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RENCONTRES DES 18 et 19 MAI 2011 ANGERS Institut de Cancérologie de l'Ouest Paul Papin. Groupe de Travail CDISC CDISC: CDASH ou SDTM ?....... Ou autre chose? Brice DUBOIS CTD du Cancéropôle Nord Ouest Avec le concours de :
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RENCONTRES DES 18 et 19 MAI 2011 ANGERS Institut de Cancérologie de l'Ouest Paul Papin Groupe de Travail CDISC CDISC: CDASH ou SDTM ?....... Ou autre chose? Brice DUBOIS CTD du Cancéropôle Nord Ouest Avec le concours de : Guillaume DANTON ; Valentin HARTER ; Lucie JOUIE ; Lilian LABORDE ; Florian LARRAS ; Marina PULIDO ; Anne-Lise SEPTANS Le 19 mai 2011
Présentation pour les nouveaux /rappels Réflexions et essais de mise en place chez les membres d’acaDM, principales difficultés Aspects techniques, outils informatiques et logiciels Exemples Et la cancérologie? Communication, personnels impactés, facilité? Conclusion Sommaire 2
Présentation /rappels Essais Cliniques, FDA, AMM… 3
Présentation /rappels • Est-ce vraiment la peine de rappeler l’utilité d’un standard? • Documentation facilitée • Migration des bases d’un CDMS/SGBD à un autre • Homogénéité d’architecture d’une étude à l’autre • Homogénéité d’architecture d’un DM à l’autre, • au cours du temps (passage de relais) • à un instant t (entre collègues) • Merge / non correspondance de bases facilité (croisements, méta-analyses) 4
Présentation /rappels http://www.cdisc.org/standards 5
Présentation /rappels D’après: Bron W. KISLER ,« Standard Controlled terminology across the Clinical Trail Continuum » ; 2010 6
Présentation /rappels http://www.cdisc.org/sdtm D’après: Bron W. KISLER ,« Standard Controlled terminology across the Clinical Trail Continuum » ; 2010 7
Réflexions et essais de mise en place chez les membres d’acaDM • Depuis 2009, plusieurs présentations dans le cadre du Groupe (disponibles sur le site du Groupe). • Contacts avec le GUF CDISC… • Septembre 2009: présentation de CDISC à notre groupe par leur président • 2010: HEGP • Février 2011: Chilly Mazarin • Juin 2011: Genève • Groupe de Travail d’acaDM • Groupe de Travail de l’Asso DMB • Aujourd’hui, tout le monde en parle, mais qui pratique? 8
Réflexions et essais de mise en place chez les membres d’acaDM • Groupe de Travail d’acaDM: • On connaît le principe, • On connaît les Domaines, • On connaît quelques variables (SUBJID…), • Certains on exploré le SDTM, d’autres le CDASH, d’autres encore la Proc CDISC de SAS… • Et c’est déjà mieux que rien! 9
Réflexions et essais de mise en place chez les membres d’acaDM, principales difficultés • Groupe de Travail d’acaDM : Quels sont les freins? • Manque de temps? • Manque de motivation? (encouragements de la hiérarchie, des promoteurs et des autres catégories professionnelles? Pas envie de changer nos habitudes?) • Difficultés à collaborer? • …peut-être… 10
Réflexions et essais de mise en place chez les membres d’acaDM • Groupe de Travail d’acaDM : Quels sont les freins? • Difficulté d’appréhension des documents (langue Anglaise, volume des informations, terminologie utilisée…) • Difficultés d’application face au manque d’harmonisation (apparent) des documents entre eux… • …certainement! 11
Réflexions et essais de mise en place chez les membres d’acaDM • Principales difficultés: • Cette présentation aurait dû s’appeler « CDISC: CDASH ou SDTM? » • Mais en fait…nous l’avons déjà vu… ou plutôt aperçu. 12
Réflexions et essais de mise en place chez les membres d’acaDM D’après: Guillaume Danton et Lucie Jouie ,« Domaine EX » ; réunion DMCLCC 08/12/2010 13
Réflexions et essais de mise en place chez les membres d’Ac@DM Ce souci se retrouve naturellement dans toutes les tables… Devons-nous alors jongler avec les deux documents? D’après: Marina Pulido et Brice Dubois ,« Domaine CM » ; document de travail 14
Réflexions et essais de mise en place chez les membres d’Ac@DM • Les « Controlled terminology »… Changement de nos habitudes? • ISO, CIM , ICH, snowmed…codes « maison »? • http://standards.iso.org/ittf/licence.html • http://www.cdisc.org/terminology 15
Réflexions et essais de mise en place chez les membres d’Ac@DM • Les « Controlled terminology »… Changement de nos habitudes? 16
Aspects techniques, outils informatiques et logiciels • Nécessité d’outils de transformation de variables entre l’acquisition et la gestion des données et leur transfert? • Proc CDISC de SAS (Marina, Valentin) • Validation ODM, Define.xml? (Guillaume) • http://www.opencdisc.org/ 17
Aspects techniques, outils informatiques et logiciels • Logiciels CDISC compliants?, argument commercial ou vérité? (Guillaume, Valentin) • http://edcmarket.appspot.com/ 18
Exemple(s) • Des volontaires ? 19
Et la cancérologie? • SENDIG V3.0 Draft du 17/12/2010 • (pour études vétérinaires et pré-cliniques) • Domaines intéressants? • Death Diagnosis –DD • Food and Water Consumption –FW • Palpable Masses –PM • Tumor Findings -TF 20
Et la cancérologie? • Oncology Disease-specific Therapeutic Area Supplement to the Study Data Tabulation Model Implementation Guide.(pour les études cliniques sur l’être humain). (Draft du 30/01/2011, soumis à commentaires) • Domaines: • Tumor Identification –TU • Tumor Results –TR • Response -RS 21
Et la cancérologie? Super!, enfin! Quoique… Noms de variables pas compatibles entre TU (SDTM Onco) et TF (SEND)…. Exemples: Localisation anatomique de la tumeur: TULOC et TFSPLOC Latéralité de la tumeur: TULAT et TFSPCLOC 22
Communication, personnels impactés, facilité? On est tenté de rejoindre le CDISC…. Voilà ce que cela donne…. http://www.cdisc.org/stuff/contentmgr/files/0/ff2953ea8dbc8e81080f0e44ba6714c7/misc/membership_rates_2011.pdf CDISC Interchange EUROPE 11 au 15/04/2011 Bruxelles ; 16 au 20/04/2012 Stockholm….. Volunteer for CDISC? 23
Communication, personnels impactés, facilité? On est tenté de rejoindre le GUF CDISC…. Existence d’un groupe sur LinkedIn Qui va à Genève en juin? (14/06/2011, locaux de Business Decisions Life Sciences) 24
Communication, personnels impactés, facilité? Et les autres catégories professionnelles impactées ? Investigateurs, Moniteurs et chefs de projet ? (Listings…) Personnes en charge de l’analyse ? Biostatisticiens (Cf: Boher J.-m. , J stats CLCC, Nice 2009) 25
Communication, personnels impactés, facilité? Faut-il pour autant baisser les bras ? Non! Patience ! 26
Conclusion Nous sommes désormais nombreux à faire du « CDISC Like »… en recherchant un « bon compromis »…. MAIS, il serait bon qu’on s’entende sur un compromis! Nécessité de travailler ensemble… motivation? freins? 27