480 likes | 1.25k Views
Acizii Nucleici. Importanţa biomedicală a acizilor nucleici : baza chimică a eredităţii. Un călugăr din secolul XIX pe nume Gregor Mendel a introdus pentru prima oară noţiunea de gen ă : unit ate de bază respons abilă pentru deţinerea şi transmiterea a unei caracteristici unice.
E N D
Importanţa biomedicalăa acizilor nucleici: baza chimică a eredităţii • Un călugăr din secolul XIX pe nume Gregor Mendel a introdus pentru prima oară noţiunea de genă: unitate de bază responsabilă pentru deţinerea şi transmiterea a unei caracteristici unice. • Iniţial s-a crezut că proteinele cară informaţia genetică, pînă la mijlocul secolului XX, cînd s-a descoperit că ADN-ul este baza eredităţii, datorită faptului că este capabil de auto-replicare.
ADN Sediul principal al localizării ADN-ului estenucleul celulelor. Sedii secundaresunt: mitocondriile şi cloroplastele (în celula vegetală). ARN Diferitele tipuri de ARNsunt localizate în nucleu, citoplasmă, mitocondrii,ribozomi. Acizii nucleicisuntADN-ul şi ARN-ul
Ce sunt acizii nucleici(ADN and ARN)? • Acizii nucleicisuntpolinucleotide(produşi de policondensarea aunor unităţi denumite nucleotide). • Nucleotidele reprezintă unitatea monomerică a acizilor nucleicişi sunt compuse din: - o bază azotată heterociclică: - purine: adenină (A) şiguanină (G) - pirimidine: citozină (C) şitimină (T) pentru ADN citozină (C) şi uracil (U) pentru ARN - o pentoză: - dezoxiriboza (este prezentăîn ADN) - riboza (este prezentăîn ARN) - fosfat
Pirimidinele • Atomiiheterociclului pirimidinic sunt numerotaţi de la 1 la 6 (astfel încat atomii de N din ciclu să primească indicele minim).
Bazele azotate prezintă fenonemul de tautomerie • Formele mai stabile: • Forma lactam este mai stabilă decît forma lactim • Forma amino este mai stabilă decît forma imino • În acizii nucleici există formele lactam şi amino
Purine • Atomiiheterociclului purinic sunt numerotaţi de la 1 la9 (astfel încat atomii de N din ciclu să primească indicele minim).
Pentoze • Atomii de carbon ai pentozelor sunt numerotaţi de la 1’ la 5’. • Pentoza din ADN estedezoxiriboza, căruia îi lipseşte gruparea hidroxil 2’-OH. • Pentoza din ARN este riboza. 5’ 4’ 1’ 2’ 3’ lipseşte 2’-OH
Structura nucleozidelor: bază + pentoză • Nucleozidelesunt derivaţiai bazelor azotate care au o pentoză legată de un atom de azot din heterociclu: N9 pentru purine N1 for pirimidine printr-o legăturăβ-N-glicozidică. Legătură β-N-glicozidică
Structura nucleotidelor • Nucleotidelesunt compose din nucleozide (basă + pentoză) şi 1, 2, sau 3 grupărifosfat (se formează o legătură esterică între fosfat şi 5’-OH). • Mononucleotide (nucleozid-monofosfat)= nucleozid + 1 fosfat • Nucleozid-difosfat = nucleozid + 2 fosfat • Nucleozid-trifosfat = nucleozid + 3 fosfat
Terminologie Ribonucleozide/Ribonucleotide(cînd pentoza = riboză)
Terminologie Ribonucleozide/Ribonucleotide(cînd pentoza = riboză)
Terminologie Dezoxiribo-nucleozide/nucleotide(cînd pentoza = dezoxiriboză)
Funcţiile fiziologice ale nucleotidelor • “Cărămizi” pentru sintezaacizilor nucleici • Compuşi macroergicicare furnizează energia necesară diferitelor procese biologice (ex. ATP, GTP) • Reglatori alostericiai diferitelor enzime (ex.ADP e activator alosteric al ICDH din ciclul Krebs) • Donori de grupe metil (ex.S-adenozilmetionina) • Mesageri intracelulari ai hormonilorhidrofili (ex. AMPc, GMCc)
Nucleotide naturale libere: AMPc • 3’,5’adenozin monofosfatul ciclic (AMPc) este mesager secundimlicat în transmiterea mesajului hormonal din mediul extracelular în interiorul celulei.
