Epidémiologie des encéphalites infectieuses données disponibles et zones d’ombre

1. Epidémiologie des encéphalites infectieuses données disponibles et zones d’ombre JP Stahl CHU Grenoble et Alexandra Mailles, InVS

2. Sources de données disponibles • USA : • 1 « étude fleuve », NHDS, DO (Ca), 1 étude par PCR • publications non comparables • Royaume Uni : HES • France : PMSI

3. Données américaines • Glaser C, CID 2003;36:731-42 • Californie 98-00, 96 centres, • tous âges, immunocompétents, • 334 inclus, létalité 16%

4. Trevejo RT, EID 2004;10(8):1442-9 • DO encéphalites Californie, 90-99 • Tous âges, tous statuts immunitaires • 13 807 patients VIHnégatifs inclus • Incidence + élevée si âge < 1 an ou > 65 ans

5. Khetsuriani N, CID 2002;35:175-82 • USA 88-97, échantillon de 20%, tous âges, VIH + inclus • Létalité 5,2 % pour patients VIH négatifs • ↑ fréquence si âge < 1an ou > 64 ans • durée moyenne 12 j • coût annuel estimé à 560 millions USD

6. Huang C, CID 2004;39:630-5 • Etat de NY 97-03, encéphalites et méningites, • Tous âges, tous statuts immunitaires • 3465 patients, PCR seulement

7. Données anglaises • Davison KL, EID 2003;9(2):234-40 • Angleterre 89-98, PMSI, encéphalites virales • Tous âges et tous statuts immunitaires • 6 414 inclus, létalité 6,5%

8. France métropolitaine :PMSI 2000-2002 • Extraction : tous codes encéphalite / encéphalomyélite • Exclusion DOM, VIH + • Identification et exclusion des doublons sur 4 critères (FINESS + âge + sexe + code postal) • « Analyse » réalisée sur • dept / âge / sexe • mode entrée / sortie • durée d’hospitalisation et mois de sortie • DP /DR / DA

9. Nombre / âge /sexe

10. Age et décès

11. Type d’établissements

12. Mode d’entrée des patients

13. Mode de sortie des patients

14. Durée d’hospitalisation

15. Mois de sortie des patients

16. Mois de sortie des patients (2)

17. Diagnostic principal 2000-2002

18. Diagnostic « interprété »

19. Départements d’hospitalisation des patients

23. le PMSI : une source de données….et d’interrogations • Pas conçu pour l’épidémio • Exhaustivité ? Classements par excès ? • Hétérogénéité des «codeurs» • Liste de codes incomplète • ex : West Nile , pas de code • codage d’une maladie pour désigner l’exposition à un agent pathogène. ex : 8 cas de «A821» en 2000

24. France = Californie ? même agents étiologiques • Pas d’influence saisonnalité ou géographique ? • Encéphalites sans étiologie : • agents inconnus ? • connus mais non recherchés ? • connus mais nécessité de tests diagnostiques plus performants ? On ne sait donc presque rien ! Et si on faisait une étude ?

25. Exploration diagnostique • L’exploration devra être réalisée suivant les recommandations de bonnes pratiques éditées par la commission FMC de la SPILF : http://www.infectiologie.com/site/medias/_documents/2006-encephalites.pdf • 3 niveaux d’exploration + cas particuliers • Niveau 1 : infections fréquentes et urgentes • Cytobactério LCR • VIH rapide (si positif, exclusion) • HSV1 et HSV2 (PCR sur LCR), si négatif, à refaire à J4 des signes • VZV (PCR LCR) • Mycoplasma pneumoniae(PCR LCR)

26. Niveau 2 : si le niveau 1 est négatif • Refaire HSV 1 et 2 à J4 • Entérovirus, • CMV, EBV, HHV 6, adénovirus, TBE • Chlamydia sp., Borrelia, Coxiella, Bartonella, Listeria, Mycobacterium tuberculosis • Niveau 3 : si le niveau 2 est négatif • Rickettsies, Ehrlichia, Tropheryma whipllei • influenza A et B, para-infuenzae, rougeole, oreillons, rubéole, • West Nile, Toscana (présents en France) • Virus de la chorioméningite lymphocytaire zoonotique, virus JC, paréchovirus • Hors catégories : les cas particuliers • Voyages, en fonction de la zone visitée ou foyer épidémique récent : Chikungunya, Nipah/hendra, encéphalite japonaise, dengue, etc. • Décès ou contact chauve souris ou symptomatologie évocatrice : rage