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GRUPO DE PATÓLOGOS DEL NOROESTE REUNIÓN ACADÉMICA 2013 BIOLOGÍA MOLECULAR BÁSICA PARA EL PATÓLOGO. Luis Muñoz Fernández Centenario Hospital Miguel Hidalgo Biopath México Aguascalientes, Ags. López-Corella E. Patología 1991; 29: 65-66. EL CONOCIMIENTO DEL CÁNCER A LOS LARGO DEL TIEMPO.
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GRUPO DE PATÓLOGOS DEL NOROESTEREUNIÓN ACADÉMICA 2013BIOLOGÍA MOLECULAR BÁSICA PARA EL PATÓLOGO Luis Muñoz Fernández Centenario Hospital Miguel Hidalgo Biopath México Aguascalientes, Ags.
EL CONOCIMIENTO DEL CÁNCER A LOS LARGO DEL TIEMPO DeVita VT et al. Primer of the Molecular Biology of Cancer 2011: 4-5.
EL CONOCIMIENTO DEL CÁNCER A LOS LARGO DEL TIEMPO De Vita VT el al. Primer of the Molecular Biology of Cancer 2011: 4-5.
DIAGNÓSTICO MOLECULAR Blakey GL, Farkas DH. Basic Concepts of Molecular Pathology 2009: 62.
BIOMARCADORES • Es una característica que se mide objetivamente como un indicador de: • Un proceso biológico normal. • Una enfermedad. • Las respuestas farmacológicas a una intervención terapéutica. • Tipos: • Biomarcador pronóstico: evolución. • Biomarcador predictivo: sensibilidad a cierto tratamiento. • Biomarcador de monitorización: respuesta a un tratamiento. Jaffe CC. Arch Pathol Lab Med 2009; 133: 547-549.
BIOMARCADORES • Biomarcadores pronósticos: • La mayoría de los que detectamos en patología. • Un buen ejemplo son los índices mitósicos o de proliferación (PCNA, Ki 67). • Biomarcadores predictivos: • Her2-neu en cáncer de mama. • Mutación de KRAS en cáncer de colon. • Biomarcadores de monitorización: • Fluorodesoxiglucosa en tomografía por emisión de positrones (PET scan). Jaffe CC. Arch Pathol Lab Med 2009; 133: 547-549.
BIOMARCADORES PRONÓSTICOS EN NEOPLASIAS HEMATOLÓGICAS Bahler D. Molecular Pathology of Hematolymphoid Diseases 2010: 66.
FIJADORES USADOS EN PATOLOGÍA Hunt JL. Arch Pathol Lab Med 2008; 132: 251.
TÉCNICAS MOLECULARES EN TEJIDOS FIJADOS EN FORMOL Y EMBEBIDOS EN PARAFINA • Hibridación in situ fluorescente o cromógenica (FISH, CISH). • Reacción en cadena de la polimerasa (PCR). • Secuenciación del ADN. • Pruebas en ARN, como la PCR con transcripción reversa (RT-PCR). • Microarreglos para determinar la expresión génica. Dry, S et al. Am J Clin Pathol 2012; 137: 346-355.
DEGRADACIÓN DEL ADN EN TEJIDOS FIJADOS EN FORMOL Y EMBEBIDOS EN PARAFINA • Para los estudios moleculares, el tiempo de fijación en formol debe ser entre 6 y 24 horas. • El formol establece enlaces cruzados con el ADN, las histonas y otras proteínas, fraccionando las moléculas: • Este proceso prosigue en los bloques tisulares a lo largo de los años: • Después de 10 a 20 años, la degradación puede impedir la amplificación con PCR. Dry, S et al. Am J Clin Pathol 2012; 137: 346-355.
PROTOCOLOS DE DIAGNÓSTICO MOLECULAR Blakey GL, Farkas DH. Basic Concepts of Molecular Pathology 2009: 62.
EXTRACCIÓN DE LOS ÁCIDOS NUCLEICOS Hunt JL , Sanja D. Basic Concepts of Molecular Pathology 2009: 70.
