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How you think How you work. REAXYS. Elsevier 教育訓練講師 劉惠賢 Karen Liu. REAXYS 化學資料庫簡介 收錄內容 & 界面更新 Searching in REAXYS 主題 1 : 化合物搜尋 主題 2 : 反應搜尋 主題 3 : 合成計畫 主題 4 : 文獻搜尋 Analyzing in REAXYS 視覺化分析工具 – Analysis View 多樣化結果輸出功能 – Enhanced Report 自動合成工具 – Autoplan Q&A. REAXYS 化學資料庫簡介.

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Presentation Transcript

  1. How you think How you work REAXYS Elsevier 教育訓練講師 劉惠賢 Karen Liu

  2. REAXYS化學資料庫簡介 • 收錄內容 & 界面更新 • Searching in REAXYS • 主題1 :化合物搜尋 • 主題2 :反應搜尋 • 主題3 :合成計畫 • 主題4 :文獻搜尋 • Analyzing in REAXYS • 視覺化分析工具 – Analysis View • 多樣化結果輸出功能 – Enhanced Report • 自動合成工具 – Autoplan • Q&A September 30, 2014 Slide 2

  3. REAXYS化學資料庫簡介 September 30, 2014 Slide 3

  4. REAXYS資料來源 400種常用 化學期刊 Advanced Synthesis Catalysis Journal of Organometallic Chemistry JACS; Synlett; Tetrahedron 無機及 有機金屬 化學資料庫 世界、美國、歐洲 專利資料庫 有機化學資料庫

  5. REAXYS資料擷取方式 September 30, 2014 Slide 5

  6. REAXYS化學資料庫內容革新 • 內容新增: • 內容將從原有的400本嚴選期刊及專利，擴充至16,000筆化學相關出版品！ 內容涵蓋學科領域已從核心化學到以下學科: Reaxys在2013年四月進行界面更新、內容新增及整併三大新功能，除了站穩化學資料庫之領導地位，更能全方位支援研究人員的工作流程! • 操作界面更新:新版搜尋介面依據不同使用者，建立不同搜尋路徑！ September 30, 2014 Slide 6

  7. REAXYS 聯結多種資料庫，資訊獲取更便利 為了讓使用者能容易查找相關資訊，Reaxys 聯結到許多Elsevier 內部或外部資料庫，讓使用更加便利。 • PubChem — 在Reaxys 介面在您搜尋資料結果時可以連到NCBI開放的資料庫，以獲取小分子生物活性資料。 • eMolecules —可以獲取國外原料藥的購買資訊，包含廠牌、容量與價格，以幫助“合成或購買”的決策過程。 • Reaxys Medicinal Chemistry —根據分子標靶、藥理作用和標靶相互作用數據之主要資料來篩選和優先考慮候選藥物 • PharmaPendium —深入臨床和臨床前數據，並能搜尋FDA內的藥品審查資訊及相關歷史資料。 • Scopus —享有使用重要的文獻計量學的資訊結果，包含引用資訊及期刊分析等。 • ScienceDirect — 可獲取Elsevier 文章和電子書全文資料下載及使用多種便利的應用程式。 September 30, 2014 Slide 7

  8. REAXYSHomepage 非結構搜尋（Names & Formulas）：可輸入化學名稱等方式來搜尋特定化合物，並可按下Physical、Spectra、Bio Activity及Natural Product加入附加搜尋條件。 依結構搜尋（Structures & Reactions）：可輸入化學結構來搜尋反應式、化合物及文獻，並可按下Reaction Data加入附加搜尋條件。 文獻搜尋（Literature）：可選擇欄位並輸入關鍵字來搜尋相關文獻。 附加搜尋條件設定 新版資料庫入口有三種入口： 依結構搜尋、非依結構搜尋及文獻搜尋，方便不同領域使用者選擇進入！ September 30, 2014 Slide 8

  9. SEARCH IN REAXYS September 30, 2014 Slide 9

  10. 主題 1 : 化合物搜尋_非依結構搜尋 非依結構搜尋：適用於初學者一開始進行化學搜尋或任何不易以畫結構方式做搜尋的分子，如：無機分子。 September 30, 2014 Slide 10

  11. 主題 1 :化合物搜尋_非依結構搜尋 September 30, 2014 Slide 11

  12. 主題 1 :化合物搜尋_依結構搜尋 依結構做搜尋：使用者可利用繪圖軟體繪製要搜尋的分子或反應式，或是藉由化合物名轉換成結構的方式做搜尋！ September 30, 2014 Slide 12

  13. 主題 1 : 化合物搜尋_依結構搜尋 搜尋項目：可使用繪圖軟體以結構的方式來搜尋反應、化合物及文獻。 若要增加搜尋條件可按下Physical、Spectra、Bio Activity及Natural Product加入附加搜尋條件。 反應搜尋條件：基本設定 另可依據化合物名稱、InChI-Key及Smiles來做搜尋。 September 30, 2014 Slide 13

  14. MarvinSketch Periodic System Template Library Reaxys Generics 利用MarvinSketch線上繪圖軟體繪製分子/試劑結構 September 30, 2014 Slide 14

