Candidat au poste de physicien adjoint pour le SOERE MOOSE

1. Léo Berline Candidat au poste de physicien adjoint pour le SOERE MOOSE Mediterranean Ocean Observing System on Environment Affectation demandée: Observatoire Océanologique de Villefranche-sur-mer

2. Projet de recherche Projet d’enseignement Parcours Projet d’observation Ingénieur agronome 1998-2001 ENSA Rennes Aix Marseille II 2002 DEA Sciences de l’environnement marin Modéliser le couplage hydrodynamique-biogéochimie Observer l’évolution à long terme des communautés zooplanctoniques Doctorat (2003-2005) Océan Atlantique Nord Post-Doctorat (2008-2009) Méditerranée Projet MERSEA-FP7 Projet SESAME-FP7 LOV Villefranche G. Gorsky, L. Stemmann LEGI/MEOM Grenoble P. Brasseur, J. Verron Post-Doctorat (2006-2007) Océan Arctique Projet SNACS-NSF Oregon State University (USA) Y. Spitz Observer et modéliser les distributions du plancton Post-Doctorat (2010-2013) M.I.O. B. Zakardjian, A Doglioli LOVVillefranche G. Gorsky Post-Doctorat Distribution et transport de zooplancton Méditerranée Projets Jellywatch, MedAzur, COCONET Post-Doctorat (2014-) ENS Paris, S Speich LOVVillefranche, L. Stemmann Post-Doctorat Distributionsplanctoniques globales Projet OCEANOMICS-TARA

3. Projet de recherche Projet d’enseignement Parcours Projet d’observation Ingénieur agronome 1998-2001 ENSA Rennes Aix Marseille II 2002 DEA Sciences de l’environnement marin Modéliser le couplage hydrodynamique-biogéochimie Observer l’évolution à long terme des communautés zooplanctoniques Doctorat (2003-2005) Océan Atlantique Nord Post-Doctorat (2008-2009) Méditerranée Projet MERSEA-FP7 Projet SESAME-FP7 • 15 articles rang A (6 en 1er auteur) +1 en révision • 10 conférences internationales • 3 campagnes en mer • 1 projet financé (MedAzur II) • 7 étudiants encadrés ou co-encadrés LOV Villefranche G. Gorsky, L. Stemmann LEGI/MEOM Grenoble P. Brasseur, J. Verron Post-Doctorat (2006-2007) Océan Arctique Projet SNACS-NSF Oregon State University (USA) Y. Spitz Observer et modéliser les distributions du plancton Post-Doctorat (2010-2013) M.I.O. B. Zakardjian, A Doglioli LOVVillefranche G. Gorsky Post-Doctorat Distribution et transport de zooplancton Méditerranée Projets Jellywatch, MedAzur, COCONET Post-Doctorat (2014-) ENS Paris, S Speich LOVVillefranche, L. Stemmann Post-Doctorat Distributionsplanctoniques globales Projet OCEANOMICS-TARA

4. Projet de recherche Projet d’enseignement Parcours Projet d’observation Contexte • Challenges (Mermex Group, PiO 2011) • Réchauffement et circulation thermohaline • Modificationde lastoechiométrie, acidification • Modificationde la pompe biologique • Modification de la biodiversité Nécessite suivi de l’ensemble des compartiments - > Problématique européenne (JERICO, GROOM) Bloom dans panache du Rhône Bloom dans zone de convection Auger et al PiO 2014: Fluctuations interannuelles se répercute sur le zooplancton

5. Projet de recherche Projet d’enseignement Parcours Projet d’observation Réponse du plancton au climat Matériel et méthode: Série temporelle côtière de zooplancton (groupes taxonomiques) Variables environnementales (T, S, Chl-a) Analyses multivariées Résultats: Evolutions des forçages environnementaux (salinité-proxy mélange hivernal) Réponses communes des communautés zooplanctoniques Abondance zooplancton Production primaire Apport de nutriment Convection hivernale Densité + Salinité - Précipitations Garcia-Comas et al JMS 2011 Vandromme et al BG 2012

6. Projet de recherche Projet d’enseignement Parcours Projet d’observation Facteur pas transposable aux autres stations côtières Réponse du zooplancton au climat Matériel et méthode: Six séries temporelles côtières de zooplancton (groupes taxonomiques) Variables environnementales (T, S, Chl-a) Analyses multivariées Projet SESAME-FP7 Résultats: Evolutions communes de certains forçages environnementaux (température) Réponses hétérogènes des communautés zooplanctoniques Collaboration IEO(ES), SZN(IT), UTrieste(IT), IOF(CR), HCMR (GR) Berline et al PiO 2012

