1 / 11

Haplogroup RFLP mtDNA Manusia Atas Dasar Posisi Mutasi Urutan Nukleotida Lengkap secara insilico

Seminar Penelitian (KI-70Z2), 29 Agustus 2007. Haplogroup RFLP mtDNA Manusia Atas Dasar Posisi Mutasi Urutan Nukleotida Lengkap secara insilico. MASTURA NIM : 20504017. AGENDA PRESENTASI. Latar Belakang Tujuan Tinjauan Pustaka Metodologi Hasil dan Pembahasan Kesimpulan. Latar Belakang.

duer
Download Presentation

Haplogroup RFLP mtDNA Manusia Atas Dasar Posisi Mutasi Urutan Nukleotida Lengkap secara insilico

An Image/Link below is provided (as is) to download presentation Download Policy: Content on the Website is provided to you AS IS for your information and personal use and may not be sold / licensed / shared on other websites without getting consent from its author. Content is provided to you AS IS for your information and personal use only. Download presentation by click this link. While downloading, if for some reason you are not able to download a presentation, the publisher may have deleted the file from their server. During download, if you can't get a presentation, the file might be deleted by the publisher.

E N D

Presentation Transcript

  1. Seminar Penelitian (KI-70Z2), 29 Agustus 2007 Haplogroup RFLP mtDNAManusiaAtasDasarPosisiMutasiUrutanNukleotidaLengkapsecarainsilico MASTURA NIM : 20504017

  2. AGENDA PRESENTASI • Latar Belakang • Tujuan • Tinjauan Pustaka • Metodologi • Hasil dan Pembahasan • Kesimpulan

  3. LatarBelakang • Peneliti terdahulu telah menggunakan metode RFLP (Restriction Fragment Length Polymorphism ) untuk menentukan haplogroup mtDNA manusia • Penelitian mengenai polimorfisme mtDNA manusia berdasarkan enzim restriksi telah berhasil mengelompokkan populasi asli Amerika menjadi haplogroup A, B, C, dan D (Torroni, et., al 1992).

  4. LatarBelakang • Metode RFLP tidak menggunakan urutan nukleotida mtDNA manusia lengkap (16. 569 pb) dalam menentukan haplogroup • Penentuan haplogroup dengan RFLP hanya menggunakan daerah-daerah tertentu dari urutan nukleotida mtDNA • Contoh : daerah HVS I dan HVS II, daerah pengode (Coding region) • Reanalisis untuk haplogroup RFLP

  5. TujuanPenelitian • Untuk melihat kesesuaian antara haplogroup RFLP dengan haplogroup yang ditentukan berdasarkan posisi mutasi dari urutan nukleotida lengkap menggunakan empat belas enzim restriksi endonuklase secara insilico

  6. TinjauanPustaka • Mitokondria : organel sel eukariot organ respirasi ATP • Mitokondria Sifat genetik sendiri (mtDNA) • Polimorfisme yang tinggi laju mutasi tinggi • Pola pewarisannya spesifik, hanya dari ibu • Sistem kode genetik mtDNA berbeda dengan kode genetik DNA inti

  7. TinjauanPustaka GenomMitokondria • DNA mitokondria manusia telah ditentukan urutannya secara lengkap oleh Anderson, 1981 • Urutan ini dijadikan referensi atau acuan bagi penelitian-penelitian mtDNA : Cambridge Reference Sequence (CRS). • mtDNA manusia tersusun atas 16569-bp. • Genom mtDNA mengandung 37 gen yang terdiri atas 13 gen penyandi protein yang terlibat dalam fosforilasi oksidatif, 22 gen menyandi tRNA dan 2 gen menyandi rRNA (Arderson et al., 1981).

  8. TinjauanPustaka • RFLP : analisisurutan DNA yang dipotongolehenzimrestriksi yang diketahui, enzimrestriksiakanmemeotong DNA padalokasi yang tidaksalingberhubungan. • Mutasi RFLP dilihat : hilangnyasisipemotongandarienzimrestriksitertentu(Loss) ataumunculnyasisipemotonganbarudarienzimrestriksi (gain), yang dibandingkandengan CRS • Haplogroup :carapengelompokanberdasarkanperbedaanpanjangpendeknyafragmenmtDNA yang dipotongolehenzimresriksi

  9. MetodologiPenelitian Metode RFLP Loss (-) Gain (+) 1. 2. Program MMA Haplogroup Informasittng RFLP UrutannukleotidalengkapmtDNA Jenisdanposisimutasi HaplogroupTeoritis Informasitentang RFLP

  10. HasildanPembahasan 584 individu

  11. Kesimpulan Dari 584 individu yang dianalisis : • Yang samadenganhaplogroup RFLP :344 individu • Yang tidaksamadenganhaplpgroup RFLP :66 individu • Yang tidaktermasukkehaplogroupmanapun : 97 individu • Terdapat 77 individu yang belumdiketahuisukubangsanya • Dari semuasampel yang dianalisis yang paling sesuaiadalahindividu yang memilikisatuhaplogroup, yang lainnyatidakmenunjukkanhasil yang spesifik

More Related