1 / 20

SRS – Sequence Retrieval System PIR – Protein Information Resource

SRS – Sequence Retrieval System PIR – Protein Information Resource. כלים אינטגרטיביים לאיתור ועיבוד נתונים. עד כה עסקנו בכל שעור בנושא נפרד, והיכרנו כלי/כלים ייחודיים לו.

thor-bradshaw
Download Presentation

SRS – Sequence Retrieval System PIR – Protein Information Resource

An Image/Link below is provided (as is) to download presentation Download Policy: Content on the Website is provided to you AS IS for your information and personal use and may not be sold / licensed / shared on other websites without getting consent from its author. Content is provided to you AS IS for your information and personal use only. Download presentation by click this link. While downloading, if for some reason you are not able to download a presentation, the publisher may have deleted the file from their server. During download, if you can't get a presentation, the file might be deleted by the publisher.

E N D

Presentation Transcript

  1. SRS – Sequence Retrieval System PIR – Protein Information Resource כלים אינטגרטיביים לאיתור ועיבוד נתונים

  2. עד כה עסקנו בכל שעור בנושא נפרד, והיכרנו כלי/כלים ייחודיים לו. במהלך אנאליזה ביואינפורמטית אנו מעוניינים לעיתים תכופות לקבץ /רשומות נתונים בעזרת שיטה אחת ואח"כ להמשיך לנתח או לאפיין נתונים אלה באמצעות כלים נוספים. כלים אינטגרטיביים, בהם ה-output של שלב א' מהווה בסיס ל-input של השלב הבא, יכולים לפשט את תהליכי הניתוח ולהקל על המשתמש, במיוחד כשיש שפע נתונים. היום נציג כלים/ממשקים המאפשרים לנו חשיפה למספר כלי ניתוח נפוצים ונותנים לנו שליטה בפרמטרים השונים של כלים אלה.

  3. SRS (EBI) Quick search: allows to choose sets of libraries, does not allow search of specific fields

  4. More info (release details) Broad categories

  5. Search combinations of databases (affects choice of fields to be searched Not enough?

  6. Search some fields and present others Specific fields to be searched Choose fasta (?) What does the search form allow to do?

  7. Link to entry All other entries: seq length 291-346 Initial output What was the search phrase? Query’s syntax

  8. The output of the initial search step can serve as the input for the next analysis.

  9. Alphabetical list of all tools

  10. Following the selection of the analysis tool you can select the analysis parameters

  11. More options to control software

  12. Crambin A very short protein – hopefully, this will result in shorter waiting periods for the results and will simplify your comparisons. עבודת צוות

More Related