Effets des facteurs NOD sur les défenses de Medicago truncatula

1. Effets des facteurs NOD sur les défenses de Medicago truncatula Une étude transcriptomique….

2. Objectifs du projet • Apporter des éléments de réponse quant au rôle des facteurs NOD dans la modulation des réactions de défense lors de la symbiose M.truncatula – S. melilotti • Directement lié à d'autres projets: • Identification de gènes de défense racinaires intervenant dans le processus de résistance de M.truncatula vis-à-vis de l’agent pathogène Ralstonia solanacearum (Fabienne) • Identification par le biais d’approche génétiques, d’interactions entre symbiose et défense chez M. truncatula (Marie) • Elements de signalisation croisés entre symbiose et défense chez M.truncatula (Montserrat) • Principaux objectifs en termes de délais: sujet DEA d’Olivier Loyeux…. Des résultats avant juin!

3. Mise aux points des conditions expérimentales adéquates d‘inoculation • Rappel: Utilisation du pathosystème racinaire Medicago truncatula- Ralstonia solanacearum afin d’identifier des voies de signalisation et/ou des effecteurs conduisant à des mécanismes de défense

4. Description • Mise aux points des conditions expérimentales adéquates d‘inoculation • Définitions des traitements • L’analyse des résultats

5. Mise aux points des conditions expérimentales adéquates d‘inoculation • Racines coupées, non coupées ou précoupées? -5 jours -4 jours INOCULATION plantules de 10 jours en conditions in vitro -3 jours -2 jours -1 jours 0 jours

6. Mise aux points des conditions expérimentales adéquates d‘inoculation • Racines coupées, non coupées ou précoupées? Colonisation racine principale Colonisation extrémités racines II Colonisation completeracines II

7. Mise aux points des conditions expérimentales adéquates d‘inoculation

8. Mise aux points des conditions expérimentales adéquates d‘inoculation • Racines coupées, non coupées ou précoupées?

9. Mise aux points des conditions expérimentales adéquates d‘inoculation • Racines coupées, non coupées ou précoupées? -5 jours -4 jours INOCULATION plantules de 10 jours -3 jours -2 jours -1 jours 0 jours

10. Mise aux points des conditions expérimentales adéquates d‘inoculation • Quantitativement….. A17 70% stade 3 30% stade 4 À 21 jours PI F83005.5 89% stade 1 11% stade 4

11. Mise aux points des conditions expérimentales adéquates d‘inoculation 70 60 50 40 30 20 10 0 0 1 2 3 4 5 6 7 70 60 50 40 30 20 10 0 1 • Age des plantules lors de l’inoculation (sur racines coupées 3PI)…. 7 jours INOCULATION 3 jours 6 jours 70 60 50 40 4 jours 30 20 10 0 1 2 3 4 5 6 7 8

12. Mise aux points des conditions expérimentales adéquates d‘inoculation • Interaction âge des plantules à l’inoculation - précoupure…. Résultats préliminaires à 14 jours… Résultats définitifs exploitable fin janvier

13. Mise aux points des conditions expérimentales adéquates d‘inoculation Résultats définitifs exploitables fin janvier • Age des plantules lors de l’inoculation • Laps de temps entre pré-coupure et inoculation • Détermination du « temps » auquel nos échantillons seront prélevés afin de maximiser nos chances d’observer une différence (A17 et F83005.5) en terme d’expression génique d’effecteurs défence entre

14. Définitions des traitements • Facteurs NOD -> GMI 1000 • Moment d’application facteurs NOD • Concentration facteurs NOD • Laps de temps entre traitement facteurs NOD et application GMI1000 • Phénotypage A17 et F83005.5 confrontés à GMI1000 en présence • de facteurs NOD

15. Analyses • Comparaison des profils d’expression (après soustraction des effets parasytes, membranes, génotypes, traitements) • A17 / GMI 1000 • F83005.5 / GMI1000 • Gènes impliqués dans la défense De M.truncatula vis à vis de GMI1000 • Comparaison des profils d’expression (après soustraction des effets parasytes, membranes, génotypes, traitements) • F83005.5 / GMI1000 / Facteurs NOD • F83005.5 / GMI1000 • Gènes impliqués dans la défense de M.truncatula vis à vis de GMI1000 modulés par les facteurs NOD