550 likes | 1.19k Views
Metabolismus purinů a pyrimidinů. Vladimíra Kvasnicová. Struktura purinových a pyrimidinových nukleotidů. nukleo tid = ester kys. fosforečné a nukleo sidu nukleo sid = dusíkatá báze + monosacharid -N-glykosidová vazba mezi bází a sacharidem dusíkaté báze : aromatické heterocykly
E N D
Metabolismus purinů a pyrimidinů Vladimíra Kvasnicová
Struktura purinových a pyrimidinových nukleotidů • nukleotid = ester kys. fosforečné a nukleosidu • nukleosid = dusíkatá báze + monosacharid • -N-glykosidová vazba mezi bází a sacharidem • dusíkaté báze: aromatické heterocykly • puriny: pyrimidinový + imidazolový kruh • pyrimidiny: pyrimidinový kruh
PURINOVÉ BÁZE Obrázek je převzat z učebnice: Devlin, T. M. (editor): Textbook of Biochemistry with Clinical Correlations, 4th ed. Wiley‑Liss, Inc., New York, 1997. ISBN 0‑471‑15451‑2
ribonukleosiddeoxyribonukleosid N-glykosidová vazba Obrázek je převzat z učebnice: Devlin, T. M. (editor): Textbook of Biochemistry with Clinical Correlations, 4th ed. Wiley‑Liss, Inc., New York, 1997. ISBN 0‑471‑15451‑2
ribonukleotiddeoxyribonukleotid Obrázek je převzat z učebnice: Devlin, T. M. (editor): Textbook of Biochemistry with Clinical Correlations, 4th ed. Wiley‑Liss, Inc., New York, 1997. ISBN 0‑471‑15451‑2
PYRIMIDINOVÉ BÁZE Obrázek je převzat z učebnice: Devlin, T. M. (editor): Textbook of Biochemistry with Clinical Correlations, 4th ed. Wiley‑Liss, Inc., New York, 1997. ISBN 0‑471‑15451‑2
ribonukleosidydeoxyribonukleosid Obrázek je převzat z učebnice: Devlin, T. M. (editor): Textbook of Biochemistry with Clinical Correlations, 4th ed. Wiley‑Liss, Inc., New York, 1997. ISBN 0‑471‑15451‑2
Ribonukleotidy * N-glykosidová vazba * esterová vazba * anhydridové vazby Obrázek je převzat z učebnice: Devlin, T. M. (editor): Textbook of Biochemistry with Clinical Correlations, 4th ed. Wiley‑Liss, Inc., New York, 1997. ISBN 0‑471‑15451‑2
Rozdělení nukleotidů • purinové: obsahují adenin, guanin, hypoxanhin nebo xanthin • pyrimidinové: obsahují cytozin, uracil nebo thymin • ribonukleotidy (obsahují ribózu) • deoxyribonukleotidy (obsahují deoxyribózu) • vznikají redukcí ribonukleosid difosfátů (NADPH)
Purinové nukleotidy • obsahují ve své molekule aromatický cyklus • mohou obsahovat adenin nebo thymin • obsahují N-glykosidovou vazbu • jsou tvořeny nukleosidem spojenýms kyselinou fosforečnou anhydridovou vazbou
Purinové nukleotidy • obsahují ve své molekule aromatický cyklus • mohou obsahovat adenin nebo thymin • obsahují N-glykosidovou vazbu • jsou tvořeny nukleosidem spojenýms kyselinou fosforečnou anhydridovou vazbou
Pyrimidinové nukleotidy • obsahují ve své molekule imidazolové jádro • jsou např. thymidin- nebo cytidin-monofosfát • obsahují esterovou vazbu • mohou obsahovat ve své molekule 3 zbytky kyseliny fosforečné
Pyrimidinové nukleotidy • obsahují ve své molekule imidazolové jádro • jsou např. thymidin- nebo cytidin-monofosfát • obsahují esterovou vazbu • mohou obsahovat ve své molekule 3 zbytky kyseliny fosforečné
Výskyt nukleotidů • nezbytné pro všechny buňky • hlavně 5´-nukleosiddi a trifosfáty • ribonukleotidy: celková koncentrace poměrně konstantní (mM), mění se jen jejich poměr (nejvíce: ATP) • deoxyribonukleotidy: hladina závisí na buněčném cyklu (µM)
Vlastnosti nukleotidů • silná absorpce UV záření (260 nm) • puriny méně stabilní v kyselém prostředí než pyrimidiny • polární koncové fosfátové skupiny • názvy: adenylát nebo kyselina adenylová,...
