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GENETICA 2011. PARTE II: HERENCIA Teorica 7. MAPA DE LIGAMIENTO DEL CR 1 HUMANO. Un valor de 1 % de recombinación o entrecruzamiento significa que los genes están ubicados a una distancia expresada en una unidad llamada centimorgan o una unidad de mapa del mismo cromosoma.
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GENETICA2011 PARTE II: HERENCIA Teorica 7
MAPA DE LIGAMIENTO DEL CR 1 HUMANO Un valor de 1 % de recombinación o entrecruzamiento significa que los genes están ubicados a una distancia expresada en una unidad llamada centimorgan o una unidad de mapa del mismo cromosoma
COMO SABER SI GENES ESTAN LIGADOS? PROGENIE RECOMBINANTE Y NO-RECOMBINANTE
En que orden están los genes en un mismo cromosoma? Cruzamientos de 3 puntos Datos: 3 loci ligados (abc). La combinacion menos frecuentes sera la q requiera 2 eventos de CO De 1000 descendientes: 142 sufrieron CO entre a y b . 52 sufrieron CO entre a y c 100 sufrieron Co entre b y c 5 sufrieron CO entre a y c
ENTONCES: • El orden de los genes es a-c-b • Las distancias aproximadas son: • a (5cM)-c-(10cM)-b
MARCADORES MOLECULARES GENOTIPO FENOTIPO • GENES • AMBIENTE
MARCADORES MOLECULARES Permiten evidenciar variaciones en la secuencia de ADN entre 2 individuos distintos y asociarlos con un rasgo fenotipico • RFLP • VNTR • RAPDs • STRs • AFLP Deben ser: Altamente polimorficos No epistasicos Poco efecto ambiental
ANTES DE SEGUIR, PREGUNTAR: SABEN LO QUE ES PCR?
LOS MARCADORES MOLECULARES SE PUEDEN CONVERTIR EN MARCADORES “PCR ALELO ESPECIFICOS” (STS: sequence tagged sites) (economicos, robustos, sencillos) Se aisla fragmento polimorfico de un gel Se clona Se disenan primers para esas secuencias Se secuencia EST: expressed sequence tags
STS (sequence-tagged sites) y EST (expressed sequence tags) http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/gquery?term=dbEST
BIO-INFORMATICA BASES DE DATOS GENERALES NCBI de USA (GenBank) EBI de EU (EMBL Nucleotide Seq database) DDBJ de Japon SwissProt
BUSCADOR ENTREZ http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/gquery
ALINEAMIENTO DE SECUENCIAS http://blast.ncbi.nlm.nih.gov/Blast.cgi