Katseandmete analüüs I osa www .ut.ee/~tammarut/stat.htm

1. Katseandmete analüüs I osa http://www.ut.ee/~tammarut/stat.htm Vanemuise 46-202

2. Alustamine Tunnuste lisamine ja kopeerimine Väärtustele ridade lisamine ja kopeerimine

3. t-testid, parameetrilised korrelatsioonid mitteparameetrilised testid tunnuse jaotuse kontrollimine

4. Tunnuse väärtustest histogrammi koostamine Kahe pideva tunnuse omavahelise seose joonis Faktortunnuse erinevate tasemete vaheliste jooniste koostamine

5. Andmete sisestamine File > New... Tunnusenimed: double-click nimereale Sorteerimine Arvutamine: nt. logaritmimiseks: v3=log(v2) või eri tunnuste kombineerimiseks: v5=‘kaal’/’vanus’ Tunnuste selekteerimine: Tools >...Include cases: sugu=‘isane’ and vanus=4 Sama teeb ka nupp:

6. Kirjeldavad statistikud Statistics > Basic statistics and tables > Descriptive statistics > Advanced Märgi ärahuvipakkuvad statistikud, nt: keskväärtus (Mean) mediaan (Median) mood (Mode) standardhälve (Standard Deviation (SD)) dispersioon (Variance) standardviga (Std. err. of mean (SE)) usalduspiirid (Conf. Limits for mean) variatsioonikoefitsient (Coefficient of Variation; Stat.7 puudub) kvartiilid (Lower and upper quartiles)

7. Histogramm Graphs > Histograms > Advanced Variables: vali uuritav tunnus Graph type: regular / multiple / double-Y Fit type: Off / Normal / ... Show percentages (% tulpade kohale) Statistics: Descriptive (Kirjeldavad statistikud joonisele) Intervals: Categories... (Tulpade arvu muutmine) SELECT CASES Sel Cond

8. T-test Statistics > Basic statistics and tables > t-test, independent, by groups Meid huvitavad statistikud:

9. T-testi aken Variables: Vali uuritavad tunnused Dependent e sõltuv e response-tunnus (t-testis tunnus, mille erinevust testitakse) Independent e sõltumatu e faktortunnus (t-testis grupid, mida omavahel võrreldakse) Quick Advanced Options Levene’s test (dispersioonide erinevuse testimine) Summary (testitulemused) Box plot (graafik) Categorized Normal Plots (normaaljaotuse testimine) Eelduste testimiseks

10. Ühesuunaline ANOVA (dispersioonanalüüs) Statistics > ANOVA > One-way ANOVA Variables: Vali sõltuv ja sõltumatu(grupeeriv) muutuja; Vajuta OK > All effects (tulemuste tabel) > More results > Summary > Whole model R (Adjusted R2 - mudeli seletusvõime näitaja) ndf(mudeli vabadusastmed) Eelduste testimine: More results>Assumptions Plot means vs std deviations ddf(vea vabadusastmed)

11. Kruskal-Wallis ANOVA by Ranks; kaal (Näidisandmed) Independent (grouping) variable: sugu Kruskal-Wallis test: H (1, N= 20) =7.179669 p=0.0276 Mitteparameetriline ANOVA • Mediaanitest • Kruskal-Wallise ANOVA Statistics > Nonparametrics > Comparing multiple independent samples Summary: Kruskal-Wallis ANOVA & Median Test Multiple comparisons of mean ranks (mis grupid erinesid?) Tulemused (meid huvitavad H, N ja p):

12. 20 0.61 0.59 0.37 3.12 3.28 0.0059 0.0042 20 r(X,Y) r2 t p N vanus & kaal N SpearmanR t(N-2) P-level Korrelatsioonid Pearson(parameetriline) Statistics > Basic stat > Correlation matrices Options: Display detailed table of results Spearman(mitteparameetriline) Statistics > Nonparametrics > Correlations Compute: Detailed report Spearman R

13. Lineaarne regressioon Statistics > Advanced Linear/Nonlinear Models > General Linear Models > Simple regression(1 sõltumatu muutuja) võiMultiple regression(>1 sõltumatu muutuja) võiFactorial regression(>1 sõltumatu muutuja + koosmõjud) Variables: vali sõltuv ja sõltumatu(predictor e ennustav) muutuja OK

