410 likes | 626 Views
Komplexní nemoci-příklady. NTP 1. 12. 2009. Zdraví čeští dobrovolníci středního věku (41-50 let) Polymorfismus -596 A/G v genu pro IL-6 Srdeční frekvence. Pg=0,006 Pa=0,01. Genotypy AG+GG uvedeného polymorfismu jsou častější u jedinců
E N D
Komplexní nemoci-příklady NTP 1. 12. 2009
Zdraví čeští dobrovolníci středního věku (41-50 let)Polymorfismus -596 A/G v genu pro IL-6Srdeční frekvence Pg=0,006 Pa=0,01 Genotypy AG+GG uvedeného polymorfismu jsou častější u jedinců s vyšší srdeční frekvencí (OR=4,27, 95% KI 1,66-10,98, P=0,0009).
Zdraví čeští dobrovolníci středního věku (41-50 let)Polymorfismus -3A/-4A v genu pro endotelin-1 (EDN1) Kouření Pg=0,003 Pa=0,003 [%] Genotypy 3A3A a 3A4A jsou častější u zdravých mužů kuřáků oproti mužům nekuřákům (OR = 7,69, 95% KI 1,67-35,38, P=0,002).
Chronické srdeční selháníAsociovaný genotyp 8002 G/A a -3A/-4A EDN-1Big endotelin Asociovaný genotyp AG3A4A nese 5x vyšší OR pro chronické srdeční selhání ve skupině s nízkou hladinou big endotelinu oproti skupině pacientů s vysokou hladinou: OR = 5,38; 95% KI = 1,75-16,58; P= 0,005
Chronické srdeční selháníDilatační kardiomyopatie (DCM), plicní městnání (PCG) 3´TACE Pg=0,02 Pa=0,0007 Genotyp MM nese 8x vyšší OR pro DCM s PCG=2 oproti DCM s PCG=1: OR=7,81, 95% KI = 1,45-42,17, P=0,02
Chronické srdeční selháníPolymorfismus RXR 39526 A/AAKrevní skupiny ABO Pg=0,006 Pa=0,002 Alela AA přináší 5x vyšší OR pro pacienty s CHF a krevní skupinou nonA (B+AB+O):OR=5,16; 95%KI 1,72-15,50;P=0,0009
Chronické srdeční selháníPolymorfismus -790T/G v genu pro MMP-2Celkový cholesterol Pg=0,03 Pa=0,01 Genotypy TG + GG přinášejí 3,59x vyšší OR pro muže s CHF a vyšší hladinou celkového cholesterolu: OR=3,59; 95% KI 1,30-9,93; P=0,009
Chronické srdeční selháníPolymorfismus -735C/T v genu pro MMP-2HypertenzeCelkový cholesterol Pg=0,01 Pa=0,171 Genotyp CT přináší 7,28 x vyšší OR pro muže s CHF, normotenzí a vyšší hladinou celkového cholesterolu: OR=7,28; 95% KI 1,51-35,03; P=0,006
Systém renin-angiotensin. RPR, renin/prorenin receptor; Mas, mas oncogene, receptor for Ang 1–7; AT2R, angiotensin type 2 receptorAT1R, angiotensin type 1 receptor, IRAP, insulin-regulated aminopeptidase; Ang IV receptor AMPA, aminopeptidase A; AMPM, aminopeptidase M; ACE, angiotensin-converting enzyme; ACE2, angiotensin-converting enzyme 2; NEP, neutral endopeptidase.
Proreninová interakce s renin/proreninovým receptorem receptor (RPR, Nguyen 2007 )
Patofyziologické souvislosti mezi genetickou variabilitou v ATG • Reakce akutní fáze a ateroskleróza? • Reakce akutní fáze a rakovina? • Reakce akutní fáze a autoimunita?
Frekvence 7 haplotypových skupin v genu pro ATG definovaných 19 polymorfismy Fejerman L et al., 2004
Párové dysekvilibrium (D ) pro angiotenzinogen. Rozsah D 0,01 to 1,00, od tvavomodré po červenou. Horizontální a vertikální osy vyjadřují fyzikální vzdálenosti mezi markery. Fejerman L et al., 2004
„Haplogroup tree“ pro gen pro angiotenzinogen. Každý kruh reprezentuje haploskupinu. N je počet chromosomů v každé skupině a velikost kruhu reflektuje velikost N. Délka ramen je proporcionální počtu mutací(z 19 SNP vybraných pro definici haplotypových skupin), které oddělují haplotypové skupiny. Hvězdičky jsou mutace. Černé hvězdičky pro totožné nukleotidy se šimpanzy. Fejerman L et al., 2004
Haplotypy pro AGT, založené na 21 SNP a šimpanzí sekvenci. Velikost kruhů odráží frekvence haplotypů u Kaukaziánů (A) a Japonců (B). Am J Hum Genet. 2002 January; 70(1): 108–123. Published online 2001 November 30.
Struktura genu pro AGT: a G-1074T, b C-532T, c G-217A, d A-20C, e A-6G, f C68T, g C3889T (T174M), h C4072T (T235M).
