410 likes | 543 Views
The Complex Nature. Mogens Høgh Jensen, Niels Bohr Institute. Livsvigtig cellekommunikation. 1. Komplekse Systemer: Startede i 80’erne: Helt nye metoder i fysikken: Kaos, fraktaler biofysiske systemer, proteiner, celler, osv. 25. nov 2011, NBI Temadag
E N D
Niels Bohr Instutite The Complex Nature Mogens Høgh Jensen, Niels Bohr Institute
Livsvigtig cellekommunikation. 1. Komplekse Systemer: Startede i 80’erne: Helt nye metoder i fysikken: Kaos, fraktaler biofysiske systemer, proteiner, celler, osv. 25. nov 2011, NBI Temadag MogensHøgh Jensen
2. Kaos, fraktaler og komplekse systemer: Sandbunke modeller: Paradigme ‘lavine’ model. 3. Kommunikation inde i en celle:protein-netværk. • DNA skade: Protein-netværket aktiveres. • Proteiner og gener kommunikerer: Skaden repareres? • Ellers: Celle-død eller varig DNA skade.
Niels Bohr Institutet ! Fysikkens Mekka .. Kaos og biofysik ? Genetik og proteiner !
Komplekse Systemer:Strange Attractors Lorenz attractor Ikke-periodisk bevægelse, stor afhængighed af begyndelses-betingerlserne
Norges kyst er en fraktal !
Viskøse fingre: Vigtig for olieudvinding. Vand i olie Blæk på papir Fraktaler er skyld i oliekriser!
Fraktal struktur Self-similær på alle skalaer !
Bakterier kan vokse som fraktaler Hvordanvekselvirkerbaterier med fager ?
Dynamik i biologiske systemer Laviner har større sandsynlighed en vi troede ! Laviner !! Ikke Gaussiske teorier. Paradigme model: Per Bak’s sandbunke
Proteiner i Gær ! Også ’fraktal’ strukturer
Celle-skade N. Geva-Zatorsky, Mol. Sys. Biol. 2:2006.0033 (2006)
‘Direkte’ observationer af oscillationer i celler-kerner NFkB: Det ‘vigtigste’ protein til at regulere betændelse
3/1 2/1 1/2 1/1 1/3 Square external TNF wave
Where tongues overlap: Controlled Chaos Specific predictions for external cytokine waves or periodic DNA damage (radiation)
Complementarity between rational and irrational numbers ! External amplitude External frequency
Strange attractor of periodically ‘forced’ NF-κB system ω=1 (2-3 hour period)
Somitter i embryoer
Biologiskemotiver: Repressilator: oscillations
Coupled Repressilators: A Repressor-Lattice Repressing genes/proteins: in a cell or between cells ! ‘Natural’ phases: No frustration !
Bi-direktionelle vekselvirkninger: Ingen oscillationer. Mutationer !