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Diversité du monde Bactérien

Diversité du monde Bactérien. 5-Explication d’une telle diversité 5.1-Mutations et transfert horizontaux 5.2-Transduction 5.3-Transformation 5.4-Conjugaison 6-La Métagénomique 6.1-Principe 6.2- Intérêt 6.3- La métagénomique des Océans 6.4-La métagénomique de notre corps

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Diversité du monde Bactérien

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Presentation Transcript

  1. Diversité du monde Bactérien 5-Explication d’une telle diversité 5.1-Mutations et transfert horizontaux 5.2-Transduction 5.3-Transformation 5.4-Conjugaison 6-La Métagénomique 6.1-Principe 6.2- Intérêt 6.3- La métagénomique des Océans 6.4-La métagénomique de notre corps 6.4.4-Les microbes et nous 6.4.5- « HumanMicrobiome Project » et «  METAgenomics of the Human Intestinal Tract » 6.4.6-Un transfert horizontal entre un sushi et un japonais!!! 1-Introduction 2-Classification du monde vivant 2.1-Classification phénotypique 2.2-Classification phylogénétique: L’arbre du vivant 2.3-Taxinomie 2.4-LUCA 3-Les Archées 4-Diversité des Bactéries 4.1-Thermotoga 4.2-Aquifex 4.3-Bacteroides/Cytophaga 4.4-Planctomyces 4.5-Cyanobactéries 4.6-Spirochètes 4.7-Proteobactéries 4.8-Gram-positives 4.9-Bactéries vertes filamenteuses 7-Conclusion

  2. Notions à Acquérir • -Définir l’arbre du vivant (Les différents domaines du vivant-LUCA-Utilisation de l’ARN16S) • Acquérir quelques notions de Taxinomie (Les différents niveaux) • Savoir donner quelques caractéristiques des Archées (Caractéristiques cellulaires et métaboliques) • Diversité des Bactéries (Citez les phyla majeurs et caractéristiques associées) • Comprendre l’origine de la diversité bactérienne (Citez les mécanismes à l’origine du polymorphisme génétique) • Définir/Comprendre/Analyser la métagénomique

  3. Hier… Animalia Plantae Protista Monera Fungi Animalia Plantae Protista Monera Animalia Plantae Protista Anthonie Van Leeuwenhoek (1632-1723) Haeckel (1866) (1950) Whittaker (1969)

  4. 2-Classification du monde vivant 2.1-Classification phénotypique Plantes Champignons Animaux Protistes Monera 1960 Whittaker Whittaker's classification Tree of 1967

  5. Hier… Animalia Plantae Protista Monera Fungi Animalia Plantae Protista Monera Archées Bactéries Eucaryotes Animalia Plantae Protista Anthonie Van Leeuwenhoek (1632-1723) Haeckel (1866) 1950 Whittaker (1969) Woese Fox (1977)

  6. 2-Classification du monde vivant 2.2-Classification phylogénétique

  7. 2-Classification du monde vivant 2.2-Classification phylogénétique Domaine: Embranchement:

  8. Des protéines paralogues anciennement dupliquées

  9. 2-Classification du monde vivant 2.3-Taxinomie Genre/genus Escherichia coli Escherichia Enterobacteriaceae Enterobacteriales Embranchement/Phylum/Division Gamma Proteobacteria Règne/Kingdom Proteobacteria Eubacteria Bacteria

  10. 2-Classification du monde vivant 2.4-LUCA

  11. 3-Les Archées Haloquadratumwalsbyi http://fr.wikipedia.org/wiki/Bactéries_carrées_de_Walsby LUCA

  12. Halobacterium et les marais salants L’archée Ferroplasmaacidarmanus http://microbewiki.kenyon.edu/

  13. Photo Karl Stetter Pyrolobusfumarii Blacksmoker in Atlantic Ocean

  14. 4-Diversité des Bactéries 4.1-Thermotoga 4.2-Aquifex Thermophiles avec un embranchement ancien Thermotoga LUCA Aquifex

  15. Rappel

  16. 4-Diversité des Bactéries 4.3-Bacteroides/Cytophaga Bacteroides LUCA Kientz B. PLOS ONE 2012 Cytophaga

  17. 4-Diversité des Bactéries 4.4-Planctomyces Planctomyces A thin-sectioned cell of Gemmataobscuriglobusprepared by a high-pressure freezing method, showing a clear nuclear body compartment bounded by a nuclear envelope that consists of two membranes. The nuclear envelope is clearly delineated by the ribosome-like particles. Courtesy of Kuo-Chang Lee and John A. Fuerst, University of Queensland LUCA

  18. 4-Diversité des Bactéries 4.5-Cyanobactéries 4.6-Spirochètes Cyanobactéries LUCA Spirochètes

  19. 4-Diversité des Bactéries 4.7-Proteobactéries Myxobactéries LUCA Helicobacterpylori

  20. Rappel Gram+ Gram- • microscopic image of a Gram stain of mixed Gram-positive cocci (Staphylococcus aureus ATCC 25923, purple) and Gram-negativebacilli (Escherichia coli ATCC 11775, red). Magnification:1,000”source: wikipedia

  21. 4-Diversité des Bactéries 4.8-Gram-positives 4.9-Bactéries vertes filamenteuses Staphyloccocus LUCA ChloroflexuxaurantiacusPierson & Castenholz (1974) Arch. Microbiol. 100, 5-24. Chloroflexi

  22. 5-Explication d’une telle diversité 5.1-Mutations et transfert horizontaux 5.2-Transduction Bactériophage T4. Modèle géant créé par l’artiste Gaelle Bauer pour les 4èmes journées de microbiologie.

  23. 5-Explication d’une telle diversité 5.3-Transformation 5.4-Conjugaison Conjugaison

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