Lanţul polinucleotidic al ADN(structura primară/covalentă) 1’ • ADN este un polidezoxiribonucleotid în care gruparea 3’OH a unui dezoxiriobonucleotid este legată la gruparea 5’OH a dezoxiriobonu-cleotidului vecin printr-o legătură fosfat diesterică. • Lanţul polinucleotidic este polar:prezintă două capete distincte. • Capătul 3’este cel cu gruparea 3’-OH liberă. • Capătul 5’este cel cu gruparea 5’-OH liberă sau fosforilată. • Lanţul polinucleotidic al ADN este încărcat negativ la pH-ul fiziologic. 3’linkage 5’linkage
Reprezentare simplificată a lanţului ADN OH Pentoza: linie orizontală Baza: litera corespondentă Leg. fosfodiesterică: linie oblică şi P la mijloc 5’ 3’ G P 5’ 3’ C P P 5’ 3’ T OH
Reprezentarea simplificată a catenei de ADN Prin convenţie o catenă de ADN se scrie în direcţia 5’- 3’. ex. GCT înseamnă 5’GCT 3’
Dublu helixul ADN • Watson şi Crick au decoperit că structura secundară a ADN este undublu helix–formată din două catene de ADN asociate prin împerecherea bazelor • Inelele glucidice legate prin resturi fosfat constituie scheletul extern al dublu helixului, în timp ce bazele azotate hidrofobe sunt orientate spre interior şi perpendicular pe axa helixului. • ADN-ul uman conţine aproximativ 3,5 x 109“perechi de baze”.
Dublul helix al ADN ( structura secundară) Stabilitatea ADNdc este asigurată de: - interacţiunile hidrofobe dintre bazele azotate suprapuse (stivuite) de pe aceeaşi catenă - legăturile de hidrogen ce se stabilesc între bazele azotate de pe o catenă şi cele complementare de pe cealaltă catenă. Cele două catene de ADN sunt antiparalele.
ADN dublu helix (structura secundara) 3. G-C are 3 legături de H. A-T are 2 legături de H. • Cele două catene sunt complementare (G is complementară C, A is complementare T). • Nr. A = Nr. T Nr. G = Nr. C
Dublu helix ADN (structura secundară) • Există mai multe confomaţii ale ADN; • Conformaţia B:descrisă de Watson şi Crick are orientare dreaptă, pasul dublu helixului este 34 Å (3,4nm), diametrul de 2nm, iar nr. perechi baze per tur este 10; cea mai răspîndită. • Conformaţia A: dublu helix de dreapta dar mai compact, pasul elicei este de 2,8nm, nr. perechi baze per tur este 11. • Conformaţia Z: dublu helix de stinga, pasul elicei 4,56nm şi nr. perechi baze per tur este 12.
De la ADNlacromozomi • In eucariote ADN-ul este stocat în nucleu. Deoarece nu este suficient sapţiu iar molecula ADN-ului este extrem de mare (lungimea ADN de la o singură celulaă umană e 2m!!!), ADN-ul trebuie compactat. • Existăcincinivelede compactare a ADN careconduce la o scădere de 10.000 de orilungimii ADN.
Nivelele de compactare a ADN în nucleu-Primulnivel- r • Dublul helix de ADN se înfăşoară în jurul unui octamer proteic format din histone- fiecare unitate de ADN spiralată de 1,75 ori în jurul unui compelx histonic se numeştenucleozom. • Histonele sunt proteine bazice cu masă moleculară mică (max. 20.000), bogate în aa bazici (Arg pt.H2A, H2B şi, Lys pt H3, H4).
Nivelele de compactare a ADN în nucleu-Primulnivel- r • În jurul octamerului histonic (H2A H2B H3 H4)x2 este spiralat ADN-ul nucleozomic fomat din 140 perechi de baze. • Nucleozomii sunt legaţi între ei prin ADN intrenucleozomic sau ADN linker format din 30 perechi de baze).Histona H1 itercaţionează cu ADN linker, avînd rol în superspiralizarea nucleozomilor. • Polinulceozomul seamănă cu nişte“mărgele pe aţă” (=fibrile de cromatină de 10nm ).
Nivelele de compactare a ADN în nucleu-al doileanivel- • Polinucleozomul se superspiralează pentru a forma structura desolenoid. • Solenoidul conţine 6-7 nucleozomi per tur.Pasul e de 10nm, diametrul de 30 nm. • Solenoidul formeazăfibrele de cromatină de 30 nm.
r Nivelele de compactare a ADN în nucleu-nivelele 3,4 şi 5- - Fibrele de cromatină se compactează şi mai mult formdomenii în formă de buclă. - Aceste domenii în buclă sunt superspiralizate şi organizate în structuri distincte numitecromozomi. - ADN -uluman nuclear ( genomul) constă în 23 perechi de cromozomi.
Diferenţadintre celulele diploideşi celulele haploide • Majoritatea celulelor eucariote conţinperechide cromozomişi sunt astfel denumitediploide. • Celulele care conţincromozomi neperechesunt denumitehaploide.