1 / 15

Lektion 12: Bio- og beregningsteknologi

Lektion 12: Bio- og beregningsteknologi. Beregningsteknologi for avlsværdiskøn Betydning af kunstig sædoverføring for beregning af avlsværdiskøn Transgenese og transgene dyr Anvendelse af DNA-markører for sygdomsgener Påvisning af sygdomsgener eller QTL'er.

reid
Download Presentation

Lektion 12: Bio- og beregningsteknologi

An Image/Link below is provided (as is) to download presentation Download Policy: Content on the Website is provided to you AS IS for your information and personal use and may not be sold / licensed / shared on other websites without getting consent from its author. Content is provided to you AS IS for your information and personal use only. Download presentation by click this link. While downloading, if for some reason you are not able to download a presentation, the publisher may have deleted the file from their server. During download, if you can't get a presentation, the file might be deleted by the publisher.

E N D

Presentation Transcript

  1. Lektion 12: Bio- og beregningsteknologi • Beregningsteknologi for avlsværdiskøn • Betydning af kunstig sædoverføring for beregning af avlsværdiskøn • Transgenese og transgene dyr • Anvendelse af DNA-markører for sygdomsgener • Påvisning af sygdomsgener eller QTL'er

  2. De vigtigste beregningsmetoder for avlsværdiskøn • Selektionsindeks (SI) • Best Linear Prediction (BLP) • Best Linear Unbiased Prediction (BLUP) • Animal Model (AM)

  3. Betydning af kunstig sædoverføring for beregning af avlsværdiskønForudsætninger for avlsværdi bestemmelser • Standardiserede Miljøforhold • Forsøgsstation eller korrektion for miljø • KS giver forudsædninger for ligestilling, idet en tyr eller en orne får afkom i mange forskellige besætninger

  4. Betydning af kunstig sædoverføring for beregning af avlsværdiskøn • Sikker bestemmelse (store familier) • Uafhængig af ejerforhold • Sammenlignelige • Øget selektionsintensitet og sikkerhed rIA ved KS og Superovulation

  5. Transgenese og transgene dyr • Genkonstrukter • Metoder til genoverførsel • Produktionsmæssige motiver for transgenese. • Andre motiver for transgenese

  6. Genkonstrukter • Promoter (regulator-sekvenser) • Strukturgen (DNA koden for et protein)

  7. Metoder til genoverførsel • Mikroinjektion af DNA i hanlig forkerne • Embryonale stamceller og homolog rekombination • Mikroinjektion eller anden form for genoverførsel i føtale celler

  8. Motiver for transgenese? • Effekt 4A • Nye metabolske egenskaber • Lægemidler • Organdonation

  9. Eksempel på anvendelse af DNA-markører for sygdomsgener DNA-markører (A,B) indenfor familie * = sygdomsgen, + = normalt gen

  10. Påvisning af DNA-markør koblet til sygdomsgener eller QTL'er • Genomet er ca. 3000 centi Morgan (cM) • En markør dækker 20 cM • 150 DNA markører kræves til analyse af en given udspaltning • Ca. halvdelen af markørene er informative, så der skal anvendes ca. 300 i alt

  11. Egnet familiemateriale til påvisning af sygdomsgen • Familiestørrelse ca. 50 til analyse • Mindst 10 til 15 syge • Bedste forhold mellem syg og rask er 1:1 • De overskydende raske udelades tilfældigt Genotype syg ikke syg Total aa 20 3 23 ikke aa 4 23 27 Total 24 26 50

  12. Egnet familiemateriale til påvisning af QTL’er • Familiestørrelse skal være flere tusinde • Man ved ikke på forhånd om der er et QTL • Der kan anvendes sire eller grand-sire design • F2 dyr i forbindelse med eksotiske krydsninger

  13. Sire design eller Grand-sire design • QTL estimation • Grand sire design Effekt måles på afkom avlsværdier • Sire design Effekt måles på afkom phenotyper • Markør typning sker i begge tilfælde på forældre og afkom

  14. Sire design eller Grand-sire design, grafisk forsøgsdesign

  15. Sire design eller Grand-sire design, forsøgsstørrelse Mindste signifikante forskel (LSD) i sygdomsfrekvens for afkom med A1 og afkom med A2 Antal A1 Antal A2 S.D. LSD for sygdomsfrekvens 5000 5000 0,0060 1,8 % enheder 500 500 0,0190 5,7 % enheder 100 100 0,0420 12,6 % enheder Antal syge  bin(N;0,10,9/N)

More Related