14. 0,89 147,7466 1 0,79 147,7466 0,75 60,82710 148,34 0,000001 3 49,45 38,86 16 2,43 20,36 0,00010 45,7470 1 45,7470 18,83399 0,000507 9,6427 1 9,6427 3,96990 0,063666 7,1408 1 7,1408 2,93988 0,105718 38,8634 16 2,4290 Multiple Multiple Adjusted SS df MS SS df MS F p R R2R2Model Model Model Resid. Resid. Resid. SS d.f MS F p Intercept Vanus Kaal Vanus*kaal Error Whole Model R(Mudeli üldise seletusvõime hindamiseks): All effects(Erinevate sõltumatute tunnuste mõju hindamiseks):

15. Eelduste paikapidavuse hindamine: Jääkide jaotus: Resids > Residuals Jääkide sõltuvus keskväärtustest: Resids > Obs & Resids Regressioonivõrrand: y = a + bx Report > Pred.equation Või: Graphs > Scatterplots > Advanced (linnuke Regression equation ette) Või: More results > Coefficients („Param.“ lahtrist saate algoordinaadi ja b)

16. Negatiivne seos Graafik regressiooni & korrelatsiooni illustreerimiseks Graphs > Scatterplots > Advanced Korrelatsiooni puhul vali statistikud (Statistics >Corr. and p), Regressiooni puhul regressioonivalem (Statistics >Regression (fit) equasion) ja regressioonisirge usalduspiiridega (Regression bands > Confidence)

17. 768,15 1 768,15 136,85 <0,0001 0,04 1 0,04 0,01 0,94 0,24 1 0,24 0,04 0,84 97,15 1 97,15 17,3 0,00074 89,81 16 5,61 Mitmesuunaline (Multiway) ANOVA Kaks (või rohkem) faktortunnust Statistics > ANOVA > Factorial ANOVA • Variables > Vali 1 sõltuv muutuja ja • vähemalt 2 sõltumatut faktorit • OK > All effects SS d.f MS F p Intercept sugu vanus sugu*vanus Error

18. Joonis 2 faktori interaktsiooni illustreerimiseks • ANOVA tulemusteaknas All effects/Graphs • Kliki interaktsiooni-rida aktiivseks > OK

19. 423,20 1 423,20 115,67 <0,0001 125,00 1 125,00 34,16 <0,0001 52,16 1 52,16 14,25 0,0015 62,20 17 3,66 ANCOVA e. Kovariatsioonanalüüs Statistics > Advanced Linear/Nonlinear Models > General Linear Models > Analysis of covariance Variables > Vali sõltuvtunnus, huvialune faktortunnus ja pidevkovariaat OK > All effects SS d.f. MS F p Intercept kaal sugu Error

20. emane 7,915385 isane 3,684615 veresuhkur sugu mean LS Means e. kovariaadi mõjust puhastatud keskmised: ANCOVA tulemusteaknas: Means > Least squares means

21. Graafiku toimetamine Double-click graafiku peal avab toimetamise akna Skaala muutmine: Axis scaling (X või Y) > Mode > Manual Edit step > Mode > Manual Tunnusenime muutmine: Axis title (X või Y) Tulpade muutmine: Plot Bars (tulpade värv ja muster) Plot Histogram (tulpade arv ja vahed) Graafikule kirjutamine: Menüüribast Insert > Text > joonisele ilmub kast „Custom text“, mida saab toimetada.

22. Graafiku toimetamine Soovitud väärtuste märkimiseks joonisel: graafiku toimetamise aknas: Axis:Scale values (“linnuke” custom labels ette) > Edit custom labels... Kirjuta lisatavad väärtused ja neile vastavad tekstid, “linnuke” Grid ette ja toimeta märkimisjoon silmatorkavamaks: Gridlines... Toimetatud graafiku Word-i saamiseks klõps parema hiireklahviga ja Copy graph (ja Paste Word-is) või Save graph (.wmf, .jpg formaadis ja Insert > Picture > From file Word-is) Tulemuste toortabeli Word-i saamiseks kopeeri ja kleebi Report aknast.

23. Andmete importimine ja eksportimine Kopeerimine ja kleepimine teisest programmist. Importimine Exelist: File > Open... > Import selected sheet to a workbook Eksportimine teistesse formaatidesse (tekstifail, SPSS, SAS, LOTUS, .pdf): File > Save as... > soovitavaks formaadiks kohandamise dialoogaken, nt. Exeli puhul...

24. Tulemuste haldamine File > Output Manager > … • Workbook – kõik analüüsid, joonised, jne paigutatakse ühte kausta, mida on lihtne sirvida • Report – kõik tulemid paigutatakse ühte tekstifaili, mida on vajadusel kerge toimetada ja kuhu saab lisada omapoolseid kommentaare, märkuseid, vms (workbook seda ei võimalda)

25. Tulemused paigutatakse Workbook’i Tulemused paigutatakse Report’i