School of Biotechnology KTH Royal Institute of Technology

1. School of BiotechnologyKTH Royal Institute of Technology Samverkaniblandkulturpå Science for Life Laboratory CSG, 18:e april, 2013 Prof. Stefan Ståhl

2. Innehåll • Samverkan på BIO • Vad är Proteinatlasen och Science for Life Laboratory • Utmaningar

3. BIO-skolanssamverkan • Vid behov (3-4 ggr/år) • Ärenden: • T/A-tjänster • Lärartjänster • Tillbud • Bokslut/budget • Arbetsmiljöplan • Flytt av personal

4. School of Biotechnology • Industrial Biotechnology (Larsson) • Gene Technology (Lundeberg) • Glycoscience (Bulone) • Protein Technology (Nygren) • Proteomics & Nanobiotechnology (Uhlén) • Theoretical Chemistry & Biology (Ågren) • Technology-driven research in“Life Science” • Fundamental research • Applied research www.biotech.kth.se www.biotech.kth.se

5. School of Biotechnology • New materials • Biotech tools • Medical research & diagnostics • Production of pharmaceuticals (small molecules/proteins) • Targeted diagnostics and therapy • Understanding diseases • Biosustainability • Energy production • Industrial Biotechnology • Gene Technology • Glycoscience • Protein Technology • Proteomics & Nanobiotechnology • Theoretical Chemistry & Biology Biofuels www.biotech.kth.se www.biotech.kth.se

6. Dean: Stefan StåhlVice Dean: Amelie Eriksson Karlström18 Professors > 300 Students> 340 Employees > 110 PhD students ≈ 30 teachers (faculty) ≈ 50 research leaders School of Biotechnology • Industrial Biotechnology (Larsson) • Gene Technology (Lundeberg) • Glycoscience (Bulone) • Protein Technology (Nygren) • Proteomics & Nanobiotechnology (Uhlén) • Theoretical Chemistry & Biology (Ågren) www.biotech.kth.se www.biotech.kth.se

7. BIO-skolans intäkter/kostnader www.biotech.kth.se www.biotech.kth.se

8. ”Den mänskliga proteinatlasen” Mathias Uhlén, KTH Finansiering: Wallenberg Foundation 2003-15 (900 mkr) KTH, Uppsala, and Mumbai > 120 anställda Antikroppar till allakroppensproteiner = 20 000 st (10 nyavalideradeantikroppar per dag) Offentlig digital “kartbok” www.proteinatlas.org

9. Cell profiling • Proteinernas lokalisering på cellnivå analyseras med konfokalmikroskopi • Startade med 3 cellinjer : A-431, U 251 mg, U – 2 os (hud, hjärna och ben) • Idag analyseras 15 olika cellinjer • Grönt – HPA antikroppen • Blått – Cellkärnan • Rött - Cytoskelettet • Gult – ER (endoplasmiska nätverket)

10. Status och framtid • Release av version 11 den 11 mars 2013, 15156 gener (75%) • Första utkastet av den mänskliga proteinatlasen 2015 (20,000 gener)

11. Human Protein Atlas • Löptid 2003-2015 • > 100 anställda (KTH, Uppsala universitet, Mumbai) • > 20 tekniker på KTH – stor omsättning • Generellt rekryteringstillstånd • ~ 15 tekniker/år • HPA en förutsättning för Science for Life Laboratory (Proteinatlasen > 3000 besök per dag)

13. Four broad research platforms: • Genomics • Proteomics and protein profiling • Bioimaging and functional biology • Bioinformatics and systems biology

14. Two buildings (14,000 m2) • Alfa 1-6 • Summer 2012 • Gamma 3,4,6(1/2) • Summer 2013 • Gamma 5 • Sept/Oct 2013 Center Director: Mathias Uhlen Deputy Director: Gunnar von Heijne Site Director: Fredrik Sterky 5 6 4 2012 5 2013 3 4 2 2010 3 2 2011 1

15. SciLifeLab Stockholm development Gamma-huset Alfa-huset

16. Utmaningar • Flytt av grupper • Tre universitet – tre kulturer • Forskarna (KTH, KI, SU) – blandade på lab och i kontorslandskap • Hur skapas ”vi-känsla”? För SciLifeLab – för hemuniversitet? • Olika lönenivåer (ex. doktorandstege)KI: 23.6 – 27.1 kkr; KTH: 25.7-30.75 kkr; SU: 23.2 - 26.8 kkr • Olika arbetstidsavtal • Friskvårdsersättning – olika regler/nivåer!

17. Utmaningar • Verksamhetsgruppering – samverkansenhet eller inte? • Arbetsmiljöansvar delegerat till föreståndare (Fredrik Sterky)? • Ambitionerna sprack! Ej juridiskt stöd?! • Idag: Forskarna tillhör universitetsavdelningar (personalansvar)Arbetsmiljöavtal under framtagande (Leif Svanblom)Akuta åtgärder ”delegeras” till Fredrik Sterky • Industrial Biotechnology (Larsson) • Gene Technology (Lundeberg) • Glycoscience (Bulone) • Protein Technology (Nygren) • Proteomics & Nanobiotechnology (Uhlén) • Theoretical Chemistry & Biology (Ågren)

18. Bra stämningoch“vi känsla” påSciLifeLab!

19. Finansiering (2013-2015) Budget Uppsala/Stockholm:67/133 mkr/år Infrastructure funding (150 MSEK/year) • National infrastructure - service (instrumentation, personnel) • International infrastructure (participation in international efforts) • Technical development (of national interest) • Scientific leadership, administration, rent, data storage • Training Drug development funding (40 MSEK/year) • National infrastructure for development of chemical and biological drugs Strategic research funding SFO (145 MSEK/year) • Larger research projects • New recruitments • Technical development Budget Uppsala/Stockholm:44/101 mkr/år KTH: 78 mkr/år

20. …fortsattsamverkaniblandkultur • “Nationell fas” inleds under 2013 • KTH fortsatt huvudman • 335 mkr/år (400 mkr/år fr 2016) • KTH, KI, SU & UU = SciLifeLab Sweden • Nationella resurs-plattformar • Nationell referens-kommitté (SS, KTH-rep) • Styrelse beslutas av KTHs US (17 april, 2013)Ordf. Göran Sandberg, KAWMargareta Olsson Birgersson, Roche, näringslivsrepresentant Sophia Hober, dekanus, KTH Hans-Gustav Ljungren, dekanforskning, KI Britt Skogseid, vice-rektor, UU Hans Adolfsson, Prorektor, SU Maria Anvret, GUGunellaWestergren-Thorsson, Dekanus Med Fak, LU Karl-Eric Magnusson, Linköping (ordf. NRK) • Stort ansvar för Svenkt forskar-anseende • Tydlighet & transparens och världsledande forskning!

21. …fortsattsamverkaniblandkultur