130 likes | 288 Views
Hjärnan i datorn Martin Rehn CBN, CSC, KTH. f.d. SANS, NADA, KTH. Vår grupp: Computational Biology & Neurocomputing (CBN). 15 personer. Biomekaniska modeller Beräkningsneurobiologi Systembiologi. Nära samarbete med Karolinska institutet. Biomekaniska modeller. Gång- och simrörelser
E N D
Hjärnan i datornMartin RehnCBN, CSC, KTH f.d.SANS, NADA, KTH
Vår grupp: Computational Biology & Neurocomputing (CBN) • 15 personer • Biomekaniska modeller • Beräkningsneurobiologi • Systembiologi Nära samarbete med Karolinska institutet
Biomekaniska modeller Gång- och simrörelser Neuronnätsmodeller Mekaniska modeller
Systembiologi -cell i pancreas Biokemiska nätverk
Beräkningsneurobiologi Modeller av enskilda nervceller Nätverks-modeller
Hur kan en simulering hjälpa oss att förstå hur hjärnan arbetar? Modellering av synbarken
Primära synbarken i apa • ”Receptiva fält” i synbarken (Den signal som intresserar en viss cell mest) • Runda och långsmala former Ett receptivt fält Receptiva fält från ett antal celler Data från D. Ringach
Representation av synintryck • Signalering begränsas av ämnesomsättningen • “Mjuk” gleshet = låg genomsnittlig aktivitet • Enkel ur beräkningssynpunkt • “Hård gleshet” = få aktiva nervceller • Fungerar bättre att lagra i minnet • Svårare att beräkna
Resultat från simulering • “Mjuk” gleshet: Bara kantiga former • “Hård” gleshet: Även runda former (stämmer bättre!) Mjuk gleshet Hård gleshet Apa (experiment)
TMH Modulär hjärnbarksmodell Cell Minikolumn Hyperkolumn
TMH IBM BlueGene/L
TMH Simulering av hjärnbarken i råtta • Egen simuleringsprogramvara (”SPLIT”) • Blue Gene/L (IBM Rochester) • 2048 processorer (1/32 av maskinen) • Simuleringsstorlek • 9,5 miljoner nervceller (1/6 av full skala) • 5 miljarder synapser (1/100 av full skala) • 1:100 av realtid • inofficiellt världsrekord
Slut TMH