strokovni obisk učnih laboratorijev v Veliki Britaniji

1. strokovni obisk učnih laboratorijev v Veliki Britaniji Marko Dolinar, marec 2002 namen: • spoznati potek vaj iz tehnologije rDNA • videti opremljenost učnih laboratorijev • ugotoviti tematski koncept vaj • preveriti obseg pisnih gradiv za študente • spoznati način ocenjevanja praktičnega pouka obiska: • Univ. of Newcastle (R. Pain / R. Virden) • Univ. of Manchester (K. Elliott) praktični vaji: • Analiza izolatov HIV: ugotavljanje izvora infekcije (predmet Filogenija in evolucija) • Izolacija ssDNA vektorja M13; analiza PCR (predmet Genetsko inženirstvo)

2. University of Newcastle-upon-TyneDepartment of Biochemistry and Molecular Genetics študijske smeri: • biokemija • genetika • molekularna biologija • humana genetika • biokemija z imunologijo • biokemija z biotehnologijo vpisani študenti: • biokemija ~50 v 3 letnikih • genetika ~90 v 3 letnikih Molekularna biologija: 2. letnik, 30 kreditnih točk Genetsko inženirstvo: ni posebnega predmeta osnove predavajo pri predmetu Genetika v 1. letniku, več pa pri predmetu Molekularna biologija v 2. letniku (14 predavanj od 30)

3. University of Newcastle-upon-TyneDepartment of Biochemistry and Molecular Genetics V začetku vsakega semestra študenti dobijo brošuro z opisi predavanj, vsemi navodili za vaje in splošnimi informacijami. Poglavja v brošuri: predmetnik cilji študija po letnikih navodila in pravila- roki za oddajo pisnih gradiv- naslovnice za pisna poročila in eseje- navodila za pripravo poročil z vaj- kriteriji za ocenjevanje esejev študijski koledar študijsko gradivo po predmetih Ob vpisu v prvi letnik dobijo še: Študijski priročnik (pravila in navodila za vsa 3 leta študija)priročnik Študijske veščinebrošuro Informacije o laboratorijih in varnosti

4. University of Newcastle-upon-TyneDepartment of Biochemistry and Molecular Genetics biokemija -1. letnik - 6 dvojnih modulov: biokemija delovanje celice biološke molekule in celična biologija genetika mikrobiologija fiziologija ali farmakologija biokemija -2. letnik: molekularna biologija(nukl. kisline, genetsko inženirstvo, zgradba proteinov, laboratorijska in računalniška orodja) celična organizacija (proteini in encimi, razmeščanje proteinov, biološke membrane) bioenergetika in fotosinteza kontrolni mehanizmi v celici (30 t.) osnove imunologije ali sinteza in popravljanje DNA vsi: + veščine (10 t. v 2 semestrih): 1. letnik: informacijske tehnologije(e-mail, Word, internet, knjižnice) 2. letnik: biokemijsko računstvo, tabele in statistika, ustno poročanje, delo v skupini

5. University of Newcastle-upon-TyneDepartment of Biochemistry and Molecular Genetics biokemija -3. letnik: proteinsko inženirstvo (10 t.) združena biokemija (20 t.) raziskovalni projekt (30 t.) mehanizmi kataliznega delovanja encimov (10 t.) +5 izbirnih predmetov izmed: kontrolne poti v celici; (2002/3) biokemija bolezniinterakcije med proteini in DNAmolekularna biologija virusovimunsko prepoznavanjebiotehnologijarak in genska terapija ‘raziskovalni projekt’ ~ diplomsko delo skupaj formalno obremenitev, ki ustreza 30 delovnim dnem; običajno 8 tednov v laboratoriju ali po zahtevnosti ustrezno teoretično raziskovalno delo opravljajo večinoma v raziskovalnih laboratorijih na oddelku v februarju in marcu, pišejo med velikonočnimi počitnicami in takoj oddajo

