1 / 31

Imagen digital, telepatología y preparaciones virtuales

Imagen digital, telepatología y preparaciones virtuales. Marcial García Rojo Hospital General de Ciudad Real (SESCAM) marcial@cim.es. A project for Castilla-La Mancha Health Service. Ykonos project. Imagen en Patología (Anatomía Patológica).

gregory-mccall
Download Presentation

Imagen digital, telepatología y preparaciones virtuales

An Image/Link below is provided (as is) to download presentation Download Policy: Content on the Website is provided to you AS IS for your information and personal use and may not be sold / licensed / shared on other websites without getting consent from its author. Content is provided to you AS IS for your information and personal use only. Download presentation by click this link. While downloading, if for some reason you are not able to download a presentation, the publisher may have deleted the file from their server. During download, if you can't get a presentation, the file might be deleted by the publisher.

E N D

Presentation Transcript

  1. Imagen digital, telepatología y preparaciones virtuales Marcial García Rojo Hospital General de Ciudad Real (SESCAM) marcial@cim.es

  2. A project for Castilla-La Mancha Health Service • Ykonos project

  3. Imagen en Patología (Anatomía Patológica) • Imagen macroscópica: biopsias, piezas quirúrgicas. Estática o movimiento (JPG, AVI) • Imagen microscópica: • Cortes histológicos (biopsias, bloques celulares, autopsias). Tinciones y técnicas especiales. • Citologías. Tinciones y técnicas especiales. • Patología molecular: FISH, Geles agarosa, GCH • Principales problemas: Archivo (espacio) y gestión deficiente (búsquedas)

  4. Calidad imagen

  5. Compresión: Diagnóstico posible

  6. Telepatología • Estática o “almacenar y enviar”: Sistemas no robotizados (ej: e-mail) que envían imágenes fijas adquiridas antes de la sesión. • Preparaciones virtuales: imagen digital de toda la preparación. • Dinámica: Transmisión de información en tiempo real

  7. Telepatología • Estática o “almacenar y enviar”. • Pasiva: Sin interacción activa con el sistema de imágenes. • Correo electrónico: envío de imágenes como ficheros adjuntos. • Documentos HTML: las imágenes se publican en páginas web. • FTP: envío de los ficheros a un servidor • Interactiva: Consulta en directo con unas imágenes preseleccionadas • Teléfono • Programa de chat, teleconferencia o compartir aplicaciones

  8. Proyectos de digitalización total y microscopios virtuales • 1997. Proyecto Telepath. Universidad de Alabama en Birmingham. Microscopio virtual: imágenes seleccionadas de 1,4 MB • 1998. Hospitales Johns Hopkins y Universidad de Maryland. Cada preparación: 5-10 GB (comprimido). JPG, FlashPix, wavelets (Saltz, 1997; Wang-JZ, 1999) http://www.seap.es/telepatologia/

  9. Cortes histológicos • Las preparaciones convencionales son frágiles, • No son permanentes, sobre todo inmunofluorescencia, cristales articulación, … • En citología, no es posible distribuir copias. VENTAJAS DE PREPARACIÓN VIRTUAL • Pequeños aumentos con calidad extraordinaria. • Mapa dinámico de preparación • Enviar imágenes de mayor resolución recibiendo sólo el área seleccionada. • Grabar y reproducir la trayectoria seguida por el patólogo durante su examen de la preparación o laminilla y • Las imágenes quedan almacenadas permanentemente, y sobre ellas es posible realizar anotaciones que también pueden quedar grabadas. Área de tejido de unos 25 x 20 mm

  10. Telepatología HOSPITAL B HOSPITAL A Remitente Segunda opinión

  11. Aurora Viewer

  12. Espacio necesario para digitalizar una preparación sin comprimir

  13. Soluciones existentes • Microscopios robotizados • Leica, Olympus SIS Dotslide • Escáneres de preparaciones • Son microscopios modificados que incorporan todo el equipamiento físico para control, digitalización y comunicaciones.

