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短短芽胞杆菌FJAT-0809-GLX突变体库的构建及其抗菌益生功能初步分析. 指导老师:刘 波 博士、研究员 副 导 师:车建美 博士、副研究员 研 究 生:黄丹丹. 福建农林大学生命科学学院 福建省农业科学院农业生物资源研究所 2013年1月7日. 内容提要. 国内外研究现状与趋势. 研究意义. 研究目标和内容. 研究方法和技术路线. 研究可行性分析及创新点. 研究进度安排. 研究基础. 已具备的研究条件. 一、国内外研究现状与趋势. 1 、 短短芽胞杆菌形态学特性. 菌落形态. 电镜形态. 菌体形态.
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短短芽胞杆菌FJAT-0809-GLX突变体库的构建及其抗菌益生功能初步分析短短芽胞杆菌FJAT-0809-GLX突变体库的构建及其抗菌益生功能初步分析 指导老师:刘 波 博士、研究员 副 导 师:车建美 博士、副研究员 研 究 生:黄丹丹 福建农林大学生命科学学院 福建省农业科学院农业生物资源研究所 2013年1月7日
内容提要 国内外研究现状与趋势 研究意义 研究目标和内容 研究方法和技术路线 研究可行性分析及创新点 研究进度安排 研究基础 已具备的研究条件
一、国内外研究现状与趋势 1、短短芽胞杆菌形态学特性 菌落形态 电镜形态 菌体形态 • 菌体:菌体杆状、革兰氏阳性、产芽孢、周生鞭毛、菌体约为0.8μm-2.2μm; • 菌落:NA培养基上,菌落浅黄色、无光泽、不透明、电镜下菌落呈放射状褶皱。
一、国内外研究现状与趋势 2、微生物遗传育种研究 • 物理诱变:紫外、微波、超声波、激光、离子辐射诱变等。 • 化学诱变剂:烷化剂、亚硝酸胍、硫酸二乙酯等。 • 物诱变包括转化、转座、原生质体融合等方式。 • 复合诱变:一般为物理诱变和化学诱变的综合。 物理诱变 不同诱变育种方式 文本 化学诱变 生物诱变 复合诱变
一、国内外研究现状与趋势 Tn10 转座子 类型 Tn917 Tn5 mariner 类家族 3、转座子体内随机突变芽孢杆菌研究 • Tn917:链霉素、卡那霉素、红霉素抗性基因 • Tn10:四环素抗性基因 • Mini-Tn10:红霉素、壮观霉素抗性基因
一、国内外研究现状与趋势 4、短短芽胞杆菌活性物质研究 胞外多糖 几丁质酶 活性物质 短杆菌肽 羟苯乙酯 内毒素 酯酶
一、国内外研究现状与趋势 生物防治 工业应用 环境治理 表达受体 5、短短芽胞杆菌的应用 石油开采 灭蚊晶体蛋白Cry11A蛋白 • 防治白菜灰霉病菌 • 抑制重金属吸收,促生长 • 防治青枯雷尔氏菌 • 防治棉花立枯病、枯萎病 • 降解苯酚 • 降解六氯甲烷
一、国内外研究现状与趋势 6、本实验室相关的研究现状 • 筛选得到短短芽胞杆菌FJAT-0809-GLX • 菌株的鉴定 • 生物学特性研究 • 具有抑菌保鲜功能
一、国内外研究现状与趋势 FJAT-0809-GLX 硫酸链霉素 清水对照 7、本实验室相关的研究现状 —短短芽胞杆菌活性物质分析 羟苯乙酯 邻苯二甲酸二丁酯 邻苯二甲酸单(2-乙基己基)酯
二、研究意义 • 建立短短芽胞杆菌突变体库构建体系 • 筛选抗菌活性更高的生防菌株,或其他相关功能的目标菌株,应用于农业生物防治中,减少农业生产成本,提高产量。 • 扩大短短芽胞杆菌在生物防治上的抑菌谱和提高保鲜上的抗菌功能。
三、研究目标和内容 (一)研究目标 (1)确立短短芽胞杆菌突变体库构建的方法,筛选 出抗菌活性高的突变子; (2)确立短短芽胞杆菌突变子抗菌益生功能的初步分析方法。
三、研究目标和内容 (二)研究内容 (1)短短 1、短短芽胞杆菌FJAT-0809-GLX突变体库的构建 紫外诱变 转座诱变 筛选高抗菌活性的突变子
三、研究目标和内容 2、短短芽胞杆菌突变子的抗菌益生功能分析 生物学特性 活性物质 生物测定 菌落形态 生长曲线 培养条件 羟苯乙酯 抗氧化剂 表面活性剂 抑 菌 谱 生物保鲜 动物益生
