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Bendita tú eres entre todas las enzimas…. ATP-sintasa. Estructura de la ATP-sintasa. Matriz mitocondrial. Membrana mitocondrial interna. …danos hoy nuestro ATP de cada día.
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Bendita tú eres entre todas las enzimas…. ATP-sintasa
Estructura de la ATP-sintasa Matriz mitocondrial Membrana mitocondrial interna …danos hoy nuestro ATP de cada día
Con nuestros conocimientos de la ATP-sintasa (y nuestros desconocimientos) quisimos modelar el funcionamiento de esta enzima a partir de lo aprendido acerca de ratchets, específicamente el de la quinesina de una cabeza. ¿Qué quisimos hacer? • Potencial dado por las cargas negativas del anillo • Entrada de protones que apaga el potencial • Asimetría del potencial dada por distintos sitios de anclaje a la membrana
Distintas corridas de lo mismo… E= 0.346 E= 0.3313 E =0.339 E= 0.291
Modificando los tiempos de difusión… T=6 T=8 E = 0.144 E= 0.167
Modificando la asimetría del potencial… Potencial menos asimétrico Potencial simétrico E = 0.018 E= -0.005
Modificando el dx… dx= 8 E= 0.014
Pudimos determinar un tiempo óptimo de difusión. • Realizando varias corridas del mismo ratchet, observamos que se obtenían resultados similares • Modificando el tiempo de difusión respecto del óptimo (aumentándolo y disminuyéndolo), la asimetría del potencial y el dx, disminuye la eficiencia Resultados
Nos parece que el modelo de trinquete difusivo de la quinesina de una cabeza se aplica bastante bien al funcionamiento de la ATP-sintasa. Sin embargo, la eficiencia no nos parece muy alta. Las modificaciones efectuadas (tiempo de difusión, simetría,etc) disminuían la eficiencia, como era de esperar de acuerdo a lo aprendido para este tipo de ratchet. Sin embargo… Existen algunas diferencias entre el modo de funcionamiento real de la ATP-sintasa y lo planteado por nosotros en la práctica…. Conclusiones
La verdad de la milanesa… • Las cargas negativas impiden la rotación hacia la membrana hidrofóbica (potencial) • La entrada de protones apaga el potencial. • Distinta probabilidad de entrada de protones a cada canal, debido a la diferente concentración de protones (potencial asimètrico)
Agradecimientos… • A Julio Washington… • A Mari por la picada…