FLUJO UNIDIRECCIONAL EN EL LABORATORIO DE PATOLOGÍA MOLECULAR Hunt JL. Arch Pathol Lab Med 2008, 132: 256. Blakey GL, Farkas DH. Basic Concepts of Molecular Pathology 2009: 67.
REACTIVOS DE LA PCR • Polimerasa termoestable: Taq polimerasa u otra: • Pfu, Pwo, Tgo, Tli, Tth. • Cebadores (primers). • Desoxinucleótidos. • Solución amortiguadora (buffer). • Magnesio. Dwight O. Basic Concepts of Molecular Pathology 2009: 77-78.
PCR Hunt JL. Arch Pathol Lab Med 2008 132: 254.
PCR: CICLOS TÉRMICOS Dwight O. Basic Concepts of Molecular Pathology 2009: 75.
DETECCIÓN Y ANÁLISIS DE LOS PRODUCTOS DE LA PCR (“AMPLICONES”) Blakey GL, Farkas DH. Basic Concepts of Molecular Pathology 2009: 62.
VARIEDADES DE PCR • Hot start: mayor especificidad. • Nested: mayor producción y especificidad. • Específica para metilación. • Multiplex: se amplifican varias regiones simultáneamente. • PCR con transcripción reversa (RT-PCR): amplificación de secuencias de ARN. Dwight O. Basic Concepts of Molecular Pathology 2009: 78-79.
PCR EN TIEMPO REAL Dwight O. Basic Concepts of Molecular Pathology 2009: 80.
PCR EN TIEMPO REAL Dwight O. Basic Concepts of Molecular Pathology 2009: 80.
MATRICES DE ADN (MICROARRAYS) Quackenbush J. N Engl J Med 2006, 354: 2463-2472.
MATRICES DE ADN (MICROARRAYS) http://www.columbia.edu/~bo8/undergraduate_research/projects/sahil_mehta_project/work.htm
APLICACIONES DE LAS MATRICES DE ADN Blakey GL, Farkas DH. Basic Concepts of Molecular Pathology 2009: 66.
PERFILES DE EXPRESIÓN GENÉTICA EN CANCER DE MAMA Lester SC. Pathologic Basis of Disease 2010.
ONCOTYPE PARA CÁNCER DE MAMA http://www.oncotypedx.com/en-US/Breast.aspx
CÁNCER COLORRECTAL: UNA ENFERMEDAD HETEROGÉNEA • Diferentes vías moleculares de la carcinogénesis: • Vía supresora convencional (60%): • APC/β-catenina/Wnt. • Vía de inestabilidad hereditaria de microsatélites (Lynch, 2 al 7%) : • MSH2, MLH1, MSH6, PSM2. • Vía de la mucosa aserrada (35%): • Silenciamiento epigenético (metilación de islas CpG). TGFβ y BAX. Shi Ch, Washington K. Am J Clin Pathol 2012, 137: 847-859.
TRATAMIENTO DEL CARCINOMA DE PULMÓN QUE NO ES DE CÉLULAS PEQUEÑAS (NSCLC) • La neoplasia maligna que se diagnostica con mayor frecuencia en el mundo. • Más del 50% de los pacientes están en etapa IV cuando se les hace el diagnóstico. • En el 10 al 15% de los casos de carcinoma que no es de células pequeñas (NSCLC) existen mutaciones del EGFR: gefitinib, erlotinib. • Rearreglos del gen ALK (gen de fusión EML4-ALK) en el 5% de los NSCLC: crizotinib. Aisner DL, Marshall CB. Am J Clin Pathol 2012, 138: 332-346.
Aisner DL, Marshall CB. Am J Clin Pathol 2012, 138: 332-346.
TRATAMIENTO DEL CARCINOMA DE PULMÓN QUE NO ES DE CÉLULAS PEQUEÑAS (NSCLC) • La mutación de KRAS es un predictor negativo de las mutaciones de EGFR y de los rearreglos de ALK. • La amplificación de MET se asocia a la resistencia al tratamiento con inhibidores de EGFR. Aisner DL, Marshall CB. Am J Clin Pathol 2012, 138: 332-346.