Nukleotidy v metabolismu 1) energetický metabolismus ATP - hlavní biologický přenašeč volné energie – „energetická konzerva“ (30 kJ/mol / odštěpení fosfátu) • fosfotransferasové reakce (kinasy) • svalová kontrakce, aktivní transport 2) monomerní jednotky RNA a DNA • substráty pro syntézu: nukleosidtrifosfáty 3) mediátory metabolických procesů • cAMP, cGMP („druhý posel“)
4) součásti koenzymů • NAD, NADP, FAD, CoA 5) aktivace intermediátů • UDP-Glc, GDP-Man, CMP-NANA • CDP-cholin, ethanolamin, diacylglycerol • SAM methylace • PAPS sulfatace 6) allosterické efektory - regulace klíčových enzymů metabolických drah
3´-fosfoadenosin-5´-fosfosulfát (PAPS) přenáší sulfát při konjugačních reakcích do substrátu (sulfatace) Obrázek je převzat z http://web.indstate.edu/thcme/mwking/amino-acid-metabolism.html (leden 2007)
Purinové a pyrimidinové nukleotidy se využívají • ve formě nukleosidtrifosfátů při syntéze nukleových kyselin • v energetickém metabolismu buňky • při aktivaci meziproduktů metabolismu sacharidů a lipidů • v enzymatických reakcích: jsou součástí různých koenzymů
Purinové a pyrimidinové nukleotidy se využívají • ve formě nukleosidtrifosfátů při syntéze nukleových kyselin • v energetickém metabolismu buňky • při aktivaci meziproduktů metabolismu sacharidů a lipidů • v enzymatických reakcích: jsou součástí různých koenzymů
PRDP = 5-fosforibozyl-1-difosfát • společný substrát pro syntézu purinů i pyrimidinů • jeho syntéza je klíčovou reakcí pro biosyntézu nukleotidů • PRDP-syntetáza je cílem zpětnovazebné inhibice nukleosid di a trifosfáty • prekurzor: * ribóza-5-fosfát (pentózový c.) * ribóza-1-fosfát (fosforolýza nukleosidů)
využití: • regulace syntézy nukleotidů • substrát pro syntézu nukleotidů PRPP = PRDP Obrázek je převzat z učebnice: Devlin, T. M. (editor): Textbook of Biochemistry with Clinical Correlations, 4th ed. Wiley‑Liss, Inc., New York, 1997. ISBN 0‑471‑15451‑2
Syntéza purinových nukleotidů • de novo (nová výstavba purinového kruhu) • šetřící reakce (syntéza z bází a nukleosidů) • mnohem méně energeticky náročné než de novo syntéza • snižují syntézu de novo • substráty: a) báze (adenin, guanin, hypoxanthin) PRDP b) ribonukleosidy ATP
Syntéza purinových nukleotidů de novo • velká spotřeba enrgie (ATP) • cytoplazma buněk různých tkání, hlavně játra • substráty: * 5-fosforibozyl-1-difosfát (= PRDP = PRPP) * aminokyseliny (Gln, Gly, Asp) * deriváty tetrahydrofolátu, CO2 • koenzymy: * tetrahydrofolát (= kys.listová) * NAD+
významné meziprodukty: • 5´-fosforibozylamin • inozinmonofosfát (IMP) • produkty: nukleosidmonofosfáty (AMP, GMP) • mezipřeměna purinových nukleotidů: • přes IMP = „taťka-mamka“ purinových nukleotidů (inosinmonofosfát: báze = hypoxanthin)
Syntéza purinových nukleotidů CYTOPLAZMA Obrázek převzat z http://web.indstate.edu/thcme/mwking/nucleotide-metabolism.html (leden 2007)
„Taťka-mamka“ IMP AMP GMP Obrázek je převzat z učebnice: Devlin, T. M. (editor): Textbook of Biochemistry with Clinical Correlations, 4th ed. Wiley‑Liss, Inc., New York, 1997. ISBN 0‑471‑15451‑2
Obrázek je převzat z učebnice: Devlin, T. M. (editor): Textbook of Biochemistry with Clinical Correlations, 4th ed. Wiley‑Liss, Inc., New York, 1997. ISBN 0‑471‑15451‑2
Syntéza pyrimidinových nukleotidů • de novo (nová výstavba pyrimidinového kruhu) • šetřící reakce (syntéza z bází nebo nukleosidů) • substráty: a) * báze (kromě cytosinu) * PRDP b) * ribonukleosidy * ATP
Syntéza pyrimidinových nukleotidůde novo • kromě jedné reakce probíhá v cytoplazmě(dihydroorotát-DH je v mitochondrii) • substráty: * karbamoylfosfát (Gln,CO2,2 ATP) * aspartát * PRDP * derivát THF (pouze pro thymin) Karbamoylfosfát vzniká i při syntéze MOČOVINY(pouze v mitochondriích hepatocytů)
