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Replicación de un cromosoma circular tomando la forma de . (b). (a). Inic de replicación en E. coli. DNA marcado con 15 N y 14 N separado por un gradiente de densidad. (a). (b). Esquema de la autoradiografía de una horquilla de replicación. Fragmentos de Okazaki. 3'.
E N D
Replicación de un cromosoma circular tomando la forma de (b) (a)
DNA marcado con 15N y 14N separado por un gradiente de densidad (a) (b)
Esquema de la autoradiografía de una horquilla de replicación
Fragmentos de Okazaki 3' Hebra conductora (Lider) 5' 5' 3' Dirección del movimiento de la horquilla de replicación 3' 5' Fragmentos de Okazaki 3' 5' Hebra rezagada (Lagging) 3' 5'
DNA polimerasas I II III pol A 1 103,000 Si aaaaa Si 16-20 aaa 3-200 pol B ≥ 4 88,000 Sí aaaaa No ~7 aaa ≥10,000 pol C ≥ 10 ~900,000 Síaaaaaaaaaa No 250-1000aaa ≥500,000 Comparación de las DNA pol de E. coli Gen estructural* Subunidades Mr Exonucleasa 3'-->5' (corrección de errores) Exonucleasa 5'-->3' Velocidad de polimerización (nucleótidos/s) Procesividad (nucleótidos añadidos antes de disociarse
Actividades de la DNA pol I Dna polimerasa I El extremo 3'OH mal colocado bloquea la elongación Sitio polimerasa Sitio exonucleasa 3'-->5' Eliminación del nucleótido mal apareado C*, forma tautomérica que se aparea con A Reinicio de la duplicación C* --> C => Malapareamiento C : A
Estructura de oriC de E. coli Ordenamiento en tándem de tres secuencias de 13 pb Sitios de fijación de la proteína DnaA cuatro secuencias de 9 pares de bases Secuencia consenso TTATCCACA Secuencia consenso GATCCTNTTNTTT
Complejo de Iniciación Molde superenrollado oriC Cuatro repeticiones de 9 pb Tres repeticiones de 13 pb DnaA Complejo Inicial (a) HU + Complejo abierto (b) DnaB DnaC Complejo precebador (c) Cebado y replicación
Síntesis de la hebra conductora Helicasas DNA pol III Hebra conductora Topoisomerasa II (DNA girasa) SSB
Síntesis de los fragmentos de Okazaki Topoisomerasa II (DNA girasa) (a) Hebra rezagada Helicasas Primasa Primosoma SSB RNA cebador del fragmento de Okazaki previo RNA cebador (b) DNA pol III (c)
Eliminiación de los cebadores de RNA RNA cebador DNA pol I RNA cebador Mella DNA pol I dNTP rNMP DNA ligasa DNA pol I DNA ligasa AMP + PPi (ó NMN) DNA ligasa
Acoplamiento en la síntesis de las hebras conductora y rezagada Dímero de DNA pol III Hebra conductora 5' Helicasas 3' Topoisomerasa II (DNA girasa) 3' Promosoma 5' RNA cebador Hebra rezagada