1 / 11

Génétique Animale

Génétique Animale. Vision et attentes vis-à-vis de Bios4Biol. La révolution des technologies de Séquençage. La génomique révolutionne la manière de faire de la biologie. 1990. 2000. 2009. 2010. Nb séquences en parallèle. 10. 100. 1 million. 1 milliard.

hubert
Download Presentation

Génétique Animale

An Image/Link below is provided (as is) to download presentation Download Policy: Content on the Website is provided to you AS IS for your information and personal use and may not be sold / licensed / shared on other websites without getting consent from its author. Content is provided to you AS IS for your information and personal use only. Download presentation by click this link. While downloading, if for some reason you are not able to download a presentation, the publisher may have deleted the file from their server. During download, if you can't get a presentation, the file might be deleted by the publisher.

E N D

Presentation Transcript

  1. Génétique Animale Vision et attentes vis-à-vis de Bios4Biol

  2. La révolution des technologies de Séquençage • La génomique révolutionne la manière de faire de la biologie 1990 2000 2009 2010 Nb séquences en parallèle 10 100 1 million 1 milliard

  3. La bioinfo : Une priorité pour GA • Priorité N°2 du Schéma stratégique du Département GA :« Etudier la plasticité de la structure du génome nécessitant l’acquisition massive de données, la recherche en bioinformatique, l’ingénierie. » • Priorité N°3 du Schéma stratégique du Département GA : « Etudier et gérer la composante génétique de la robustesse des animaux : Des caractères aux gènes (l’identification des leviers) »

  4. Les éléments du puzzle • Mise en place de SIGENAE • Mise en place de plateforme de production de données : GeT PlaGe • Partenariat avec la Plateforme Bioinformatique de Genotoul • Montage de France Génomique • Un CATI commun : Bios4Biol

  5. Une nécessairecomplémentarité entre recherche et ingénierie Ingénierie Génomique (plateformes) Ingénierie Bioinformatique (plateformes) Bios4Biol Recherche Génomique Recherche Bioinformatique

  6. Une nécessairecomplémentarité entre recherche et ingénierie Ingénierie Génomique (plateformes) Ingénierie Bioinformatique (plateformes) Bios4Biol Recherche Génomique Recherche Bioinformatique

  7. Un nécessairedialogue entre Biologistes et Bioinformaticiens Biologistes Bioinformaticiens

  8. Suite à ce que j’ai entendu ce matin • Statut des données : • Données à usage générique : séquence de référence d’un organisme • Données à usage spécifique : séquences d’individus de référence (publics ou non) • Données à usage unique : clonage positionnel d’un gène d’intérêt. • Les choix peuvent être différents. • Choix stratégiques : • Ce que l’on fait nous (et que l’on se donne les moyens de maintenir) • L’adossement à une solution soutenue par d’autres (Ensembl) • L’utilisation de solutions toutes faites (cloud commercial)

  9. Une nécessairecomplémentarité entre recherche et ingénierie • La culture de la qualité : La satisfaction de l’utilisateur • La satisfaction de l’ingénieur : • Etre utile (répondre au mieux à un besoin) • Rester au top dans son domaine (gérer la tension entre production et développements). • Aider la recherche en bioinformatique à identifier les goulets d’étranglements nécessitant des développements nouveaux en recherche Ingénierie Bioinformatique (plateformes) Recherche Génomique Recherche Bioinformatique

  10. Points d’attention • C’est un gros CATI : • Risque de fonctionnement à plusieurs cercles, • Moins évident coté animation & gouvernance, mais potentiellement plus riche • Gouvernance : • Mise en commun de forces de départements partageant des mêmes objectifs • Auberge espagnole • CATI versus PEPI • Nécessaire Structuration & Pyramidage

  11. Points d’attention • CATI Plateforme(s)  CATI ≈ Plateforme CATI ≈ Objet big data génomique pluri Dpts, mais pas CATI unique sur cet objet • Gros CATI mais non autosuffisant : nécessaires interactions avec d’autres CATI, d’autres EPST (France Génomique, IFB, Metabohub …). • Big Data : Génomique/Bioinfo & Phénotypage & Biostatistiques

More Related