NAV avlsværdital for Holdbarhed Jørn Pedersen og Anders Fogh

1. NAV avlsværdital for HoldbarhedJørn Pedersen og Anders Fogh Projektgruppen Jørn Pedersen Jan-Åke Eriksson, Minna Toivonen, JukkaPösö Ulrik S. Nielsen og Gert P. Aamand

2. Oversigt • NAV-holdbarhedsprojektet • Hvilke data indgår – og hvordan • Model, heritabiliteter, genetiske korrelationer • Resultater, ændringer • Base • Udvikling over tid (trends) • Korrelationer mellem det gamle og nye indeks • Relation til andre egenskaber • Værdi i NTM

3. Tidligere anvendte holdbarhedsmodeller • DNK, FIN: Funktionel holdbarhed = ydelseskorrigeret Overlevelsesmodel (“Survival KIT”) • SWE: Produktiv holdbarhed = ikke korrigeret for ydelse Lineær model med 3 egenskaber: • Overlevelse til 2. laktation – enten-eller egenskab • Overlevelse til 3. laktation – enten-eller egenskab • Overlevelse til 4. laktation – enten-eller egenskab

4. Projektgruppens opgaver • Formål: Udvikling af NAV avlsværdital for holdbarhed • 3 race grupper: RDC, HOL(+DRH), JER • Ens model for alle 3 lande • Ens genetiske parametre for alle 3 lande • Produktiv holdbarhed dvs. ukorrigeret for ydelse

5. Opgaver i projektet • Definition af egenskaben (projektgruppen) • Model • Beregning af genetiske parametre Heritabiliteter– genetiske og miljømæssige korrelationer • Analyser • “Rekursiv” - proces

6. Holdbarhedsegenskaber • DAGE11: Dage fra 1. kælving til slutningen af 1. laktation (informationsegenskab) • DAGE12: Dage fra 1. kælving til slutningen af 2. laktation (informationsegenskab) • DAGE13: Dage fra 1. kælving til slutningen af 3. laktation (avlsværdi) • DAGE14: Dage fra 1. kælving til slutningen af 4. laktation (informationsegenskab) • DAGE15: Dage fra 1. kælving til slutningen af 5. laktation (informationsegenskab) Maximalt 365 dage per laktation er inkluderet 365 dage per laktation, hvis koen overlever til næste laktation (dvs. ingen ”straf” for god frugtbarhed) DAGE13 er den avlsværdi, som bliver omregnet til et indeks og bliver publiceret

7. Edit of data Oplysninger om kælvninger og afgange kombineres • Kun 1. til 5. laktation anvendes • Køer, der indgår, har kælvet efter 1.1.1985 for DNK og SWE - og efter 1.1.1988 for FIN • Alle køer skal starte med en 1. kælvning • Alle kælvninger/laktationer, som indgår skal være fra samme besætning • Efter besætningsskift anses observationerne for at være manglende (det der er i orden slettes ikke) • Alder ved 1. kælvning skal ligge mellem 450 og 1280 dage • Køer med ukendt fødselsdato indgår ikke

8. “Opportunity” perioderEksempel: Hvis en ko afgår efter 20 dage i en laktation indgår oplysningen IKKE før den har haft mulighed for at leve 365 dage “Opportunity” perioder • DAGE11: Oplysning anvendes først 365 dage efter 1. kælvning • DAGE12: Oplysning anvendes først 365 dage efter 2. kælvning • DAGE13: Oplysning anvendes først 365 dage efter 3. kælvning • DAGE14: Oplysning anvendes først 365 dage efter 4. kælvning • DAGE15: Oplysning anvendes først 365 dage efter 5. kælvning Vigtig oplysning: • Dato for dataudtræk • Dato for besætningsophør (dato for sidst kendte 1. kælvning)

9. Gennemsnit for HOL, RDM og JER med1. kælvning 2000-2004

10. Animal Model Multi-trait med 5 egenskaberEffekter i modellen • Alder ved 1. kælvning • Kælvningssæson (år x måned - 1. kælvning) • Besætning x 5 års periode (år for 1. kælvning) • Heterosiseffekter (mange hos RDM/RDC) • Genetiske grupper modelleret som fantom forældre (race x tid) • Besætning x 1. kælvningsår (tilfældig) • Ko (tilfældig genetisk effekt)

11. Genetiske parametreHeritabiliteter

12. Holstein genetiske korrelationerRDM og JER: Næsten samme resultater

13. Oversigt – hvor er vi nået til • NAV-holdbarhedsprojektet • Hvilke data indgår – og hvordan • Model, heritabiliteter, genetiske korrelationer • Resultater, ændringer • Base: Generel ændring – tidsuafhængig • Trends: Generel ændring – tidsafhængig • Korrelationer: Individuelle ændringer • Relation til andre egenskaber • Værdi i NTM

14. Base ændringerTidligere: Tyre født 15.8.2002 – 15.8.2004August 2010: Køer født 15.8.2005 – 15.8.2007 Skyldes IKKE den nye model

15. Holstein – udvikling i holdbarhedsindeks

16. RDM – udvikling i holdbarhedsindeks

17. Jersey – udvikling i holdbarhedsindeks

18. Korrelationer mellem det gamle og det nye holdbarhedsindeks pr. årTyre født 1997-2003

20. Korrelationer pr. årgang: Individuelle ændringerHvorfor så lave korrelationer? • FIN, DNK: • Ikke ydelseskorrigeret holdbarhed • Lineær model versus ”overlevelse” – tidlig afgang lidt tæller mere • SWE: • Dage baseret – versus enten-eller • Dage baseret mod laktationsbaseret (den gamle svenske model havde stor sammenhæng med frugtbarhed) • Lidt lavere korrelationer i DNK - end i FIN og SWE • Mange faktorer – ikke en enkelt afgørende faktor

21. RDC: Korrelationer med andre indekserGns. pr. år i perioden 1997-2003

22. Korrelationer mellem ny holdbarhed og andre egenskaberTyre født 1997-2003

23. Standardisering af variationTyre født 1997-1998

24. Værdi af holdbarhedindeks i NTMBasal økonomisk værdi er ikke påvirket (kr./dag) Hvordan kan en ændret metode ændrer værdi/vægt: • Ændret definition af egenskaben: Principielt uændret • Ændret indhold af en indeksenhed (standardisering af variationen) • Specielt for holdbarhed: Overførslen af værdi til Yversundhed, Andre sygdomme, Frugtbarhed, Malkeorganer og Lemmer&klove Beslutning: Uændret vægtning (0.11, 0.08, 0.12 for HOL+DRH, RDM og JER)

25. Afslutning: NAV-holdbarhed Ny fælles model er udviklet • Baseændring – skyldes IKKE den nye model • Store ændringer i genetisk fremgang • Lidt store individuelle ændringer Fremtidsplaner • Evt. overlevelsesmodel

26. Anerkendelse Det Europæiske Fællesskab og Fødevareministeriet ved Direktoratet for FødevareErhverv har deltaget i finansieringen af denne aktivitet. DNA-ordog