6. University of Newcastle-upon-TyneDepartment of Biochemistry and Molecular Genetics Molekularna biologija (2. letnik): • teoretični del: 30 predavanj (posamezni predavatelj 1-10) • seminarji: 4 • problemska naloga z ustno predstavitvijo (skupine po 4, predstavitve po 15 minut, 5% končne ocene) • 2 testa za utrjevanje snovi (vsak 5% končne ocene) • vaje (6 x 6 ur, poročila skupaj 15% ocene)Seminarji, praktično delo in testi skupaj prispevajo 30% končne ocene iz predmeta. • Laboratorijske vaje:- ekstrakcija kromosomske DNA iz rastlin- analiza rekombinantnega plazmida- PCR- sekvenciranje DNA- transkripcijski faktorji in regulacija genov- bioinformatika • Problemska naloga: Iskanje novega senzorja za kovine pri modri algi Synechocystis na osnovi določenega nukleotidnega zaporedja genoma • Seminarji:- uvod v spletne vire za praktično delo- uvod v temo problemske naloge- diskusijski seminar v zvezi s problemsko nalogo- kloniranje

7. University of ManchesterSchool of Biological Sciences študijske smeri (20): • biokemija • genetika • molekularna biologija • humana genetika • biokemija z biotehnologijo, znanosti o življenju, medicinska biokemija, biomedicina • anatomija, biologija, celična biologija, mikrobiologija, nevrologija, farmakologija, fiziologija, botanika, zoologija,... vpisani študenti: • skupaj ~2000 v 3 letnikih Molekularna biologija: obvezni predmet 1. letnika za vse smeri (10 kred. točk) Genetsko inženirstvo: obvezni predmet v 2. letniku za 4 smeri, za biokemijo eden od izbirnih obveznih (10 kred. točk)

8. University of ManchesterSchool of Biological Sciences Ob vpisu v vsak letnik študenti dobijo brošuro s splošnimi informacijami. Za vsak predmet dobijo še brošuro z opisom predmeta in brošuro z navodili za praktično delo, seminarje, ipd. Poglavja v vpisni brošuri: • vpis • šolska uprava • cilji študija • vodje študijev in mentorji (z zemljevidom stavbe) • študentska pisarna • komisije, odbori in ocenjevanje učiteljev • pravila- prisotnost in delo - izpiti in ocenjevanje- postopki pri boleznih- varnost in zdravje- službe in nagrade- knjižnica- študentska združenja in pomoč študentomštudijski koledar • predmetnik po smereh • pogoji za vpis predmetov višjih letnikov • vsebina posameznih predmetov (po 1 stran)

9. University of ManchesterSchool of Biological Sciences biokemija -1. letnik : molekularna biologija genetika anorganska in fizikalna kemija organska kemija biokemija celica praktična biomatematika fizikalna kemija + izbirni predmeti (skupaj 4 izmed 10) + mentorski seminar: osnove računalništva in informacijskih tehnologij; pisanje esejev, reševanje problemov, diskusijske skupine, ustno poročanje, skupinsko delo praviloma 1 predmet = 10 kreditnih točk (100 ur študija) 1 letnik = 120 kreditnih točk(ustreza 30 tednom s po 5x8 h dela) 1 predmet = 24 predavanj po 50 min. + 5 vaj po 3 h povprečna obremenitev s predavanji: 10 h/teden povprečna obremenitev z vajami: do 9 h/teden 1 semester = 12 tednov; vaj ni 1. in 12. teden izpitna obdobja: zimski semester 3. in 4. teden januarjapoletni semester: zadnji 3 tedni v majupopravljalni termin: zadnji teden avgusta, 1. teden septembra

10. University of ManchesterSchool of Biological Sciences biokemija - 2. letnik : biosinteza, pretvorbe in kontrola metabolizma biofizikalna karakterizacija makromolekul membrane, transport in bioenergetika 2 od naslednjih: ohranjanje in mobilnost genovizražanje genovgenetsko inženirstvo + izbirni predmeti (skupaj 5 izmed 9 priporočenih) + mentorski seminar: pisanje esejev, reševanje problemov, diskusijske skupine, ustno poročanje, svetovanje o zaposlitvi, priprava življenjepisa biokemija - 3. letnik : 3 od naslednjih: zgradba in delovanje bioloških makromolekulznotrajcelično sortiranje proteinov in biogeneza organelcelično signaliziranjebioinformatika in zgradba/delovanje proteinovglikobiologijamolekularna biologija raka + izbirni predmeti (skupaj 3 izmed 17 priporočenih) + biokemijski praktikum (10 vaj) + dizertacija iz literature (3000-5000 besed; 10 kred. točk) + projektna naloga (30 dni; 7500 besed)