  14. Escáner de preparaciones • Aperio ScanScope CS (5 prep), XT (120 p) • Zeiss Mirax San (3D Histech) • Hamamatsu Nanozoomer • Claro • Biogenex • ….

  15. Soft Imaging System .Slide

  16. Aperio Scanscope T2 • Tiras de imágenes TIFF (.svs) con solapamiento (“stitching”) exportables a JPEG 2000, compresión óptima • Sistema rápido y de alta resolución, con calidad excelente • Preparaciones en red, base de datos • Precio: XT: 120.000 euros CS: 70.000 euros

  17. Un directorio con un conjunto de ficheros imágenes, a menudo JPEG, y un fichero de coordenadas, que contiene la información sobre cómo reconstruir la preparación completa Un único fichero JPEG 2000 o TIFF multirresolución, que a su vez contiene información sobre la preparación (número de biopsia o citología recogida en el código de barras, fecha de creación, parámetros de iluminación, etc.) Qué es físicamente una preparación virtual

  18. Limitaciones: Almacenamiento y tiempo • Cada preparación histológica o citológica precisa 1 GB, una vez comprimida. • Hospital pequeño (8.000 biopsias/10.000 citologías)  30 TB / año • Escanear cada preparación  15 minutos. • Un escáner: < 100 preparaciones/día • Leer citologías en pantalla es lento (20 minutos un patólogo)

  19. Ventajas de preparaciones virtuales • Hoy día las preparaciones virtuales ayudan a • Crear archivos digitales: Casos de interés docente, asistencial, investigación, gestión de calidad o riesgos • Mejor comunicación entre patólogos (segunda opinión) • Diagnóstico primario: Centros remotos con uno o ningún patólogo • Gestión del conocimiento: Anotaciones (marca área de interés), análisis de imagen, integración con sistemas de información.

  20. Fases del proyecto (SESCAM) CITI 2005, Concurso público: 2007 • Crear repositorio central de imágenes médicas • Contemplar el almacenamiento de ficheros de gran tamaño • Adaptación de imágenes para integrarlas en PACS (estándar DICOM de Imagen Digital y Comunicaciones en Medicina) • Utilizar visor estándar para trabajar preparaciones virtuales (no depender de fabricantes) • Ayuda al diagnóstico: Análisis de imagen automatizado

  21. Imagen Original & Estado Presentación Área de Interés Área de Interés Los Cambios realizados por el Patólogo son Guardados Imagen Original Los Cambios realizados por el Patólogo se Pierden Presentación coherente El patólogo ve esto: El clínico ve esto: Annotate Anotar Imagen final Zoom Rotar Observación Imagen Original Imagen original

  22. Ejemplos de servicios DICOM Modalidad TAC Archivo PACS SCP Almacenamiento SCU Almacenamiento Modalidad Virtual Slide Archivo PACS SCU Almacenamiento SCP Almacenamiento

  23. Pathologist application

  24. Common image viewer

  25. Universidades de Tampere y Helsinki

  26. Universidades de Tampere y Helsinki

  27. Papanicolau p16INK4a Colocalización marcadores moleculares

  28. Papanicolau p16INK4a Movimiento sincronizado marcadores moleculares

  29. Panorámica: Diagnóstico más rápido

  30. Ayuda al diagnóstico

  31. Conclusiones • Las preparaciones virtuales permiten disponer de una copia digital de toda la preparación original • Sistema de interconsulta entre patólogos y formación continuada • Los estándares DICOM e IHE son de gran ayuda • Los fabricantes de imagen digital deben contemplar DICOM • El desafío en el futuro próximo es conseguir albergar en PACS la gran cantidad de información que se generará con la digitalización total de las preparaciones virtuales y los vídeos digitales de los exámenes macroscópicos • JPEG 2000 es un formato adecuado para el manejo de preparaciones virtuales y SESCAM lo integra en PACS

More Related