220 likes | 343 Views
Strukturen af transkriptionsaktivatorer DNA bindende domæne Transkriptionsaktiverende domæne Eventuelt et dimeriseringsdomæne. DNA bindende domæner Zink indeholdende faktorer Homeodomæner basiske leucin zippers basiske helix-loop-helix. Transkriptionsaktiverende domæne Sure aminosyrer
E N D
Strukturen af transkriptionsaktivatorer • DNA bindende domæne • Transkriptionsaktiverende domæne • Eventuelt et dimeriseringsdomæne
DNA bindende domæner • Zink indeholdende faktorer • Homeodomæner • basiske leucin zippers • basiske helix-loop-helix • Transkriptionsaktiverende domæne • Sure aminosyrer • Glutamin rigt domæne • Prolin rigt domæne
Zink finger struktur a-helix-loop-b-strand to histidiner i a-helix to cysteiner i b-sheet
Gal4p eksempel på en zink holdig transkriptionsfaktor uden fingerstruktur zink koordineres af 6 cysteiner kort helix genkender DNA target binder i major groove
Kernereceptorer har zinkioner, der er koordineret af fire cysteiner
Homeobox domæner helix turn helix Den ene helix genkender major groove i DNAet
bZIP, basisk leucin zipper dimeriserer via leucin resterne og binde DNA i major groove via basiske aminosyrer
Eukaryote transkriptionsfaktorer stimulerer binding af generelle transkriptionsfaktorer og RNA polymerasen til promotorer. Hvordan ?
Hvilke dele af det generelle transkriptionsapparat der interagerer med en transkriptionsaktivator kan bestemmes ved et pull-down eksperiment eller 2-hybrid analyse
Assay til bestemmelse af generelle transkriptionsfaktorer, der interagerer med det sure transkriptionsaktiverende domæne af GAL4