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Licence professionnelle de Génomique Année 2012 – 2013

Licence professionnelle de Génomique Année 2012 – 2013 . Transposons : des gènes anarchiques ?. Article publié par Dominique Anxolabéhère et al. Pour la science N°351 – Janvier 2007. Olivier SAULNIER. Un transposon ?.

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Licence professionnelle de Génomique Année 2012 – 2013

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  1. Licence professionnelle de Génomique Année 2012 – 2013 • Transposons : • des gènes anarchiques ? Article publié par Dominique Anxolabéhère et al. Pour la science N°351 – Janvier 2007 Olivier SAULNIER

  2. Un transposon ? • Élément transposable (« Jumping gene ») séquence d’ADN « mobile » capable de se déplacer d’une position à l’autre du génome. • Présent chez tous les organismes vivants. • ≈ 0,5 – 7kb • Code pour plusieurs protéines

  3. Barbara McClintock1902 – 1992 (USA) Cold Spring Harbor (1948) • Phénomèned’instabilitédans le génome • Éléments mobiles : Ds (dissociation) & Ac (activateur) Prix Nobel de médecine (1983)

  4. Classification • Classe I => rétrotransposons • => transposition via de l’ARN • => transcriptase-inverse • => mode réplicatif • => « copier / coller » • Classe II => transposons à ADN • => transposase • => mode non-réplicatif • => « couper / coller » • Classe ? => MITEs (Miniature Inverted-repeat Transposable Elements) • => « non-autonome » • => pas d’enzymes pour la transposition

  5. Répartition - 17% du génome d’Arabidopsisthaliana - 45 % du génome de Homo Sapiens - Plus de 50 % du génome de Zea maïs Transposons: The Jumping Genes, Leslie A. Pray et al., Nature, 2008. Sc: Saccharomyces cerevisiae; Sp: Schizosaccharomycespombe;Hs: Homo sapiens; Mm: Mus musculus; Os: Oryzasativa; Ce: Caenorhabditiselegans; Dm: Drosophilamelanogaster;….

  6. Mode d’action site cible transposase The Nature of Transposons Chapter 11 pp 300-315 transposon Invertedrepeat ADN pol Iligase flankingsequence The Nature of Transposons Chapter 11 pp 300-315

  7. Conséquences • gènes pertubés => région codante • => promoteur • => séquences régulatrices • => encombrement spatial • avantages sélectifs => domaine de fixation à l’ADN • (nouveaux facteurs de transcription) • => protéines « hétérologues » Chez la drosophile => insertion transposon copia dans le 2ème intron du gène white perturbe la transcription et provoque l’apparition d’yeux orange Chez la souris => insertion d'un rétrotransposonIAP dans un exon du gène Agouti. Il dérégule l'expression de la protéine ce qui conduit à des souris à poil jaune.

  8. Conclusion • provoque de nombreuses mutations (maladies génétiques mais le plus souvent silencieuses..) • responsable de l’augmentation de la taille des génomes • outils moléculaire : mutagénèse, vecteur de transfert de gènes • favorisation d’hétérochromatine par les transposons ? • héro ? Nombreux transposons aux niveaux des télomères

  9. Merci pour votre attention

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