細菌の分子生物学

1. 細菌の分子生物学

2. DNA複製 3' 5' 5' 3' リーディング鎖 ラギング鎖 岡崎フラグメント

3. 5' 3' 3' 5' ヘリカーゼ DNAポリメラーゼⅢ プライマーゼ DNAポリメラーゼⅠ RNA プライマー DNAポリメラーゼⅢ DNAリガーゼ ヘリカーゼ プライマーゼ

4. 原核生物における転写 RNAポリメラーゼ ホロ酵素 転写（ｍRNA合成） コア酵素 aabb'w σ DNA 転写開始点 +1 -10 -35 Pribnowボックス （TATAボックス） TATAAT TTGACA プロモーター

5. ラクトースオペロンにおける転写調節 ラクトースオペロン プロモーター オペレーター lacZ lacA lacY lacI Plac Pi O1 O2 mRNA mRNA 結合 リプレッサー β－ガラクトシダーゼ ガラクトシド パーミアーゼ RNAポリメラーゼの オペレーターへの 結合を阻害 誘導因子 （IPTGなど） ガラクトシド アセチルトランスフェラーゼ

6. 遺伝暗号表(mRNAのコドン）

7. + ATP + tRNA アミノアシルtRNA 合成酵素 tRNA 3'-末端 ホルミラーゼ 10-ホルミル テトラヒドロ葉酸

8. 細菌遺伝子の突然変異 塩基の置換（点突然変異　point mutation） Transition（転位） プリン→プリン，ピリミジン→ピリミジン A→G，G→A，T→C，C→T Transversion（転換） プリン→ピリミジン，ピリミジン→プリン A→T，A→C，G→T，G→C T→A，T→G，C→A，C→G 塩基の欠失（deletion） 塩基の挿入（insertion）

9. 突然変異の型 ミスセンス変異　point mutation → アミノ酸残基の変化 TAC (Tyr) → TCC (Ser) ナンセンス変異　point mutation → コードが終止コドンに TAC (Tyr) → TAA (stop) 遺伝子のみの変異 → アミノ酸残基は変化しない TAC (Tyr) → TAT (Tyr)

10. フレームシフト変異 deletion，insertionにより読み取り枠がずれる deletion ACC CGT GGT ATC TTC ATA ACC G Thr Arg Gly Ile Phe Ile Thr ACC CGT GTA TCT TCA TAA CCG Thr Arg Val Ser Ser Stop

11. 細菌の主な変異現象 形態の変化 鞭毛，線毛，莢膜の消失→抗原性，病原性変化 集落の変化 S→R変異（平滑正円形→粗面不規則辺縁） グラム陰性菌　リポ多糖変異 R→S変異 炭疽菌，結核菌 H→O変異（クモリ形成→孤立集落形成） プロテウス属　鞭毛消失 H抗原（鞭毛抗原），O抗原（菌体表面抗原） 抗原性の変化 H抗原相変異　サルモネラ属 Vi→W変異　強毒サルモネラ（virulence抗原）

12. 細菌の主な変異現象 毒力，病原性の変化 弱毒株　attenuated strain 無毒株　avirulent strain 人工培地で継代培養→病原性低下 耐性，抵抗性の変化 薬剤耐性化 ファージ，放射線，温度に対する感受性の変化 生化学的性状の変化 autotroph（原株）→auxotroph（栄養要求変異株）

13. 化学的変異原 塩基類似体 　　２－アミノプリン DNAへ取り込まれ トランジション変異 インターカレーター ICR-191 二本鎖DNAに挿入 フレームシフト変異 プリンをアルキル化 トランジション トランスバージョン フレームシフト変異 アルキル化剤 　　ニトロソグアニジン その他のDNA修飾剤 　　ヒドロキシルアミン シトシンをヒドロキシル化 トランジション変異

14. 2－アミノプリン A T T 互変異性 G C C

15. 放射線（X線，γ線） DNA鎖切断　→　再構成　→　巨大損傷 紫外線 同一DNA鎖上のピリミジン残基の二量体化 チミン二量体

16. DNA損傷の修復 光回復 紫外線により生じるピリミジンダイマーの 青色光とデオキシリボピリミジンフォトリアーゼによる修復 ヌクレオチド除去修復 エンドヌクレアーゼとヘリカーゼによる損傷部分の切り出し DNAポリメラーゼとDNAリガーゼによる修復 組換え修復 損傷DNAの複製時に生じたギャップを相同DNA鎖で埋める SOS修復 DNA損傷 → recA遺伝子発現 → lexA遺伝子産物分解 → DNA修復遺伝子の転写活性化

17. DNA損傷の検出 Recアッセイ 枯草菌のrec－株（DNA損傷高感受性）を利用して 化学物質のDNA損傷性を検出 Amesテスト Salmonella typhimuriumのヒスチジン要求株を利用して 変異原の復帰変異（his－ → his+）活性を検出 rya変異・･･・膜透過性が亢進する細胞膜変異uvrB変異・･･除去修復能の欠失変異 プラスミド上の複製エラーを起こしやすいhisG遺伝子

18. 染色体とプラスミド レプリコン 自律複製できるDNA分子 染色体，プラスミド プラスミド 細胞内において染色体とは独立に自律複製され， 細菌の生存にとって必須でないDNA分子 環状二本鎖，線状二本鎖，環状一本鎖