významné meziprodukty: * kyselina orotová * orotidinmonofosfát (OMP) * uridinmonofosfát (UMP) = „taťka-mamka“ dalších n. • produkty: * cytidintrifosfát (z UTP) * deoxythimidinmonofosfát (z dUMP)
Syntéza pyrimidinových nukleotidů CYTOPLAZMA mitochondrie Obrázek převzat z http://web.indstate.edu/thcme/mwking/nucleotide-metabolism.html (leden 2007)
Obrázek je převzat z učebnice: Devlin, T. M. (editor): Textbook of Biochemistry with Clinical Correlations, 4th ed. Wiley‑Liss, Inc., New York, 1997. ISBN 0‑471‑15451‑2
Syntéza 2-deoxyribonukleotidů reakci katalyzuje ribonukleotidreduktáza Obrázek je převzat z učebnice: Devlin, T. M. (editor): Textbook of Biochemistry with Clinical Correlations, 4th ed. Wiley‑Liss, Inc., New York, 1997. ISBN 0‑471‑15451‑2
Syntéza thymidinmonofosfátu Obrázek je převzat z učebnice: Devlin, T. M. (editor): Textbook of Biochemistry with Clinical Correlations, 4th ed. Wiley‑Liss, Inc., New York, 1997. ISBN 0‑471‑15451‑2
Regulace syntézy nukleotidů • PRDP-syntetáza je inhibována purinovými i pyrimidinovými nukleosiddifosfáty i nukleosidtrifosfáty • syntéza jednotlivých nukleotidů je regulována zpětnou vazbou • nukleosiddifosfát-reduktáza: nukleosidtrifosfáty ji aktivují, deoxyadenosintrifosfát (dATP) ji inhibuje
Odbourávání purinů a pyrimidinů • z potravy:málo využíváné k resyntéze • endogenní: • enzymy * nukleázy (štěpí nukleové kyseliny) * nukleotidázy (štěpí nukleotidy) * nukleosidfosforylázy (š. nukleosidy) * deamináza (adenosin) * xanthinoxidáza (hypoxanthin, xanthin) inhibována allopurinolem (lék Milurit)
Odbourávání purinů „kyselina močová“
produkty: • puriny→ NH3, kyselina močová - má antioxidační vlastnosti(částečně vylučována močí; poruchy: hyperurikémie, dna) normální hodnoty: sérum 220 – 420 µmol/l (muži) 140 – 340 µmol/l (ženy) moč 0,48 – 5,95 mmol/l • pyrimidiny: C, U →-alanin, CO2, NH3T → -aminoizobutyrát, CO2, NH3
Při syntéze nukleotidů • se využívají produkty pentózového cyklu • je významným substrátem fosforibosyldifosfát (PRDP = PRPP) • se uplatňuje jako koenzym derivát kyseliny listové • probíhají všechny reakce v cytoplazmě
Při syntéze nukleotidů • se využívají produkty pentózového cyklu • je významným substrátem fosforibosyldifosfát (PRDP = PRPP) • se uplatňuje jako koenzym derivát kyseliny listové • probíhají všechny reakce v cytoplazmě
Syntéza purinových nukleotidů • využívá jako jeden ze substrátů amoniak • probíhá celá v cytoplazmě • může vycházet z nukleosidů vzniklých degradací nukleových kyselin • zahrnuje jako meziprodukt kyselinu močovou
Syntéza purinových nukleotidů • využívá jako jeden ze substrátů amoniak • probíhá celá v cytoplazmě • může vycházet z nukleosidů vzniklých degradací nukleových kyselin • zahrnuje jako meziprodukt kyselinu močovou
Syntéza pyrimidinových nukleotidů • je zahájena reakcí mezi PRDP a glutaminem • probíhá celá v cytoplazmě • zahrnuje jako meziprodukt kyselinu orotovou • zahrnuje jako meziprodukt inosinmonofosfát
Syntéza pyrimidinových nukleotidů • je zahájena reakcí mezi PRDP a glutaminem • probíhá celá v cytoplazmě • zahrnuje jako meziprodukt kyselinu orotovou • zahrnuje jako meziprodukt inosinmonofosfát
Při degradaci purinových nukleotidů • je uvolňován amoniak • vzniká CO2 • se uplatňuje enzym xanthinoxidáza • vzniká jako konečný produkt kyselina močová
Při degradaci purinových nukleotidů • je uvolňován amoniak • vzniká CO2 • se uplatňuje enzym xanthinoxidáza • vzniká jako konečný produkt kyselina močová