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Thierry de Meeûs Laboratoire de recherches et de coordination sur les Trypanosomoses,

Thierry de Meeûs Laboratoire de recherches et de coordination sur les Trypanosomoses, UMR177 IRD/CIRAD, TA A-17/G, Campus International de Baillarguet, 34398 Montpellier Cedex 5, France. Génétique et Evolution des Maladies Infectieuses (GEMI) UMR CNRS/IRD 2724, UR IRD 165

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Thierry de Meeûs Laboratoire de recherches et de coordination sur les Trypanosomoses,

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Presentation Transcript

  1. Thierry de Meeûs Laboratoire de recherches et de coordination sur les Trypanosomoses, UMR177 IRD/CIRAD, TA A-17/G, Campus International de Baillarguet, 34398 Montpellier Cedex 5, France. Génétique et Evolution des Maladies Infectieuses (GEMI) UMR CNRS/IRD 2724, UR IRD 165 E-mail: demeeus@mpl.ird.fr http://gemi.mpl.ird.fr/SiteSGASS/SiteTDM/EnseignMeeus.html

  2. Méthodes directes Méthodes indirectes

  3. CTCTCTCT AGAGAGAG CTCTCTCTCT AGAGAGAGAG + - TYPES DE MARQUEURS Microsatellites Primer1 Primer2 mRNA Primer1 AUGCAGCCAUAGGCG Primer2 PCR Enzymes Phe-Pro-Leu-Ileu-Val + - Electrophorèse Neutralité: une hypothèse assez forte

  4. f( ) = = p + f( ) = q f( ) = p² ; f( ) = 2pq ; f( ) = q² Proportions de Hardy-Weinberg

  5. Taenia solium Nasonia vitripenis Rh-Rh- Rh+Rh- Altérations des proportions de Hardy Weinberg Déficits en hétérozygotes Endogamies Sous dominance Effet Wahlund Homogamie Causes techniques Allèles nuls Dominance des allèles courts

  6. Anémie falciforme et Plasmodium falciparum Ixodes ricinus Schistosoma Altérations des proportions de Hardy Weinberg Excès d'hétérozygotes Superdominance Hétérogamie HLA Clonalité Candida albicans Trypanosoma brucei Biais de dispersion sexe spécifique Hétérosis

  7. FST FIT Estimations RAPPEL: Variance: s² = [1/n].Si[(xi-x)²] ; s² = [1/(n-1)].Si[(xi-x)²] Estimateurs f et θ de Weir & Cockerham FIS F IS l Les F-Statistics de Wright HObs=2p1(1-p1)-2p1(1-p1)FIS

  8. Structure d'une Population Taille des Unités de Reproduction Migration

  9. B. valaisiana B. garinii B. afzelii B. burgdorferi B. Spielmanii Génétique des populations d' Ixodes ricinus et borréliose de Lyme en Suisse

  10. 0.7 0.6 1 0.5 estimator) 0.4 0.75 0.3 is F ( pi's balanced pi's bell shaped pi's decreasing 0.5 f 0.2 pi's increasing pi's randomised 0.1 0.25 1 0 (partials) 0.9 0 IR8 IR25 IR27 IR32 IR39 All is 0.8 F -0.25 0.7 0.6 -0.5 is 0.5 F -0.75 0.4 0.3 -1 109 111 113 115 117 0.2 119 121 123 125 127 129 131 Allele size 0.1 0 111 113 115 117 119 121 123 125 127 129 131 Allele size Déficits en hétérozygotes

  11. B. valaisiana B. afzelii B. burgdorferi B. garinii Distribution sexe spécifique du polymorphisme Biais de dispersion sexe spécifique des tiques

  12. Détection des Borrelia dans les tiques Pour Borrelia burgdorferi P =0.012 ss 0.08 0.07 B. burgdorferi 0.06 0.05 0.04 Prévalence of 0.03 0.02 F M Sex of the tick

  13. Détection des borrélies dans les tiques Pour Borrelia afzelii Saines Infectées Saines Infectées

  14. Région d’étude Zone de transmission Biomphalaria glabrata mollusque d’eau douce hôte intermédiaire Emission massive de cercaires clonales Eclosion d’une larve aquatique: miracidium Reproduction asexuée Site de transmission (arrière mangrove) Rattus rattus (rat noir) infecté lors d’un "bain" Reproduction sexuée Œuf évacué avec les selles de l’hôte définitif Vers adultes (couple) dans la veine mésenthérique. La femelle est contenue dans le canal gynécophore du mâle Schistosoma mansoni et ses hôtes (rat et mollusque) en Guadeloupe

  15. Fst Fit Fis F is l Les F-Statistics de Wright et Clones

  16. C=1, Nm not small C=1, Nm small FST~0.5 Fst<<0.5 Fis Fis Fis Fis 0 0 0 0 -1 -1 -1 -1 Loci Loci Loci Loci C=[0.999-0.99], Nm small C=[0.99-0.95], Nm not small Fst>>0.5 Génétique des populations des diploïdes clonaux ou partiellement clonaux

  17. Clones structurés en nombreux dèmes Fst=-Fis/(1-Fis); Fit=0

  18. Candida albicans à Abidjan (Côte d’Ivoire) J0 42 Patients AIDS FPatient≈0.5 (P<0.001) 23 patients 19 patientes J15 FSex≈0.08 (P<0.02) Rechute de 13 patients Traitement anti-fungique Fis=-0.97 Fis=-0.66 FD0-D15≈0.2 (P<0.001) 14 loci enzymatiques

  19. Structuration de Candida albicans chez des patients HIV+ de Côte d'Ivoire

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