11. University of ManchesterSchool of Biological Sciences Molekularna biologija (1. letnik): • teoretični del: 24 predavanj (3 predavatelji) • vaje (4 x 6 ur, kolokvij 20% končne skupne ocene) - transformacija E. coli- fagna restrikcija pri E. coli- laktozni operon- restrikcijsko mapiranje plazmidov Izražanje genov (2. letnik): • teoretični del: 24 predavanj (2 predavatelja) • vaje (4 x 6 ur, kolokvij 20% končne skupne ocene) - laktozni operon- namestitev nukleosoma na evkariontski DNA- izolacija in analiza RNA (2 vaji) • Ohranjanje in mobilnost genov (2. letnik): • teoretični del: 24 predavanj (1 predavatelj) • vaje (4 x 6 ur, kolokvij 20% končne skupne ocene) - določanje biosintezne poti Trp pri S. typhimurium z uporabo mutant- testi reverzne mutacije in delecijsko mapiranje mutant His- pri S. typhimurium- transformacija Streptococcus gordonii za uvedbo rezistence na antibiotik in določanje genske povezanosti- prenos konjugativnih plazmidov in mobilizacija nekonjugativnih plazmidov pri E. coli

12. University of ManchesterSchool of Biological Sciences Genetsko inženirstvo (2. letnik): • teoretični del: 24 predavanj (2 predavatelja):- klonirni vektorji in življenjski cikli- PCR- priprava in presejanje knjižnic- mutageneza in vitro- kloniranje v glivah in rastlinah- genomski projekti- multigenske okvare- elektroforeza v utripajočem polju- kloniranje preko lokusov in identifikacija genov- prenos genov pri živalih- gensko ciljanje pri živalih- genska terapija • vaje: 4 x 5 ur, kolokvij 20% končne skupne ocene- mestno-specifična mutageneza- PCR- življenjski cikel faga M13- sekvenciranje DNA Vaje se delno prekrivajo po dnevih. 3. dan:izolacija ssDNA (M13) analiza PCR s prejšnje vaje (elektroforeza)teoretična naloga: načrtovanje začetnih oligonukleotidov za detekcijo genskih napakpred vajo: infekcija bakterij s fagom

13. Gradiva, ki sem jih prinesel: Newcastle: • Informacije o laboratorijih in varnosti • Brošura za 3. semester študija biokemije • kopije prosojnic Genetsko inženirstvo (1. let., Genetika) • navodila za vajo Newickova formula: distančne in diskretne metode (2. let., Filogenija in evolucija) Manchester: • vpisne brošure za 1., 2. in 3. letnik • skripta za predmet Ohranjanje in mobilnost genov • skripta za vaje iz Ohranjanja in mobilnosti genov • skripta za vaje iz Genetskega inženirstva • skripta za vaje iz Molekularne biologije • skripta za vaje iz Genskega izražanja

14. Opažanja in predlogi: Na voljo je samo po en izpitni rok pri vsakem predmetu z možnostjo popravljanja v jesenskem roku. Varnost je poudarjena v skriptah in v praksi, čeprav npr. zaščitna očala uporabljajo samo takrat, ko delajo z nevarnimi snovmi, ki lahko poškodujejo oči. Halje se zapenjajo s pritiskači in imajo elastično manšeto. V laboratorijih je ob umivalniku posoda z absorpcijskimi zrni za primer razlitja. Pipo odpiramo z nogo, ne z roko. Vsak laboratorij ima več izhodov. Vsa študijska gradiva so brezplačna. Intranet ima veliko podatkov, ki pomagajo k bolj učinkovitemu študiju.Računalniških delovnih mest za študente je proporcionalno mnogo več kot na FKKT. Vaje se ocenjujejo na osnovi poročil ALI kolokvija. Vsak predmet ima samo eno oceno (vaje + predavanja). Predmet je opravljen s 40% znanjem, za najvišjo oceno zadošča 70% znanje; kriteriji so vnaprej znani, med predmeti izenačeni in objavljeni. Čas med vajami, ko tečejo analize ali inkubacije, zapolnijo z reševanjem nalog; reagentov praviloma ne pripravljajo študenti. Pričakovana prisotnost študentov v predavalnici/vajalnici je 2 x 12 x 18 h = 430 h v enem letu (FKKT: do 750 h), študij je za 2 leti krajši. Vaje so manj obsežne in večinoma dobro delujejo kljub velikim skupinam študentov.