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glicina. quimotripsina. Os átomos envolvidos na ligação peptídica se-encontram no mesmo plano: w =180 o (trans) ou 0 o (cis). Os ângulos f (phi) e y (psi) tem “livre” rotação. Algumas combinações dos ângulos (phi) e y (psi) não são permitidas. Colisões estéricas
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glicina quimotripsina
Os átomos envolvidos na ligação peptídica se-encontram no mesmo plano: w=180o (trans) ou 0o (cis) Os ângulos f (phi) e y (psi) tem “livre” rotação
Algumas combinações dos ângulos • (phi) e y (psi) não são permitidas. Colisões estéricas não-favoráveis
Alfa-hélice -groupos R situados por fora da hélice
Notar ligação de hidrogênio entre os grupos peptídicos do 1o e 4o Resíduo. É comum encontrar Pro e Gly nestas estruturas.
Valores de phi e psi para todos os aminoácidos (menos gly) para piruvato quinase de coelho.
Probabilidades relativas para encontrar um tipo de aminoácido numa determinada estrutura secundária
Colágeno: um triplo-hélice de cadeias com 3 aminoácidos por volta, helicoidal com sentido de mão esquerda, e super-helicoidal com sentido de mão direita. Composição: 35% gly, 11% ala, 21% pro ou hidroxi-pro. Com repetições gly-X-pro ou gly-X-hidroxi-pro
Colágeno: componente de tecido conectivo (tendão, cartilagem, matriz orgânica de osso)
Ligações covalentes entre moleculas de colágeno aumentam a resistência da fibra. 30 tipos diferentes de colágeno – tecido específico Osteogênese imperfecta: desenvolvimento anormal na infância Síndrome Ehlers-Danlos: articulações “frouxas”
Estrutura de fibroina de seda: estrutura folha beta antiparalela rica em ala e gly.
Dimensões de albumina sérica humana (585 aminoácidos, 64500 kDa)
Estrutura de mioglobina de baleia, uma proteína globular típica Topografia de superfície Fita (azul = Hf) modelo “space-filling”
O grupo heme (anel de protoporfirina E um ion de Fe2+/3+)
Determinação de estruturas de proteínas de alta resolução: Cristalografia por raios-X
Determinação de estruturas de proteínas de alta resolução: R.M.N. = resonância magnética nuclear.
Domínios estruturais na proteína troponina C do músculo esquelético