. ak ostankov = Mr / 110
Klasifikacija proteinov (po strukturi) • A. Po obliki molekule • Fibrilarni proteini • Globularni proteini • B. Po kemijski sestavi • Enostavni proteini • (vsebujejo samo aminokislinske ostanke) • Konjugiraniproteini • (vsebujejo peptidno in ne-proteinsko komponento – • prostetično skupino) • Apoprotein = protein brez prostetične skupine (polipeptid) • Holoprotein = protein + prostetična skupina kolagen aldolaza
Ločevanje proteinov s kolonsko kromatografijo Nelson DL, Cox MM, Lehninger Principles of Biochemistry, 2005
Ionsko-izmenjevalna kromatografija Gelska filtracija Nelson DL, Cox MM, Lehninger Principles of Biochemistry, 2005
Afinitetna kromatografija Nelson DL, Cox MM, Lehninger Principles of Biochemistry, 2005
Elektroforeza proteinov Nelson DL, Cox MM, Lehninger Principles of Biochemistry, 2005