1 / 27

Стандартная запись Swiss-Prot

Стандартная запись Swiss-Prot. Стандартные поля : entry, name, origin.

stone-larsen
Download Presentation

Стандартная запись Swiss-Prot

An Image/Link below is provided (as is) to download presentation Download Policy: Content on the Website is provided to you AS IS for your information and personal use and may not be sold / licensed / shared on other websites without getting consent from its author. Content is provided to you AS IS for your information and personal use only. Download presentation by click this link. While downloading, if for some reason you are not able to download a presentation, the publisher may have deleted the file from their server. During download, if you can't get a presentation, the file might be deleted by the publisher.

E N D

Presentation Transcript

  1. Стандартнаязапись Swiss-Prot

  2. Стандартные поля: entry, name, origin Название записи, уникальный идентификатор (ID), предыдущие идентификаторы соответствующей записи, даты первой и последней модификаций, распространенное название белкаи его синонимы (EC номер для ферментов), название гена, организм и его таксономия, уровень подтверждения

  3. Enzyme (ферменты)http://enzyme.expasy.org/EC/2.7.10.1

  4. NiceZyme Viewhttp://www.icp.ucl.ac.be/~opperd/lysozyme00/results/enzyme-search-ec.html

  5. UniProt - Taxonomy http://www.uniprot.org/taxonomy/9986

  6. Ссылки на статьи, использованные для аннотации

  7. Комментарии

  8. Возможные разделы комментариев

  9. Cross-References

  10. Cross-References регистрация

  11. 3D-Structure (список структур)

  12. Reactome - курируемая база знаний биологический путей http://www.reactome.org/ReactomeGWT/entrypoint.html http://www.genomeknowledge.org/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=177934

  13. GO terms Определение термина, синонимы, родительские (Hierarchy) и дочерние термины, ключевые слова, дата последней модификации Поиск гена или его продукта, BLAST, поиск по GO ID, просмотр онтологии http://www.geneontology.org/

  14. Cross-References, Keywords

  15. KEGGKyoto Encyclopedia of Genes and Genomeshttp://www.genome.jp/kegg/

  16. KEGG (pathway viewer)

  17. DrugBank

  18. UniProt http://www.uniprot.org/

  19. http://www.uniprot.org/uniprot/Q7M419

  20. Keywords

  21. Сервер Expasyhttp://www.expasy.org/

  22. Словарь ключевых словhttp://www.uniprot.org/docs/keywlist

  23. FASTA format Программа FASTA (1988,WR Pearson & DJ Lipman): >(the definition line)_уникальный_ID + короткое описание ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТЬ БЕЛКА (ИЛИ ДНК) В ОДНОБУКВЕННОМ КОДЕ RAW format – без definition line

  24. PDB Базы данных На 22.02.2011

  25. OCA Базы данных

More Related