430 likes | 609 Views
BIOTECHNOL ÓGIA D MsC gyakorlat. Tervezési feladat. Del éciós mutagenezis a leolvasási keret sértése nélkül. Ar1. ori V. ori T. oriV : szűk gazdaspecificitás. Ar: antibiotikum rezisztencia. Ar1. ori V. ori T. vad típus. mutáns. poláris hatás ?. A FELADAT ÁLTALÁNOS MEGFOGALMAZÁSA.
E N D
BIOTECHNOLÓGIA D MsC gyakorlat Tervezési feladat
Deléciós mutagenezis a leolvasási keret sértése nélkül Ar1 oriV oriT oriV: szűk gazdaspecificitás Ar: antibiotikum rezisztencia Ar1 oriV oriT vad típus mutáns poláris hatás ?
A FELADAT ÁLTALÁNOS MEGFOGALMAZÁSA • A LEOLVASÁSI KERET MEGSÉRTÉSE NÉLKÜL KI KELL ÜTNI EGY GÉNT EGY BAKTÉRIUMBAN • ÉS HELYETTE UGYANEBBEN A BAKTÉRIUMBAN KELL TERMELTETNI A KIÜTÖTT GÉN TERMÉKÉT FÚZIÓS FEHÉRJE FORMÁJÁBAN
MEGOLDÁSI SÉMA • 1. A megadott célgént tartalmazó genomi lókusz letöltése, a célgén és a környező gének pozíciójának kijelölése • Eszköz: internet, adatbankok • pl. NCBI, Genbank • http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/gquery
complement(1934864..1936042) Csak a 1 933 000 – 1 938 000 régió kell Ekkor a gén 3 043 bp-nál kezdődik és 1 485 bp-nál ér véget Complement!
Deléciós mutagenezis a leolvasási keret sértése nélkül Ar1 oriV oriT oriV: szűk gazdaspecificitás Ar: antibiotikum rezisztencia Ar1 oriV oriT vad típus mutáns poláris hatás ?
DE! A két szakasznak nagyjából egyforma hosszúnak kell lennie, Hogy azonos legyen a rekombinációs valószínűség 500-1000 bp 500-1000 bp
A VEKTOR KIVÁLASZTÁSA • Szempontok: • Az adott feladathoz szabad-e, kell-e replikálódnia a vektornak a célsejtben • Olyan antibiotikum rezisztenciát hordozzon, mely antibiotikumra a sejt érzékeny • Milyen módon lehet bejuttatni a célsejtbe DNS-t
TSZE PROKARIÓTA EXPRESSZIÓS VEKTOR ELEMEI SZF Fúziós partner GS Pr -35 -10 SD kódoló szekvencia TT STOP kodon UAAU UGA UAG -10 -35 TTGACAN17TATAAT START kodon AUG GUG UUG 5’ UAAGGAGGN(3-11) AR ORI Pr: promóter TT: transzkripciós terminációs szignál, SZF: szabályozó fehérje,, TSZE: transzlációt szabályozó elemek, SD: Shine-Dalgarno szekvencia, AR: antibiotikum rezisztencia, ORI: replikációs origo GS: gazdasejt