4.1. Virtuális Obszervatórium

1. 4.1. Virtuális Obszervatórium Beszámoló a 2006. évről Csabai István, Kiss Attila,Molnár András

2. 4.1. Virtuális Obszervatórium Áttekintés • Általános bevezető, célok • Elméleti kutatás • Technológiák, infrastruktúra • Virtuális Obszervatórium tervezése

3. 4.1. Virtuális Obszervatórium Áttekintés • Általános bevezető, célok • Elméleti kutatás • Technológiák, infrastruktúra • Virtuális Obszervatórium tervezése

4. 4.1. Virtuális Obszervatórium Igények “Mit vár(hat) a tudomány az informatikától?” • Nagy adattömeg kezelése • Nagy számításigény kielégítése • Hatékony keresés, elemzés • Szimulációk (in silico) • Kollaboráció, tudás megosztása, saját programok és adatok bevitele • Tudományterületek igényeinek megismerése,az informatikai lehetőségek kiaknázása

5. 4.1. Virtuális Obszervatórium Technológia “Mit nyújt(hat) az informatika a tudománynak?” • Hardver • Tár- és számítási kapacitás, hálózat • Adatbázis-technológiák • Adatmodellek, adatbázis-tervezés • Indexelés hatékony kereséshez • Adatelemzés, adatbányászat • Párhuzamos, elosztott rendszerek • Párhuzamos feldolgozás • Grid technológiák • Felhasználói felület, vizualizáció • Webes portálfelület • Vizualizációs technikák

6. 4.1. Virtuális Obszervatórium Célok “e-Science virtuális obszervatórium” • “E-science-t támogató virtuális obszervatórium tervezése, az optimális megvalósításhoz szükséges technológiák rendszerezése, az osztott szolgáltatásoknak megfelelő adatbázisok tervezése, illetve a feladatokhoz kapcsolódó kutatások elvégzése és prototípusok készítése.”

7. 4.1. Virtuális Obszervatórium Személyi háttér • Projektvezető: Csabai István • Információs Rendszerek Tanszék, 2006.: • Kiss Attila docens, • Le Anh Vu, Molnár András doktoranduszok • Seres Csaba hallgató, technikai munkatárs • (Kukla Tamás hallgató) • Információs Rendszerek Tanszék, 2007-től továbbá: • Ács Zoltán doktorandusz • Kósa Balázs tanársegéd, Vincellér Zoltán műszaki tanár

8. 4.1. Virtuális Obszervatórium Áttekintés • Általános bevezető, célok • Elméleti kutatás • Technológiák, infrastruktúra • Virtuális Obszervatórium tervezése

9. 4.1. Virtuális Obszervatórium e-Science irodalomkutatás • Irodalomkutatás: • Cikkek és projektek, meglévő adatbázisok és technológiák gyűjtése, tanulmányozása - elsősorban bioinformatikai témakörben • “e-Science - Informatika a tudomány szolgálatában” c. tanulmány első két fejezetének elkészítése

10. 4.1. Virtuális Obszervatórium Adatbázis-elméleti kutatás • Relációs adatmodellezés • Többágú kapcsolatok tervezése • Partíciós adatmodell • Féligstrukturált adatbázisok • XML lekérdezések, hatékony indexelés • Prototípus implementáció 2 elfogadott cikk és előadás az ADBIS ‘06 konferencián (Thessaloniki): • Efficient Processing SAPE Queries Using the Dynamic Labelling Structural Indexes • Relationship Design Using Spreadsheet Reasoning for Sets of Functional Dependencies 1 elfogadott cikk és előadás az ICAI 2007 konferencián (Eger): • Parallel Processing Search Engine for Very Large XML Databases RET Technical Report 2/2007 (megjelenés alatt): • An Extended Partition Model for Generalized Multidimensional Data

11. 4.1. Virtuális Obszervatórium Áttekintés • Általános bevezető, célok • Elméleti kutatás • Technológiák, infrastruktúra • Virtuális Obszervatórium tervezése