19. コリシンE1 アンピシリン耐性 テトラサイクリン耐性 AmpR TcR ori 複製開始点 6.6 kb 4.4 kb ori pBR322プラスミド ColE1プラスミド 大腸菌ゲノム： 4.6 Mb

20. F因子（Fプラスミド） 大腸菌の接合とDNA組換えに関与する コレラ菌：P因子，緑膿菌：PF因子 R因子（Rプラスミド） 薬剤耐性遺伝子を有する 接合伝達能をもつ（狭義のR因子） コリシン産生因子 大腸菌の抗菌性毒素タンパク質遺伝子を有する 抗菌性毒素タンパク質（バクテリオシン） 病原性プラスミド Entプラスミド（腸管毒素原性大腸菌ETECの毒素遺伝子を含む） Hlyプラスミド（溶血毒ヘモリシン遺伝子を含む）

21. 薬剤耐性遺伝子群 組換え領域 IS3 IS1 tra IS3 100 kb 100 kb IS2 oriT IS1 ori oriV oriT tra Rプラスミド Fプラスミド

22. DNA組換え（recombination） 二つの異なるDNA分子が会合し、交差が起こることにより新しいDNAの組み合わせが生じること 相同的組換え（homologous recombination） DNAの相同領域間でおこる（細菌における普遍的組換え） Hollidayモデル 非相同的組換え（nonhomologous recombination） DNAの非相同領域間でおこる 細菌では稀，哺乳動物では一般的 転移因子による組換え

23. DNA組換え

24. 3’ 3’ 5’ 5’ 5’ 5’ 3’ 3’ 3’ 3’ A A A A 5’ 5’ T T T T 5’ 5’ C C C C 3’ 3’ G G G G A A 3’ 5’ C C 5’ T T 3’ G G A 3’ A 5’ C C T 5’ T G 3’ G Hollidayモデル Holliday構造 分枝鎖移動

25. A C T G A C T G エンドヌクレアーゼ 解離 A C T G or 解離 A C T G

26. 遺伝子の伝達 LederbergとTatumによる大腸菌の接合の発見（1947年） 接合（conjugation） 交配（mating）過程において，Fプラスミドの働きにより プラスミドまたは染色体遺伝子が別の菌に伝達される Fプラスミド 大環状プラスミド（100 kb） プラスミド移行に関わるtra遺伝子群（32 kb）を有する ２種類の複製過程 oriVにより遊離のプラスミド（１コピー）が複製 染色体に挿入され，染色体oriCにより複製

27. Fプラスミド 伝達に必要な遺伝子群 （～60遺伝子） oriT (origin of transfer) 伝達時の複製開始点 tra遺伝子群 32 kb IS（挿入配列）因子群 （転移に必要な配列） 100 kb プラスミド複製の開始点 oriV 相同組換えまたは転移によって稀に染色体に挿入される

28. 挿入後，Fプラスミドはホストレプリコンの一部として複製されoriVは抑制される挿入後，Fプラスミドはホストレプリコンの一部として複製されoriVは抑制される E. coli染色体 Fプラスミド IS因子 挿入Fプラスミド oriV oriC Hfr菌 挿入Fプラスミドを持つ F+菌 遊離Fプラスミドを持つ

29. 形質転換 外来のDNAが導入されたことによって細菌の形質が変化する現象 DNAが細胞に導入されて遺伝形質が変化すること コンピテント（competent）　DNAを取り込みやすい状態 肺炎球菌　対数増殖期に自然にコンピテントになる インフルエンザ菌　特殊な富栄養培地中でコンピテントになる 大腸菌　低温で塩化カルシウム処理するとコンピテントになる

30. 外被 ウイルス染色 体の侵入 ウイルス染色体 ウイルス粒子 の放出 溶菌の環 （15～60分） 溶原化 外被タンパク質の 合成とパッケージング ウイルス染色体の増殖 プロファージ 溶原性バクテリオファージの生活環

31. 形質導入（transduction） ファージ粒子によって宿主細胞のDNAが別の菌に運ばれ， その菌の染色体と組換えを起こすこと ファージ変換（phage conversion） ファージ遺伝子そのものの形質発現によって，細菌の 形質が変化すること。ファージ遺伝子は宿主染色体に 組み込まれている必要はない。

32. ファージDNA 完全ファージ粒子 供与染菌色体DNA片 細菌染色体 不完全ファージ粒子 供与菌DNA 溶原化 完全ファージ粒子

33. 転移因子（transposable element） ゲノム上のある部位から別の部位へ 移動するDNA配列 挿入配列（insertion sequence，IS） 1 kb前後の小さな因子で，転移酵素トランスポゼースをはさんで 両末端に逆向きの反復配列（inverted repeat sequence，IR）をもつ トランスポゾン（transposon） 抗生物質耐性遺伝子などをはさむように両末端に挿入配列をもつ

34. TE TE TE TE TE TE TE 非複製的（cut & paste）転移 + + Donor Recipient 複製的転移 解離 融合 + + Replicon A Relicon B Cointegrate TE: 転移因子

35. 細胞融合 細菌細胞A （ゲノムA） プロトプラスト 細菌細胞B （ゲノムB） プロトプラスト 細胞壁溶解酵素 ポリエチレン グリコール溶液 融合細胞 （ゲノムA＋ゲノムB）