7. Projet de recherche Projet d’enseignement Parcours Projet d’observation Courant Nord Vent 0 1 Proba d’échouage 2 Indice densité Ferraris et al, JPR 2012 Transport large – côte de méduses Pelagia noctiluca Matériel et méthode: Suivi des distributions spatiales (campagnes en mer) Modèle de circulation océanique haute résolution Modélisation lagrangienne du transport des méduses Projet Jellywatch Résultats: Au large: abondances localisées dans le courant Nord A la côte: probabilité d’échouage fonction de position du courant et vent Observations Simulations Collaboration LOV, M.I.O. Berline et al, MPB 2013

8. Projet de recherche Projet d’enseignement Parcours Projet d’observation Le SOERE MOOSE • Objectif: • suivre l’ensemble des composantes de l’écosystème de la Méditerranée Occidentale, de l’hydrologie aux organismes, à long terme et de manière intégrée • SOERE depuis 2010, complémentaire réseaux côtiers SOMLIT et RESOMAR Biodiversité-écologie WP4 Forçages Atmosphère-océan (WP5) Terre-océan(WP2) Biogéochimie WP3 Hydrodynamique WP1 Modélisation, base de données programme MISTRALS (INSU), projets MerMex, CharMex, HyMex

9. Projet de recherche Projet d’enseignement Parcours Projet d’observation MOOSE: échantillonnage Radiale glider Campagne annuelle MOOSE-GE Campagne mensuelle Lignes de mouillage Pièges

10. Projet de recherche Projet d’enseignement Parcours Projet d’observation MOOSE: organisation

11. Projet de recherche Projet d’enseignement Parcours Projet d’observation Suivi de la biodiversité dans MOOSE (WP4) • Enjeux • Biogéochimie, ressources marines et séquestration du carbone dépendent des organismes du plancton: bactérie, phytoplancton, zooplancton Biodiversité-écologie WP4 Forçages Air-mer (WP5) Terre-mer (WP2) Biogéochimie WP3 Hydrodynamique WP1 Modélisation, base de données

12. Projet de recherche Projet d’enseignement Parcours Projet d’observation Suivi de la biodiversité dans MOOSE (WP4) • Enjeux • Biogéochimie, ressources marines et séquestration du carbone dépendent des organismes du plancton: bactérie, phytoplancton, zooplancton Effort d’échantillonnage Biodiversité-écologie 100 profils Forçages Air-mer (WP5) Terre-mer (WP2) Biogéochimie 1000 profils Hydrodynamique 10000 profils Modélisation, base de données

13. Projet de recherche Projet d’enseignement Parcours Projet d’observation Suivi de la biodiversité dans MOOSE • Compartimentsdifficiles à étudier macroplancton mesozooplancton microplancton Organismes cibles Pro & Syn* nanoplancton bacteries pico-euK* Taille (µm ESD) Instruments de mesure in situ UVP, LOPC LISST Filet 20/50 µm Filet 200 µm Filet 680 µm Bouteille Niskin Engins de pêche Instruments d’analyse au labo Cytométrie en flux Microscopie inversée ZooScan FlowCAM

14. Projet de recherche Projet d’enseignement Parcours Projet d’observation Tâche de service: instrumentation • Les atouts de MOOSE • Technologies innovantes pour identification/quantification des organismes in situ et au laboratoire • Imagerie: FlowCAM, ZooScan, UVP • Optique: LISST, LOPC • Traitement automatisé, homogénéité, haute résolution spatiale JERICO(FP7) Deliverable Methodologies on biodiversity observation

15. Projet de recherche Projet d’enseignement Parcours Projet d’observation Tâche de service: instrumentation • Les atouts de MOOSE • Technologies innovantes pour identification/quantification des organismes in situ et au laboratoire • Imagerie: FlowCAM, ZooScan, UVP • Optique: LISST, LOPC • Traitement automatisé, homogénéité, haute résolution spatiale FlowCAM 20µm-1mm ZooScan 200µm-5cm UVP 100µm-5cm Berline et al JPR 2012, Vandromme et al MiO 2011 Roullier et al BG, accepté

16. Projet de recherche Projet d’enseignement Parcours Projet d’observation Tâche de service: échantillonnage • Les atouts de MOOSE • Infrastructure du réseau Campagne mensuelle Campagne annuelle

17. Projet de recherche Projet d’enseignement Parcours Projet d’observation Suivi de la biodiversité dans MOOSE • Le manque: nécessite personne dédiée à cette tâche de service • poste CNAP ? Forçages Air-mer (WP5) Terre-mer (WP2) Biogéochimie Hydrodynamique Modélisation, base de données

18. Projet de recherche Projet d’enseignement Parcours Projet d’observation Tâche de service: définition 1/2 • Définition des protocoles et méta données, formation des personnels IT • Supervision des analyses ZooScan, FlowCAM • Développement de boites à outil de traitement Matlab • Coordination, contrôle qualité • Intercalibration des instruments (UVP-ZooScan, UVP-UVP)

