310 likes | 747 Views
Inovatyvūs mokymosi metodai ir naujausios technologijos gamtos mokslų bakalaurų rengimui ESF2004/2.4.0-K01-160. Molekulių atpažinimas. ir kokia iš to nauda. 2005 lapkričio 23 d. Valdas Laurinavičius. valdasL@bchi.lt. Atpažinimo proceso dalyviai. Fermentai. Antikūnai. Receptoriai.
E N D
Inovatyvūs mokymosi metodai ir naujausios technologijos gamtos mokslų bakalaurų rengimui ESF2004/2.4.0-K01-160 Molekulių atpažinimas ir kokia iš to nauda 2005 lapkričio 23 d.
Valdas Laurinavičius valdasL@bchi.lt
Atpažinimo proceso dalyviai Fermentai Antikūnai Receptoriai Nukleorūgštys
Biocheminis atpažinimas Geometrinė forma + Tarmolekulinės sąveikos
Tarpmolekulinės sąveikos Tarpmolekulinės sąveikos, yra sąveikos tarp krūvių, kuriuos turi arba įgyja duota molekulė.
Joninėsąveika Sąveika: jonas-jonas 4-30 kJ/mol 1/r
Tarpmolekulinės sąveikos energija (U) gali būti išreikšta priklausomybe: U - energija, kurią reikia sunaudoti norint išskirti krūvininkus nuo atstumo tarp jų r iki begalybės - aplinkos dielektrinė skvarba • - vandens aplinkai apie 80; • - higrofobinei baltymo daliai apie 1÷10.
1/r2 1-10 kJ/mol Dipolinė sąveika Dipoliai yra pastovūs ir indukuojami. Dipolio - jono sąveika
1/r3 1-3 kJ/mol Dipolio – dipolio sąveika
Traukos jėgos (1/r6) Stūmos jėgos (1/r12) Van der Valso sąveika
Stekingas (aromatini ų sistemų orbitalių sąveika) (- sąveika, hipsochrominis efektas) Iki 25 kJ/mol
Vandenilinis ryšys Iki 25 kJ/mol
Ryšio energija Cu+2 kompleksų su aminorūgštimis siekia 23-24 kJ/mol. Tokių kompleksų disociacijos konstantos (K): 103 – 106 Fe+2, 108 – 1012 Fe+3, 104 – 1010 Zn+2 jonams. Koordinacinė sąveika
Hidrofobinė sąveika 8-12 kJ/mol (dviems benzeno radikalams)
FERMENTAI • Atpažįsta savo substratą ir jį suriša aktyviame centre • Katalizuoja surišto substrato cheminį virsmą • Baltymas, kurio M=100 000 Da, • apie 900 aminorūgščių; • Apie: • 4500 C atomų, • 6500 H atomų, • 1100 N atomų, • 1300 O atomų.
Kokia iš to nauda? Gamtos pažinimas Matematinis biologinių procesų modeliavimas Analitinių uždavinių sprendimas Biojutikliai Gamyba Bioelektrosintezė
Analitė Atpažinimas ? Signalas Informacija
Problemos Struktūriniai izomerai Selektyvumas Jautrumas 10-9 – 10-14 mol/L Atsako laikas Realiame laike
Projektas Inovatyvūs mokymo(si) metodai ir naujausios technologijos gamtos mokslų bakalaurų rengimui Projektą finansuoja Europos Socialinis Fondas Projekto vykdytojai Vytauto Didžiojo Universitetas Lietuvos Miškų Institutas