1 / 20

Homologi Urutan Nukleotida DNA Mitokondria pada Fragmen D-Loop dari Lapisan Endoderm

Homologi Urutan Nukleotida DNA Mitokondria pada Fragmen D-Loop dari Lapisan Endoderm. Adritia Suci Wijayanti 10506103. Pembimbing : Achmad Saifuddin Noer , Ph.D. 1/20. Agenda Presentasi. More Free PowerPoint Templates at SmileTemplates.com. 26/05/10 Seminar Tugas Akhir. 2/20.

bryony
Download Presentation

Homologi Urutan Nukleotida DNA Mitokondria pada Fragmen D-Loop dari Lapisan Endoderm

An Image/Link below is provided (as is) to download presentation Download Policy: Content on the Website is provided to you AS IS for your information and personal use and may not be sold / licensed / shared on other websites without getting consent from its author. Content is provided to you AS IS for your information and personal use only. Download presentation by click this link. While downloading, if for some reason you are not able to download a presentation, the publisher may have deleted the file from their server. During download, if you can't get a presentation, the file might be deleted by the publisher.

E N D

Presentation Transcript

  1. HomologiUrutanNukleotida DNA MitokondriapadaFragmen D-Loop dariLapisan Endoderm AdritiaSuciWijayanti 10506103 Pembimbing: AchmadSaifuddinNoer, Ph.D 1/20

  2. Agenda Presentasi More Free PowerPoint Templates at SmileTemplates.com 26/05/10 SeminarTugasAkhir 2/20

  3. Pendahuluan • Pengungkapankasuskriminal forensik  DNA • BelumdilaporkanadatidaknyaperbedaanurutannukleotidamtDNApadaberbagaijaringan. 3/20 26/05/10 Seminar TugasAkhir

  4. Tujuan Menganalisishomologiurutannukleotida DNA mitokondriapadafragmen D-Loop darilapisan endoderm pada 2 jaringan, yaituusushalusdanpankreas yang berasaldarisatuindividu. 26/05/10 Seminar TugasAkhir 4/20

  5. Embriogenesis 5/20 26/05/10 Seminar TugasAkhir

  6. DNA Mitokondria 26/05/10 Seminar TugasAkhir 6/20

  7. Heteroplasmi • Heteroplasmidisebabkanlajumutasitinggi. • Padadaerahpengodedandaerah yang tidakmengode. • Heteroplasmiberupavariasipanjang: HVSI T16189C  poli-C [Bendallet al.,1995] HVSII padaposisi 66 dan 246  poli-G [Cavalier et al., 2000]. • Dapatmenguntungkandanmerugikandibidangforensik. 26/05/10 Seminar TugasAkhir 7/20

  8. Metode Sampel Lisis Templat DNA PCR Fragmenhasil PCR Elektroforesis Sequencing Elektroforegram Analisisin silico Perbandinganurutannukleotida 26/05/10 Seminar TugasAkhir 8/20

  9. Kondisi PCR 94°C 94°C 72°C 72°C 5:00 1:00 1:00 4:00 50°C 4°C 1:00 ̴̴ denaturasi elongasi annealing 26/05/10 Seminar TugasAkhir 9/20

  10. Sequencing • Terminasi DNA polimerasemelaluipenambahanddNTP yang kehilangangugushidroksipadakarbon 3’ darigularibosa. • DNA polimerasetidakdapatmembentukikatanfosfodiesterantaradNTPsebelumnyadenganddNTP. [Sanger et al., 1977]. 26/05/10 Seminar TugasAkhir 10/20

  11. TahapSequencing • Denaturasi templatDNA • Penempelan primer (annealing) • Polimerisasi • Terminasi oleh ddNTP yang telah diberi senyawa fluororesent • Elektroforesis 26/05/10 Seminar TugasAkhir 11/20

  12. 26/05/10 Seminar TugasAkhir 12/20

  13. Hasilelektroforesis 1419 pb ± 0,9 kb 517 pb 397 pb 214 pb marker - + pankreas Usushalus 26/05/10 Seminar TugasAkhir 13/20

  14. Elektroforegram 26/05/10 Seminar TugasAkhir 14/20

  15. Analisishasilsequencing 26/05/10 Seminar TugasAkhir 15/20

  16. Perbandinganantarjaringan • Tidakadaperbedaanurutannukleotidaantarausushalusdenganpankreas. 26/05/10 Seminar TugasAkhir 16/20

  17. PerbandinganSampeldenganrCRS 26/05/10 Seminar TugasAkhir 17/20

  18. Pembahasan • Sampelusushalusdanpankreasindividu A: tidakadaperbedaanurutannukleotida. • Individu A: tidakadaperbedaanurutannukleotidaantarjaringanpadalapisan mesoderm [Unwakoly,2010]. • Individu B: perbedaanurutannukleotidapadalapisan mesoderm dan endoderm [Yuniarti, 2009] danpadalapisanektoderm [Masykura, 2009]. • Tidakadamutasisaatpembentukanlapisanembrionikpadaindividutertentu. 26/05/10 Seminar TugasAkhir 18/20

  19. Pembahasan • rCRS 9 C dan 1 T padaposisi 16184-16193 • Perubahanurutannukleotida T16189C  poli-C 10 basa [Faika, 2006] • Perubahanurutannukleotida A16183C, T16189C, dan A16194C  poli-C 12 basa. • Adanya sub populasi (heteroplasmi) menyebabkantidakterbacanyaurutannukleotidasetelahpoli-C. 19/20 26/05/10 Seminar TugasAkhir

  20. Kesimpulan • Diperolehhomologi 100% urutannukleotidaantarasampelusushalusdanpankreaspadaindividu A. • Terdapat 12 perbedaanurutannukleotidaantarasampeldenganrCRS. • Keduasampeltermasukheteroplasmi 26/05/10 Seminar TugasAkhir 20/20

More Related