19. Projet de recherche Projet d’enseignement Parcours Projet d’observation Tâche de service: définition 2/2 • Rapports internes et publications • Conférences nationales et internationales (CIESM, ASLO) • Ateliers de travail avec les réseaux côtiers SOMLIT et RESOMAR

20. Projet de recherche Projet d’enseignement Parcours Projet d’observation Gyre Nord Rôle du transport sur la distribution et les fluctuations du zooplancton 1) Distribution spatiale dans Gyre Nord 2) Echanges large-côte en mer Ligure Copépodes

21. Projet de recherche Projet d’enseignement Parcours Projet d’observation Gyre Nord Rôle du transport sur la distribution et les fluctuations du zooplancton 1) Distribution spatiale dans Gyre Nord Hypothèse: Espèces sont distribuées selon i) environnement local et ii) redistribution par circulation Méthodes: Modèle de circulation océanique SYMPHONIE (M.I.O.) Simulations lagrangiennes et régionalisation Echantillons filets MOOSE-GE - ZooScan Retombées: Distribution spatiale d’espèces clefs du zooplancton Représentativité du suivi MOOSE Espèces ciblées Calanus helgolandicus, Pleuromamma spp, Euchirella rostrata

22. Projet de recherche Projet d’enseignement Parcours Projet d’observation Emprise radar Glider Rôle du transport sur la distribution et les fluctuations du zooplancton 2) Echanges large-côte en mer Ligure Hypothèse: Les échanges côte-large modifient les communautés zooplanctoniques côtieres (Point B) Méthodes: Données courantométriques radar HF (M.I.O.) Echantillonnage filet Point B et Dyfamed – ZooScan Retombées: Contribution du transport aux fluctuations locales Fluctuations à haute fréquence (journalière) Genres ciblés Centropages, Clausocalanus, Temora

23. Projet de recherche Projet d’enseignement Parcours Projet d’observation Insertion dans contexte national et international MOOSE International OOV-LOV M.I.O. Equipe Ecologie Zooplancton Equipe biogéochimie Phytoplancton Equipe physique Modélisation et radar Espagne (IEO), Italie (SZN, La Spezia), Tunisie (U Bizerte) Zooplancton et phytoplancton Equipe plancton Equipe biodiversité Equipe optique Thématiques: End to End Connectivité planctonique ENSTA Modélisation Actuel : JERICO(FP7) Futur : AO H2020 BDD COPEPOD MERMEX PERSEUS PlankMed MERMEX

24. Projet de recherche Projet d’enseignement Parcours Projet d’observation Expérience + Encadrement stagiaires et doctorants (7)

25. Projet de recherche Projet d’enseignement Parcours Projet d’observation Expérience Projet Master Océanographie et Environnement marin

26. Candidature Léo Berline Tâche de service: suivi de la biodiversité planctonique Connaissance des instruments: ZooScan et UVP, identification et analyse des données Capacité de coordination scientifique Collaborations pour la valorisation Projet de recherche: Rôle du transport sur la distribution et les fluctuations du zooplancton Méthodologie: Combinaison observations in situ et modélisation lagrangienne Originalité: Valorisation maximale des données in situ Collaborations MOOSE et internationale Enseignement Expérience: Vacations (67h) et encadrement étudiants (7) Projet: Master Océanographie Environnement Marin de l’UPMC Traitement des données UVP et ZooScan, Analyses multivariées, Modélisation lagrangienne

28. MOOSE: échantillonnage • Participants: OOV-LOV, Pytheas-M.I.O, OOB, CEFREM, LOCEAN, L.A., Ifremer, OMP

29. Contexte- état de l’art Pourquoi s’intéresser au zooplancton?

30. Contexte- état de l’art Pourquoi s’intéresser au zooplancton? Organisme Comportement Cycle de vie Carlotti et Poggiale 2010

31. Centropages, Clausocalanus, Temora Taxons ciblés Calanus helgolandicus, Pleuromamma spp, Euchirella rostrata

32. Connectivité Discrétisation Matrice de temps de transport Matrice de distance Régionalisation

33. Tâche de servicePlateforme d’imagerie • Equipe ITA • C Desnos, A Elineau • Réseau de spécialistes • Microscopie: • ZooScan: L Stemmann, S Gasparini, JL Jamet, … • FlowCAM: JL Jamet, …??

34. Tâche de servicePlateforme d’imagerie • Plateforme technique à l’OOV • Cytometrie (Maro) • Microscopie (Dolan) • FlowCAM, ZooScan (Elineau, Desnos) • logiciels et BDD (Picheral, Gouy) • Réseau d’experts taxonomiques • boucle microbienne (Pedrotti, Dolan) • phytoplancton (Jamet D, Lemée) • zooplancton (Jamet JL, Stemmann, Gasparini, Thibault Botha, Mousseau, Lombard)

35. Tâche de servicebudget • Zooscan: • FlowCAM: • Cytometre: • HPLC: • Temps bateau:15’ par trait de filet

36. Planning