Les champignons microscopiques et les infections qu'ils provoquent …

1. Les champignons microscopiques et les infections qu'ils provoquent … Françoise Dromer, Mycologie Moléculaire, CNRS FRE2849 CNR Mycologie et Antifongiques, Institut Pasteur

2. Les champignons • Organisme eucaryote • Règne à part • Développement par filaments ramifiés (thalle) parfois unicellulaire (levure) • Aérobie stricte • Reproduction asexuée ou sexuée • Peu de champignons pathogènes chez les mammifères non immunodéprimés • ≈ 100 000 espèces de champignons • ≈ 150 pathogènes chez l'homme

3. Diversité des sources d'infection • Source exogène : ENVIRONNEMENT • Prévalence élevée de l'infection dans les zones endémiques (AC+++) • Incidence faible de la maladie sauf immunodépression ou inoculum massif • Transmission dans les piscines, saunas, salles de bain • Source endogène : TUBE DIGESTIF, PEAU • Incidence faible sauf rupture des barrières naturelles (KT, prothèses, chimiothérapie), • déséquilibre de l’écologie microbienne (antibiotiques) • Immunodépression • Infections nosocomiales

4. CGD Brûlures Diversité des facteurs prédisposants aux infections fongiques systémiques Réanimation Chirurgie Neutropénie Cardiaque Rénale VIH Pulmonaire Hépatique Mycoses systémiques Transplantation Corticoïdes N-nés

5. Onychomycose Cryptococcose Aspergillose invasive "Pied d'athlète" Diversité des infections produites infections superficielles infections profondes

6. FILAMENTEUX LEVURES DIMORPHIQUES Aspergillus Candida Histoplasma capsulatum Cryptococcus neoformans Rhizopus Diversité par le type de champignon responsable

7. La malédiction des Pharaons

8. Les champignons responsables en partie de l'extinction des dinosaures ??? • Ere tertiaire : • Déforestation globale • Prolifération des spores fongiques (fonction de dégradation) • Aérosols massifs • Survie des mammifères (sang chaud) • Disparition des dinosaures (sang froid) ??? Arturo Casadevall: "fungal virulence, vertebrate endothermy, and dinosaur extinction: is there a connection?" in Fungal Genetics and Biology 2004

9. Quelques chiffres • Septicémies à levures : • 27 hôpitaux en Ile de France • > 1400 épisodes en 3 ans • 37% de décès à J30 • Cryptococcose : • 2-30% des patients SIDA (Afrique – Sud est asiatique) • 100% décès sans traitement • 20% avec traitement

10. Les champignons que l'on connaît … • Les champignons utiles dans l’agro-alimentaire et en médecine • Fromages : Penicillium camembertii – Geotrichum candidum –Saccharomyces cerevisiae • Pénicilline – Penicillium notatum • Cyclosporine – Trichoderma polysporum • Les champignons néfastes par les toxines : aflatoxine ++ http://www.mycolog.com/fungi.htm

11. Pourquoi les mycoses sont-elles rares malgré la fréquence des spores fongiques dans l'environnement ? • Température corporelle > température de croissance optimale de la plupart des champignons • Ex : souris / lapin et C. neoformans • Traits de virulence rarement combinés : capsule, mélanine, filamentation, thermotolérance : C. neoformans vs Cryptococcus sp. • Pression de sélection par les prédateurs de l'environnement permet la survie chez l'hôte "animal" : • Ex : champignons de l'environnement et amibes du sol • Défenses immunitaires de l'homme probablement adaptées : • Mais …

12. Les apprentis sorciers ? • Apparition / “création” de nouveaux facteurs de risque : • Infection par le VIH : CAOP, cryptococcose, histoplasmose, aspergillose • Chirurgie lourde, transplantation d’organes • Traitement antibiotiques : déséquilibre des écosystèmes digestifs • Les voyages : mycoses d’importation en métropole • Un constat, les hommes sont plus susceptibles aux infections fongiques : • Hormones ? • Mode de vie ? • Susceptibilité génétique

13. Les apprentis sorciers ? • Mycoses des muqueuses liées à l’utilisation d’antibiotique : • Candidose du TD, muguet, vaginite • Déséquilibre écosystèmes • Emergence de nouveaux champignons pathogènes résistants à certains antifongiques => découverte de la résistance aux antifongiques : • Pas d'échange génétique • Rôle des biofilms • Etude des mécanismes de résistance …

14. La mycologie n'est plus poussiéreuse !Les outils moléculaires sont disponibles • Génomes de x champignons pathogènes séquencés • Nombreuses découvertes importantes : • Analyse des marqueurs de virulence, nouveaux modèles : drosophiles, nématodes, amibes • Voies de biosynthèse => antifongiques nouveaux • Identification des antigènes de surface = > tests diagnostiques • Identification de nombreux mécanismes immunitaires • Identification de protéines inconnues chez les eucaryotes supérieurs

15. 5 min 24 hrs 6 hrs 48 hrs Variabilité antigénique au cours de l'infection

16. L'enjeu principal : une amélioration du pronostic des mycoses invasives • Des tests de diagnostic plus performants • Des antifongiques plus efficaces • La mise au point de vaccins, • L'utilisation de thérapies immunomodulatrices ? => Un intérêt plus grand de la communauté scientifique, médicale et des pouvoirs publics