  15. 主題 1 : 搜尋範例 - Thalidomide • Thalidomide是最早上市的非處方鎮定劑，很多國家曾用於懷孕婦女的噁心、嘔吐症狀，卻也造成在1960年代上千位畸形兒的產生，因此而聲名狼藉… 抗血管新生作用(Anti-angiogenesis Activity) (1) 血液腫瘤 (2) 多發性骨髓瘤(Multiple Myeloma) (3) 肝癌(Hepatocellular Carcinoma, H.C.C.) 不良反應 (1)致畸胎 (2)週邊神經病變 (3)副作用：嗜睡，暈眩等 最近幾年讓一些研究學者更感興趣的是Thalidomide的： 1.抗發炎作用(anti-inflamatory) 2.免疫調節(Immunomodulatory) 3.抑制血管增生(anti-angiogenic) 參考網站：http://www.tmn.idv.tw/cchtumor/drug/drug07.htm September 30, 2014 Slide 15

  16. 主題 1 : 化合物搜尋_Thalidomide September 30, 2014 Slide 16

  17. 主題 1 : 化合物搜尋_ SAHA September 30, 2014 Slide 17

  18. 主題 1 : 化合物搜尋_Thalidomide 輸出 Report September 30, 2014 Slide 18

  19. 主題 1 : 化合物搜尋_Thalidomide 多樣化結果輸出功能（Report）：只要有圖示處皆可輸出至Report， 如：搜尋條件、搜尋結果集合成計畫等。 September 30, 2014 Slide 19

  20. 主題3 : 合成計畫 - Thalidomide September 30, 2014 Slide 20

  21. 主題3 : 合成計畫 - Thalidomide September 30, 2014 Slide 21

  22. 主題3 : 合成計畫 - Thalidomide September 30, 2014 Slide 22 September 30, 2014 Slide 22

  23. 主題3 : 合成計畫 - Thalidomide September 30, 2014 Slide 23

  24. 主題 2 : 反應搜尋 啟用線上繪圖軟體MarvinSketch/Elemental來畫結構 搜尋項目：可使用繪圖軟體以結構的方式來搜尋反應、化合物及文獻。 另可依據化合物名稱、InChI-Key及Smiles來做搜尋。 搜尋：反應、化合物 & 文獻搜尋 反應搜尋條件 提供Elemental、MarvinSketch等讓使用者選擇繪製分子結構或反應的軟體；預設為MarvinSketch（需JAVA支援），可點擊空白處兩下以啟動。 September 30, 2014 Slide 24

  25. 主題 2 : 反應搜尋_Reaction Data September 30, 2014 Slide 25

  26. MarvinSketch Periodic System Template Library Reaxys Generics 利用MarvinSketch線上繪圖軟體繪製分子結構/反應式 September 30, 2014 Slide 26

  27. 主題 2 : 反應搜尋_Thalidomide • 沙利竇邁的合成 – Thalidomide 輸入化合物名稱Thalidomide並轉換成結構 September 30, 2014 Slide 27

  28. 主題 2 : 反應搜尋_Thalidomide 限縮項目：建議使用Analysis View以圖像的方式同時分析兩種欄位。 輸搜尋結果 September 30, 2014 Slide 28

  29. 主題 2 : 反應搜尋_Thalidomide September 30, 2014 Slide 29

  30. 視覺化分析工具 - Analysis View September 30, 2014 Slide 30

  31. 主題3 : 合成計畫 - Thalidomide 合成計畫 September 30, 2014 Slide 31

  32. 主題3 : 合成計畫 - Thalidomide Report Report September 30, 2014 Slide 32

  33. 多樣化結果輸出功能_Report September 30, 2014 Slide 33

  34. 主題4 : 文獻搜尋_Literature September 30, 2014 Slide 34

  35. 主題4 : 文獻搜尋_Literature September 30, 2014 Slide 35

  36. 主題4 : 文獻搜尋_Literature September 30, 2014 Slide 36

  37. 主題4 : 文獻搜尋_Literature September 30, 2014 Slide 37

  38. 主題4 : 文獻搜尋 - Thalidomide September 30, 2014 Slide 38

  39. 主題4 : 文獻搜尋 - Thalidomide September 30, 2014 Slide 39

  40. 多樣化結果輸出功能 - Enhanced Report 搜尋紀錄輸出 化合物搜尋結果輸出 文獻搜尋結果輸出 輸出結果 反應搜尋結果輸出 September 30, 2014 Slide 40

  41. 相關資源 September 30, 2014 Slide 41

  42. 相關資源 Reaxys info ：http://www.reaxys.com/info September 30, 2014 Slide 42

  43. Elsevier台灣官網: Reaxys資訊下載 September 30, 2014 Slide 43 http://taiwan.elsevier.com

  44. www.facebook.com/reaxysclub FB粉絲團:最新消息與討論 Facebook

  45. Q&A September 30, 2014 Slide 45

  46. 如有相關問題請連絡 • 劉 惠 賢 • Karen.Liu@elsevier.com • 電話:(02)2522-5911 相關網頁 • www.reaxys.com(首頁) • taiwan.elsevier.com(台灣官網) • www.facebook.com/reaxysclub(FB粉絲團)

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