三、研究目标和内容 3、拟解决的关键问题 (1)紫外诱变获得抗真菌活性 较原始菌株更高的突变子。 (2)电击转化获得有效转化子。 (3)短短芽胞杆菌突变子抗菌物质活性检测及其对果实的保鲜作用。
四、研究方法和技术路线 1、短短芽胞杆菌FJAT-0809-GLX突变体库的构建 紫外诱变 抗菌初筛 抗菌复筛 差异显著 性分析 稳定性 检测 (1)紫外诱变 筛选比原始菌株活性更高的突变子
四、研究方法和技术路线 质粒提取 感受态细胞制备 电击转化 抗生素筛选 分子检测 高温诱导 1、短短芽胞杆菌FJAT-0809-GLX突变体库的构建 (2)转座诱变 转座质粒PIC333携带Mini-Tn10转座子。其长度为2.35kb,两端各有一段IS序列,具有对温度敏感的特性。 分子检测 高温诱导
四、研究方法和技术路线 2、短短芽胞杆菌突变子抗菌益生功能的初步分析 (1)突变子生物学特性分析 • 突变子菌落形态 • 生长曲线的制作 • 培养条件的优化 (初始pH、培养温度、溶氧量和转速)
四、研究方法和技术路线 羟苯乙酯粗提取,并做抑菌活性测定 采用排油圈法进行表面活性剂活性测定 对DPPH·和羟基自由基作抗氧化活性分析 2、短短芽胞杆菌突变子抗菌益生功能的初步分析 (2)突变子活性物质特性研究
四、研究方法和技术路线 2、短短芽胞杆菌突变子抗菌益生功能的初步分析 (3)生物测定 抑菌谱测定,大肠杆菌、沙门氏菌、莲雾黑腐病菌、枇杷炭疽菌为指示菌做抑菌圈实验。 生物保鲜,主要对新鲜的莲雾采用喷施和浸泡的方式进行保鲜研究,记录腐烂率。 益生动物,以小白鼠为实验对象,将突变子菌株作为微生物饲料添加剂,观测小白鼠的日增重和健康状况。
生物学特性 紫外诱变 菌落形态 突变子特性及抗菌益生功能分析 生长曲线 高抗菌活性突变子筛选 培养条件 突变体库的构建 短短芽胞杆菌- 活性物质特性 羟苯乙酯 表面活性剂 抗氧化剂 转座诱变 生物 测定 抑菌谱 生物保鲜 动物益生 四、研究方法和技术路线
五、研究可行性分析及创新点 (一)可行性分析 • 目前,短短芽胞杆菌FJAT-0809-GLX的紫外突变及初筛工作已经完成,获得两株抗菌活性较原始菌株高的突变子,说明本课题可以进行。 • 据报道,苏云金芽孢杆菌芽孢杆菌、枯草芽孢杆菌插入突变体库已成功构建,因此,短短芽胞杆菌转座突变具有可行性,且插入突变方法体系也已经初步建立。 • 突变子生物学特性研究、抗菌益生功能研究方法成熟,在前人研究的基础上可以完成。
五、研究可行性分析及创新点 (二)创新点 在选材上,善于利用已有的材料开展实验研究。短短芽胞杆菌选自本实验检测的具有抗菌活性的菌株,且其菌体和菌体产生的短杆菌素等已经投入农业生产应用,这为本实验开展筛选抗菌活性更高的菌株提供了一个基础。 研究方向上,具有创新性和实用性。目前,国内外关于短短芽胞杆菌突变体库的构建还没有相关文献报道,本实验为短短芽胞杆菌的遗传育种提供一种参考,另外诱变高抗菌活性的菌株还可以应用到农业生产中,加大生防效力。
六、研究进度安排 2012 2013 1-2 突变子稳定性检测 3 转座诱变 4 突变子研究 5 生物测定 6 数据整理及论文撰写 8 查阅参考文献 9 建立紫外诱变方法 10 建立转座诱变方法 11 条件摸索完成 12 紫外诱变
七、研究基础 1、短短芽胞杆菌FJAT-0809-GLX紫外诱变
七、研究基础 1、短短芽胞杆菌FJAT-0809-GLX紫外诱变 致死率为80%左右时获得最佳正突变率
七、研究基础 2、短短芽胞杆菌特异性PCR鉴定 bp 1500 1500
七、研究基础 3、短短芽胞杆菌FJAT-0809-GLX突变子初筛 筛选到两株抑菌圈活性明显高于原始菌株的突变子,复筛实验正在进行。
八、已具备的研究条件 本实验室拥有较强生物技术研究装备,拥有基因扩增仪电击仪、细菌鉴定仪、系列电泳仪、高速离心机、超低温冰箱、紫外分光光度计、凝胶成像仪、气相色谱仪、液相色谱、气质联用色谱等等,可以满足科研的需要。