LE B. A. BA de la bactériologie : Qu’est ce que la bactériologie?

1. LE B. A. BA de la bactériologie:Qu’est ce que la bactériologie? Dr O. BELLON Centre hospitalier du pays d’Aix septembre 2011

2. Les micro-organismes • Microbiologie : étude des micro-organismes • Bactériologie : étude des bactéries • Virologie, mycologie, parasitologie…… • Centré sur la bactériologie mais aussi sur les autres micro-organismes…

3. Définitions générales • Êtres vivants • Petite taille • Microscopes • Ubiquitaires • Animaux • environnement • Limitation du cours • Bactéries • Virus • champignons

4. Les bactéries • Besoins culturaux • Eau • Aliments • Chaleur • Atmosphère • Classifications

5. Les bactéries • Atmosphère • Aérobies • Besoin d’oxygène • Anaérobies • Oxygène toxique • Microaérophiles

6. Les bactéries • Température • Mésophiles • Cryophiles (froid) • Thermophiles (chaleur) • Explication • Des pathologies observées • Des modes de dissémination (Yersinia, Legionella) • Des modes de contamination (Listeria)

7. Les bactéries • Nourriture • Nécessaires à la croissance • Cystéine et légionelle • Favorable à la croissance • Glucose : assez mais pas trop…… • Eau

8. Les bactéries • Structure • UNICELLULAIRE • procaryotes • Microscope optique • Cytoplasme • Entouré d’une membrane cytoplasmique • Protégé par la paroi : support de l’affinité tinctoriale (gram) • Contenant • Chromosome circulaire : noyau sans membrane nucléaire • Plasmides • Éléments figurés • Éléments inconstants • Capsule • Spore • flagelles

10. Coloration de Gram : BGN

11. Coloration de ZIELH

12. Les bactéries • Structure • La capsule • Facteur de virulence • Protection contre la phagocytose • Support antigénique • Pneumocoque

13. Eléments facultatifs : capsule

14. Les bactéries • Structure • La spore • Forme de résistance • Chaleur • Pression • Rayonnements • Produits chimiques : • alcool entre autre • Pas à l’eau de Javel • Sporulation lors de conditions défavorables • Germination lors de conditions favorables • Clostridium : • gangrène, • C. difficile

15. Eléments facultatifs : spore

16. Les bactéries • Structure • Les flagelles • Support de la mobilité • Support antigènique • Les pili sexuels • Conjugaison • Recombinants génétiques

17. Eléments facultatifs : flagelles

18. Les bactéries • Culture • Étuves • Milieux de culture • Atmosphère • Multiplication • E.coli : rapide • B.K. : lent

19. Les virus • Unicellulaires • ACARYOTES • Parasites stricts • Un seul acide nucléique en général • Structure particulaire spécifique • Ultrafiltrables • Microscope électronique

20. Les virus • Parasites stricts • reproduction à partir de son matériel génétique • détournement du système de la cellule parasitée • Réplication • Ne pousse pas sur les milieux habituels de la bactériologie

21. Les virus • Stucture • un seul acide nucléique • ou ADN • ou ARN • protégé dans une capside • support de la classification morphologique • cubique • hélicoidale • double

22. Virus : cubique

23. Virus : helicoidal

24. Virus : mixte (bactériophage)

25. Les champignons • Entre le règne végétal et le règne animal • Mycètes • Eucaryotes • Uni ou pluricellulaires • Présence de bétaglucanes et chitine • Paroi constituée d’ergostérol • Deux grands groupes • Levures • Champignons filamenteux

26. candida

27. Champignons filamenteux

28. Caractéristiques des MO • Entérobactéries : BGN du tube digestif • Enterobacter: un des genres parmi les entérobactéries • Entérocoque : CGP du tube digestif. • Staphylocoque : aspect en grappe de raisin, h stafulh • Colibacille : le bacille du colon • Méningocoque : responsable de méningites…. • Vibrion : BGN en virgule

29. Modes de vie des MO • Commensaux : vis en commun sans produire de maladie • Pathogènes • Entraînent une maladie • Nécessite des conditions particulières pour exprimer la pathogénicité • Notions de flores

30. Ce qu’on vient de voir • Les bactéries: • Leur morphologie • Bacilles • Coques • Gram • zielh • Leur anatomie

31. Mise en évidence des MO • Les voir : diagnostic direct • Examen direct • Culture • Antigènes solubles • Biologie moléculaire • Voir les réactions spécifiques de l’organisme : diagnostic indirect • Recherche d’anticorps

32. Informations données par l’examen direct

33. Mise en évidence des MO • Examen direct • Rapide • Préciser ce que l’on cherche : colorations spéciales • Germe mort ou vivant…… • Nécessite un nombre important de germe présent……

34. Mise en évidence des MO • Culture • Milieux spécifiques • Atmosphères spécifiques • Le germe DOIT être VIVANT à l’ensemmencement

35. Mise en évidence des MO

36. Mise en évidence des MO Recherche d’antigènes solubles - mise en évidence de fragments de bactéries - par des méthodes immunologiques - pour certaines bactéries À demander spécifiquement

37. Mise en évidence des MO • Nouvelles techniques de biologie moléculaire • PCR……. • PCR spécifiques • Attention aux inhibiteurs +++++ • Prix…….

38. Mise en évidence des MO • Typages • Sérotypages • pour certaines bactéries seulement • Pyocyanique • Salmonelle • Carte d’identité complète • Biologie moléculaire • Étude de fragments • Séquençage

39. Mise en évidence des MO • Sérologie • Mise en évidence des anticorps • Préciser lesquels +++++ • Attention à la cinétique de production • Latence (légionelles) • Taux • Différentes classes d’immunoglobulines • IGM • IGG…

40. Mise en évidence des MO • Attention • Demander spécifiquement ce que l’on veut • Prescription médicale • Obligatoire • Précise • Concise • Centrée sur la clinique • Respectant la chronologie de l’infection et de son évolution • Bien prélever et bien transporter

41. Intérêt pour les hygiénistes • Connaître • les conditions favorables de développement et de multiplication des germes • Comprendre • Les noms, les examens, les diagnostics, les délais nécessaires etc… • Pour pouvoir discuter avec les autres membres de l’équipe de soin.