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Metilazione del DNA

Metilazione del DNA. Nei vertebrati la metilazione interessa solamente la Citosina sul dinucleotide CpG : l’enzima citosina metiltransferasi aggiunge un gruppo metile al C 5 della citosina:il risultato è la 5-metilcitosina. Human Molecular Genetics 2. Metilazione del DNA.

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Metilazione del DNA

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Presentation Transcript

  1. Metilazione del DNA Nei vertebrati la metilazione interessa solamente la Citosina sul dinucleotide CpG: l’enzima citosina metiltransferasi aggiunge un gruppometile al C5 della citosina:il risultato è la 5-metilcitosina. Human Molecular Genetics 2

  2. Metilazione del DNA • Le sequenze CpG sono sotto-rappresentate nel genoma (probabilmente per la tendenza della 5-metilcitosina a venire deaminata e mutata in T) • ma abbondanti nelle regioni promotrici dei geni

  3. In cellule non embrionali, 80% dei CpG sono metilati, ad eccezione delle isole CpG dei promotori • Dnmt1 ha particolare affinità per le sequenze emi-metilate: tende quindi a metilare il nuovo filamento che si è formato su uno stampo metilato-> mantenimento del pattern di metilazione

  4. Corepressori HDAC 1 HDAC 2 MeCP2 Repres. CH3 CH3 CH3 CH3 Deacetilazione delle lisine di H3 e H4

  5. Metilazione e regolazione genica: • Dnmt metilano il DNA • Il DNA metilato è legato da proteine che legano il metile (MeCP2, MBD1-4) • Queste a loro volta sono in grado di reclutare diversi HDAC -> repressione della trascrizione

  6. Inibitori delle HDAC: una nuova terapia anti-cancro • Diverse sostanze che causano differenziamento, arresto della crescita e/o apoptosi di cellule trasformate -> inibitori di HDAC (es. DMSO, Tricostatina A (TSA), butirrato) • Questi inibitori causano arresto del ciclo cellulare in G1 o G2, differenziamento e/o apoptosi in vitro, documentati in tutti i tipi cellulari trasformati incluse linee cellulari derivate sia da tumori ematologici (leucemie, linfomi, mielomi) che epiteliali (tumore dei polmoni, delle ovaie, del seno, della prostata) • Le concentrazioni biologicamente attive correlano con quelle richieste per causare accumulazione di istoni acetilati

  7. SI IGNORA quali siano gli HDAC la cui attività deve essere bloccata • Gli inibitori causano aumento dell’ acetilazione sugli istoni (H2A, H2B, H3 e H4) anche in cellule normali, ma l’attività di soppressione della crescita sembra essere limitata alle cellule trasformate. • Geni bersaglio: • CDKN1A (codificante per l’inibitore dell’attività cinasica ciclina-dipendente p21/WAF1) (tramite un sito di SP1 sul promotore) • CDKN2A (p16) • Ciclina E

  8. Ingestione di fibre vegetali non digeribili Nella parte terminale dell’intestino vengono usate come fonte di energia da batteri simbionti Formazione di acido butirrico come prodotto CH3CH2CH2COOH

  9. Costituisce la fonte energetica primaria delle cellule del colon

  10. La metilazione del promotore e' uno dei meccanismi principali coinvolti nell'inattivazione di geni oncosoppressori Nel 10% dei tumori colorettali sporadici e’ inattivato il gene responsabile della sintesi di una proteina addetta al “mismatch repair” (MLH1) Mismatch repair : riparo di una coppia di basi male appaiata Es. T/G probabilmente a causa di una mutazione

  11. Cellule tumorali del colon mostrano una ipermetilazione del Promotore di MLH1 che e’ cosi inattivo Trattamento combinato con 5-azadeossicitidina e butirrato Ipometilazione di MLH1 Espressione del gene che codifica per MLH1 Apoptosi

  12. Normale DAF Tumorale DAF DAF DAF DAF La presenza di DAF nelle cellule tumorali del Colon rende inefficace il sistema del Complemento

  13. EFFETTO DEL BUTIRRATO SUL mRNA di DAF

  14. EFFETTO DEL BUTIRRATO SULLA PROTEINA DAF

  15. EFFETTO DEL BUTIRRATO SULL’ATTACCO DEL COMPLEMENTO

  16. EFFETTO DEL BUTIRRATO SUL PROMOTORE di DAF

  17. EFFETTO DEL BUTIRRATO SULLA STABILITA’ DEL mRNA di DAF

  18. Cellule tumorali del colon sembrano avere una ipometilazione Di RB1 (una proteina regolatrice del ciclo cellulare)

  19. Il butirrato aumenta la metilazione di RB1

  20. Quali sono i mediatori?

  21. Kruppel-like factor-4 (KLF4/GKLF) e’ un fattore di trascrizione che mostra proprieta’ simili a quelle del butirrato in cellule del colon

  22. -Il butirrato aumenta l’mRNA di KLF4 -Questo aumento e’ dovuto ad una maggiore attivita’ del promotore -HDAC (Istone Deacetilasi) inibisce questo aumento

  23. Acetilazione del promotore KLF4 Fibre alimentari Butirrato KLF4 Apoptosi

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