12. 4.1. Virtuális Obszervatórium Belső infrastruktúra • Infrastrukturális szerver a csoportnak (dbsrv14.inf.elte.hu) • Környezet kialakítása • SharePoint portál a gyűjtött anyagoknak, jegyzőkönyveknek • Belső levelezőlista • 4.730-es szoba

13. 4.1. Virtuális Obszervatórium Grid technológiák • Ismerkedés a grid technológiákkal • Részvétel Szakmai rendezvényeken • Networkshop konf., Miskolc • SZTAKI High-Tech Workshop • EGEE nyári iskola • EGEE LHCGrid (LCG) • Csatlakozás virtuális szervezetekhez: HunGrid, VOCE

14. 4.1. Virtuális Obszervatórium EGEE grid • Technológiai ismeretek továbbadása • Két egynapos (belső) tanfolyam • Magyar nyelvű használati útmutató • Alkalmazás • Molekuladokkolási program futtatása(Biokémiai Tanszék számára) • Fejlesztés, üzemeltetés • ELTE grid site (EszakiGrid) • P-GRADE portál: a hivatalos HunGrid portál üzemeltetői lettünk

15. 4.1. Virtuális Obszervatórium CasJobs • A Virtuális Obszervatórium prototípusa a csillagászok SDSS / CasJobs rendszere • Webes portál, webszolgáltatások, adatok elérése, lekérdezése, saját adatok bevitele, adatelemző és vizualizációs eszközök • A rendszer telepítése a belső szerverre (dbsrv14), forráskód elemzése

16. 4.1. Virtuális Obszervatórium Áttekintés • Általános bevezető, célok • Elméleti kutatás • Technológiák, infrastruktúra • Virtuális Obszervatórium tervezése

17. 4.1. Virtuális Obszervatórium Terveink • Célkitűzés: portálrendszer a CasJobs mintájára, ill. továbbfejlesztéseként, általánosításaként, más tudományterületekre (biológia) • Webes portál, webszolgáltatások, adatok elérése, lekérdezése, saját adatok bevitele, adatelemző és vizualizációs eszközök adatbázis-kapcsolat, lekérdezés-feldolgozás

18. 4.1. Virtuális Obszervatórium Terveink • További lehetőség: A P-GRADE grid-portál • továbbfejlesztése • adatkezelés (pl. “grid file manager”) • más gridekre (pl. ClusterGrid) • integrálása a Virtuális Obszervatóriumba nagy számítási és tárolókapacitás elérése

19. 4.1. Virtuális Obszervatórium Terveink • Új együttműködés: Juhász Gáborék neurobiológiai csoportja (Balog Juli, Szegő Éva, Szilágyi Nóra) • idegrendszeri gyógyszerkutatás • protein adatbázisok • belső portált alakítottunk ki meglévő, elérhető adat-bázisokhoz és elemző programokhoz, ezek értékelése kezdődik • megfelelő protein adatbázis átvétele, igény esetén új adatbázis kifejlesztése lehetséges • vizualizáció... tartalom, valós igények (neurobiológia)

20. 4.1. Virtuális Obszervatórium Terveink • Vizualizációs igények és lehetőségek: • Proteinek egymásra hatási gráfjai (nehezen áttekinthető gráf, sok csomóponttal és éllel) • NASA WorldWind • Megkezdjük egy gráfkirajzoló plug-in fejlesztését, amely az Etomichálózati topológiára és késleltetésre vonatkozó adatait jelenítené meg a földgömbön 3D-ben.

21. 4.1. Virtuális Obszervatórium Terveink • Publikáció, tudományos fokozatok: • Az ADBIS’07 konferenciára és az Acta Cyberneticába készülünk cikkel • Kósa Balázs, Le Anh Vu és Molnár András doktori disszertációja készül, a RET támogatásával

22. 4.1. Virtuális Obszervatórium Terveink • Hardverbeszerzés: • Grid infrastruktúra továbbépítéseés/vagy adatbázisszerver • Keret van, még nem döntöttünk • a feladat pontos specifikációjától függ...

23. Köszönöm a figyelmet!