Angiotensinogen a nemoci kardiovaskulárníM235T ATG Pg = 0,06
Angiotensinogen a nemoci kardiovaskulární ATG-6A/G Pg=0,001 Pg=0,07
Příklady asociačních studií:Haplotypy- -6A/G a M235T ATG OR=7,15, Pcorr=0,00001, ST =99%-98,5%. OR=5,75, Pcorr=0,01, ST =95%-83%.
Angiotensinogen a nemoci kardiovaskulární Pacienti s CHSS (ICHS) vs. pacienti s CAD (3K)Haplotypy ATG (-6A/G + M235T) Vyšší frekvence výskytu GT haplotypu u pacientů s CHSS pro ICHS OR = 6,35; Pcorr. = 0,0006, PT- 95%
Angiotensinogen a nemoci kardiovaskulární Pacienti s CHSS (DKM) vs. pacienti s CAD (3K)Haplotypy ATG (-6A/G + M235T) Vyšší frekvence výskytu GT haplotypu u pacientů s CHSS pro DKM OR = 7,86; Pcorr = 0,0001 PT= 98%
Angiotensinogen a nemoci kardiovaskulární Pacienti s CHSS vs. kontrolyDvojgenotypATG (-6A/G a M235T ATG OR=2,63 (95% konfidenční interval 1,39-4,95), P=0,002, Pcorr=0,02
Angiotensinogen a nemoci kardiovaskulárníPacienti s CHSS vs. kontroly-ženyDvojgenotyp ATG (-6A/G a M235T ATG) OR=15,5 (95% konfidenční interval 1,86-129,42), P=0,002, Pcorr=0,008
Angiotensinogen a nemoci kardiovaskulární Pacienti s CHSS vs. pacienti s CAD (3K)Haplotypy ATG (-6A/G a M235T ATG) OR=7,15, Pcorr=0,00001, PT =99%-98,5%. OR=0,17, Pcorr=0,01, PT =95%-83%.
Angiotensinogen a nemoci kardiovaskulární Hypertonici vs. kontrolyAlela A (-6A/G), alela M (M235T) ATG OR pro obézní hypertoniky =1,95, Pcorr=0,02 OR pro obézní hypertoniky =3,05, Pcorr=0,0001
Angiotensinogen a sclerosis multiplex Pacienti se sclerosou multiplex vs. kontroly-ženyDvojgenotypATG (-6A/G a M235T ATG) OR=17,65 (95% konfidenční interval 2,31-134,71; P=0.00009, Pcorr=0.0006)
Angiotensinogen a sclerosis multiplex Pacienti se sclerosou multiplex vs. kontroly-ženyDvojgenotypATG (-6A/G a M235T ATG) OR=4,67 (95% konfidenční interval 1,31-16,63; P=0,008, Pcorr=0,04
Angiotensinogen a sclerosis multiplex Pacienti se sclerosou multiplex vs. kontroly-ženyDvojgenotypATG (-6A/G a M235T ATG) OR=0,28 (95% konfidenční interval 0,13-0,61, P=0,0008, Pcorr=0,005
(John BJ, 2006) Patofyziologické mechanismy spojující obezitu a rakovinu střev
Pacienti s kolorektální karcinomem vs. kontroly-mužiDvojgenotyp ATG (-6A/G a M235T ATG) OR pro MTAG=3,82 (2,09-6,96) P=0,0002, Pcorr=0,002 OR pro MTGG=0,24 (0,08-0,75) P=0,007, Pcorr=0,05
Farmakogenetika a vývoj léků • Nutnost přesné diagnózy (k fenotypicky podobným stavům mohou vést různé patobiochemické mechanismy). • Individuální odpověď jedince na terapii může záležet na genech, vstupujících do interakce s metabolismem léku nebo jeho působením. • Polovina všech dosud používaných léků je metabolizována enzymy P450.
Model terapie hypertenze (podle Lindpaintnera, březen 2003) A=fyziologický stav: tři molekulární mechanismy (M1, M2, M3) se podílejí na determinaci znaku (TK), B=hypertenze D1: selhání M1 (příčina/účast) C=hypertenze D1: kauzální terapie T1 (cílená na M1), D= hypertenze D3: selhání M3 (příčina účast), E=hypertenze D3, léčení T1: terapie není kauzální, F=hypertenze D1, paliativní terapie T2, cílená na M2, G=hypertenze D1, terapie T2, refrakterní varianta na T2 v M2, H= fyziologický stav: odlišný podíl M1 a M2 na normálním znaku, I = varianta hypertenze D1: selhání M1 J =varianta hypertenze D1: terapie T2
Farmakologická léčba-241 pacientů s chronickým srdečním selháním
Detekce genotypů inzerčně delečního polymorfismu v genu pro angiotenzin konvertující enzym (polymorfismus I/D ACE). PCR na horizontální elektroforéze ID DD II
Farmakogenetické rozdíly v dávkování beta blokátorů- genotyp I/D ACE Pg=0,005, Pa=0,002
Farmakogenetické aspekty u pacientů s CHSS –polymorfismus I/D ACE OR pro BB u II = 2,74, P=0.004 OR pro D u II = 7,76, P=0,01 OR pro Asp u II = 0,49, P=0,02
Farmakogenetické rozdíly v dávkování beta blokátorů a ACEI-polymorfismus I/D ACE OR pro II u pacientů s nižší než poloviční dávkou BB a/nebo ACEI je 2,84, P=0,002 Pg=0,006, Pa=0,009